概括
基因 29950
象征 Sertad1
同义词 SEI1 | Trip-BR1
描述 包含1的serta域
参考 HGNC:HGNC:17932|HPRD:15326|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19Q13.1-Q13.2
Pascal P值 0.564
Sherlock P值 0.109
胎儿β -0.197
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25060020 19 40932140 Sertad1 -0.021 0.96 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12030788 CHR1 66768128 Sertad1 29950 0.09 反式
RS6666937 CHR1 170286842 Sertad1 29950 0.09 反式
RS11127467 CHR2 12993 Sertad1 29950 0 反式
RS16827037 CHR3 117203284 Sertad1 29950 3.733E-4 反式
RS614566 CHR3 182847389 Sertad1 29950 0.17 反式
RS7631640 CHR3 182883407 Sertad1 29950 0.16 反式
RS1009606 CHR6 5726368 Sertad1 29950 0.08 反式
RS3888778 CHR6 30529621 Sertad1 29950 0.06 反式
RS2239516 CHR6 30578047 Sertad1 29950 0.16 反式
RS6904236 CHR6 30596134 Sertad1 29950 0.1 反式
RS887719 CHR7 21184272 Sertad1 29950 0.08 反式
RS320082 CHR7 29105404 Sertad1 29950 1.407E-4 反式
RS317720 CHR7 29110633 Sertad1 29950 0.01 反式
RS317714 CHR7 29115553 Sertad1 29950 3.901E-5 反式
RS317724 CHR7 29120565 Sertad1 29950 0.01 反式
RS1419793 CHR7 34697630 Sertad1 29950 9.321E-5 反式
RS16886605 CHR8 115894398 Sertad1 29950 0.09 反式
RS10282827 CHR8 138034102 Sertad1 29950 0.02 反式
RS10834670 Chr11 25404015 Sertad1 29950 1.418e-5 反式
RS10834671 Chr11 25404269 Sertad1 29950 2.518e-5 反式
RS11019015 Chr11 90157517 Sertad1 29950 0.01 反式
RS11066476 CHR12 113465366 Sertad1 29950 0.17 反式
RS4497566 CHR13 51694324 Sertad1 29950 6.706E-5 反式
RS11846180 CHR14 51377031 Sertad1 29950 0.11 反式
RS1307687 0 Sertad1 29950 0.07 反式
RS11158850 CHR14 70757171 Sertad1 29950 0.02 反式
RS1846326 CHR15 28063877 Sertad1 29950 0.16 反式
RS12452652 CHR17 72235560 Sertad1 29950 0.02 反式
RS9646596 CHR18 53049211 Sertad1 29950 0.02 反式
RS11152369 CHR18 53066327 Sertad1 29950 0.11 反式
RS1230712 CHR18 54992531 Sertad1 29950 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 136 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH靶向DN 64 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin的反应 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystrykh造血细胞IL3RA 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi缺氧 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu IL13启动模型 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因