概括
基因 29945
象征 ANAPC4
同义词 APC4
描述 后期促进复合物亚基4
参考 MIM:606947|HGNC:HGNC:19990|Ensembl:ENSG00000053900|HPRD:09505|Vega:Otthumg0000000097753
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P15.2
Pascal P值 0.049
Sherlock P值 9.711E-4
胎儿β 0.426
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2745349 CHR6 127419833 ANAPC4 29945 0.08 反式
RS146672135 4 25326858 ANAPC4 ENSG0000000053900.6 3.06694E-6 0.05 -51977 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ANAPC1 APC1 |MCPR |TSG24 后期促进复合体亚基1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共纯化
重构的复合物
Biogrid 11076961|12956947
ANAPC10 APC10 |DKFZP564L0562 |DOC1 后期促进复合物亚基10 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12956947
ANAPC2 APC2 |RP11-350O14.5 后期促进复合体亚基2 重构的复合物 Biogrid 12956947
ANAPC5 APC5 后期促进复合物亚基5 - HPRD,Biogrid 10922056
ANAPC7 APC7 后期促进复合物亚基7 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12956947
APC2 APCL 腺瘤性息肉病2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12956947
CDC16 APC6 细胞分裂周期16同源物(S. cerevisiae) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12956947
CDC23 APC8 细胞分裂周期23同源物(S. cerevisiae) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12956947
CDC27 APC3 |cdc27hs |D0S1430E |D17S978E |hnuc 细胞分裂周期27同源物(S. cerevisiae) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12956947
CDH1 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) 重构的复合物 Biogrid 12956947
FZR1 CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 Fizzy/Cell Disecom Cyper 20相关1(果蝇) 重构的复合物 Biogrid 12956947


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg细胞周期 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抑制有丝分裂主轴检查点成分的APC C的蛋白水解活性 24 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期检查点 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的细胞周期蛋白B的降解 26 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome从APC C CDC20转换为后期的APC C CDH1 22 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC C的反应组磷酸化 23 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC CDC20介导的NEK2A降解 28 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAESCH后期促进复合物 12 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因