基因页:PDZRN4
概括?
基因 | 29951 |
象征 | PDZRN4 |
同义词 | LNX4 | SAMCAP3L |
描述 | PDZ域包含环4 |
参考 | MIM:609730|HGNC:HGNC:30552|Ensembl:ENSG00000165966|HPRD:15116|Vega:Otthumg00000169364 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q12 |
Pascal P值 | 0.073 |
Sherlock P值 | 0.914 |
主持人 | 皮质 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1458175 | 12 | 41965861 | 无效的 | 0.6855 | PDZRN4 | 无效的 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1350431 | CHR12 | 41819314 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2730830 | CHR12 | 41829145 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2733282 | CHR12 | 41829237 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2730819 | CHR12 | 41839413 | PDZRN4 | 29951 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2608692 | CHR12 | 41851916 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2250009 | CHR12 | 41859168 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2733269 | CHR12 | 41866716 | PDZRN4 | 29951 | 0 | 顺式 | ||
RS2608717 | CHR12 | 41908986 | PDZRN4 | 29951 | 0.16 | 顺式 | ||
RS285559 | CHR12 | 41929812 | PDZRN4 | 29951 | 0.09 | 顺式 | ||
RS285595 | CHR12 | 41940532 | PDZRN4 | 29951 | 0.08 | 顺式 | ||
RS287087 | CHR12 | 41943476 | PDZRN4 | 29951 | 0.16 | 顺式 | ||
RS285584 | CHR12 | 41946538 | PDZRN4 | 29951 | 0.05 | 顺式 | ||
RS970970 | CHR12 | 41970163 | PDZRN4 | 29951 | 0.03 | 顺式 | ||
RS12367934 | CHR12 | 41978921 | PDZRN4 | 29951 | 0.02 | 顺式 | ||
RS287031 | CHR12 | 41985431 | PDZRN4 | 29951 | 0.03 | 顺式 | ||
RS1350431 | CHR12 | 41819314 | PDZRN4 | 29951 | 0.12 | 反式 | ||
RS2730830 | CHR12 | 41829145 | PDZRN4 | 29951 | 0.11 | 反式 | ||
RS2733282 | CHR12 | 41829237 | PDZRN4 | 29951 | 0.07 | 反式 | ||
RS2608692 | CHR12 | 41851916 | PDZRN4 | 29951 | 0.1 | 反式 | ||
RS2250009 | CHR12 | 41859168 | PDZRN4 | 29951 | 0.17 | 反式 | ||
RS2733269 | CHR12 | 41866716 | PDZRN4 | 29951 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDZRN4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MF DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |