基因页:Sertad1
概括?
基因 | 29950 |
象征 | Sertad1 |
同义词 | SEI1 | Trip-BR1 |
描述 | 包含1的serta域 |
参考 | HGNC:HGNC:17932|HPRD:15326| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19Q13.1-Q13.2 |
Pascal P值 | 0.564 |
Sherlock P值 | 0.109 |
胎儿β | -0.197 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25060020 | 19 | 40932140 | Sertad1 | -0.021 | 0.96 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12030788 | CHR1 | 66768128 | Sertad1 | 29950 | 0.09 | 反式 | ||
RS6666937 | CHR1 | 170286842 | Sertad1 | 29950 | 0.09 | 反式 | ||
RS11127467 | CHR2 | 12993 | Sertad1 | 29950 | 0 | 反式 | ||
RS16827037 | CHR3 | 117203284 | Sertad1 | 29950 | 3.733E-4 | 反式 | ||
RS614566 | CHR3 | 182847389 | Sertad1 | 29950 | 0.17 | 反式 | ||
RS7631640 | CHR3 | 182883407 | Sertad1 | 29950 | 0.16 | 反式 | ||
RS1009606 | CHR6 | 5726368 | Sertad1 | 29950 | 0.08 | 反式 | ||
RS3888778 | CHR6 | 30529621 | Sertad1 | 29950 | 0.06 | 反式 | ||
RS2239516 | CHR6 | 30578047 | Sertad1 | 29950 | 0.16 | 反式 | ||
RS6904236 | CHR6 | 30596134 | Sertad1 | 29950 | 0.1 | 反式 | ||
RS887719 | CHR7 | 21184272 | Sertad1 | 29950 | 0.08 | 反式 | ||
RS320082 | CHR7 | 29105404 | Sertad1 | 29950 | 1.407E-4 | 反式 | ||
RS317720 | CHR7 | 29110633 | Sertad1 | 29950 | 0.01 | 反式 | ||
RS317714 | CHR7 | 29115553 | Sertad1 | 29950 | 3.901E-5 | 反式 | ||
RS317724 | CHR7 | 29120565 | Sertad1 | 29950 | 0.01 | 反式 | ||
RS1419793 | CHR7 | 34697630 | Sertad1 | 29950 | 9.321E-5 | 反式 | ||
RS16886605 | CHR8 | 115894398 | Sertad1 | 29950 | 0.09 | 反式 | ||
RS10282827 | CHR8 | 138034102 | Sertad1 | 29950 | 0.02 | 反式 | ||
RS10834670 | Chr11 | 25404015 | Sertad1 | 29950 | 1.418e-5 | 反式 | ||
RS10834671 | Chr11 | 25404269 | Sertad1 | 29950 | 2.518e-5 | 反式 | ||
RS11019015 | Chr11 | 90157517 | Sertad1 | 29950 | 0.01 | 反式 | ||
RS11066476 | CHR12 | 113465366 | Sertad1 | 29950 | 0.17 | 反式 | ||
RS4497566 | CHR13 | 51694324 | Sertad1 | 29950 | 6.706E-5 | 反式 | ||
RS11846180 | CHR14 | 51377031 | Sertad1 | 29950 | 0.11 | 反式 | ||
RS1307687 | 0 | Sertad1 | 29950 | 0.07 | 反式 | |||
RS11158850 | CHR14 | 70757171 | Sertad1 | 29950 | 0.02 | 反式 | ||
RS1846326 | CHR15 | 28063877 | Sertad1 | 29950 | 0.16 | 反式 | ||
RS12452652 | CHR17 | 72235560 | Sertad1 | 29950 | 0.02 | 反式 | ||
RS9646596 | CHR18 | 53049211 | Sertad1 | 29950 | 0.02 | 反式 | ||
RS11152369 | CHR18 | 53066327 | Sertad1 | 29950 | 0.11 | 反式 | ||
RS1230712 | CHR18 | 54992531 | Sertad1 | 29950 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SERTAD1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 | 108 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brachat对Camptothecin的反应 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystrykh造血细胞IL3RA | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu IL13启动模型 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |