基因页:ANAPC4
概括?
基因 | 29945 |
象征 | ANAPC4 |
同义词 | APC4 |
描述 | 后期促进复合物亚基4 |
参考 | MIM:606947|HGNC:HGNC:19990|Ensembl:ENSG00000053900|HPRD:09505|Vega:Otthumg0000000097753 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P15.2 |
Pascal P值 | 0.049 |
Sherlock P值 | 9.711E-4 |
胎儿β | 0.426 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2745349 | CHR6 | 127419833 | ANAPC4 | 29945 | 0.08 | 反式 | ||
RS146672135 | 4 | 25326858 | ANAPC4 | ENSG0000000053900.6 | 3.06694E-6 | 0.05 | -51977 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ANAPC4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ANAPC1 | APC1 |MCPR |TSG24 | 后期促进复合体亚基1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 11076961|12956947 |
ANAPC10 | APC10 |DKFZP564L0562 |DOC1 | 后期促进复合物亚基10 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
ANAPC2 | APC2 |RP11-350O14.5 | 后期促进复合体亚基2 | 重构的复合物 | Biogrid | 12956947 |
ANAPC5 | APC5 | 后期促进复合物亚基5 | - | HPRD,Biogrid | 10922056 |
ANAPC7 | APC7 | 后期促进复合物亚基7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12956947 |
APC2 | APCL | 腺瘤性息肉病2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
CDC16 | APC6 | 细胞分裂周期16同源物(S. cerevisiae) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
CDC23 | APC8 | 细胞分裂周期23同源物(S. cerevisiae) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
CDC27 | APC3 |cdc27hs |D0S1430E |D17S978E |hnuc | 细胞分裂周期27同源物(S. cerevisiae) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) | 重构的复合物 | Biogrid | 12956947 |
FZR1 | CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 | Fizzy/Cell Disecom Cyper 20相关1(果蝇) | 重构的复合物 | Biogrid | 12956947 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抑制有丝分裂主轴检查点成分的APC C的蛋白水解活性 | 24 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDC20介导的细胞周期蛋白B的降解 | 26 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome从APC C CDC20转换为后期的APC C CDH1 | 22 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC C的反应组磷酸化 | 23 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC CDC20介导的NEK2A降解 | 28 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WAESCH后期促进复合物 | 12 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |