概括
基因 29951
象征 PDZRN4
同义词 LNX4 | SAMCAP3L
描述 PDZ域包含环4
参考 MIM:609730|HGNC:HGNC:30552|Ensembl:ENSG00000165966|HPRD:15116|Vega:Otthumg00000169364
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q12
Pascal P值 0.073
Sherlock P值 0.914
主持人 皮质
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS1458175 12 41965861 无效的 0.6855 PDZRN4 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1350431 CHR12 41819314 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2730830 CHR12 41829145 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2733282 CHR12 41829237 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2730819 CHR12 41839413 PDZRN4 29951 0.01 顺式
RS2608692 CHR12 41851916 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2250009 CHR12 41859168 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2733269 CHR12 41866716 PDZRN4 29951 0 顺式
RS2608717 CHR12 41908986 PDZRN4 29951 0.16 顺式
RS285559 CHR12 41929812 PDZRN4 29951 0.09 顺式
RS285595 CHR12 41940532 PDZRN4 29951 0.08 顺式
RS287087 CHR12 41943476 PDZRN4 29951 0.16 顺式
RS285584 CHR12 41946538 PDZRN4 29951 0.05 顺式
RS970970 CHR12 41970163 PDZRN4 29951 0.03 顺式
RS12367934 CHR12 41978921 PDZRN4 29951 0.02 顺式
RS287031 CHR12 41985431 PDZRN4 29951 0.03 顺式
RS1350431 CHR12 41819314 PDZRN4 29951 0.12 反式
RS2730830 CHR12 41829145 PDZRN4 29951 0.11 反式
RS2733282 CHR12 41829237 PDZRN4 29951 0.07 反式
RS2608692 CHR12 41851916 PDZRN4 29951 0.1 反式
RS2250009 CHR12 41859168 PDZRN4 29951 0.17 反式
RS2733269 CHR12 41866716 PDZRN4 29951 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MF DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因