基因页:DMGDH
概括?
基因 | 29958 |
象征 | DMGDH |
同义词 | dmgdhd | me2glydh |
描述 | 二甲基甘氨酸脱氢酶 |
参考 | MIM:605849|HGNC:HGNC:24475|ENSEMBL:ENSG00000132837|HPRD:05789|Vega:Otthumg00000108159 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q14.1 |
Pascal P值 | 0.047 |
主持人 | 尾状基底神经节 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | DMGDH | 29958 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DMGDH_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PLA2G4B | 0.74 | 0.68 |
FGF17 | 0.73 | 0.63 |
AC174470.2 | 0.72 | 0.60 |
AC011511.1 | 0.72 | 0.63 |
TFAP2E | 0.71 | 0.61 |
leng8 | 0.71 | 0.65 |
JMJD7-PLA2G4B | 0.71 | 0.61 |
CCDC57 | 0.71 | 0.65 |
Neil1 | 0.70 | 0.63 |
GNB3 | 0.70 | 0.66 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ITM2A | -0.37 | -0.40 |
TM4SF18 | -0.35 | -0.35 |
ELTD1 | -0.34 | -0.29 |
GNG11 | -0.31 | -0.40 |
GIMAP4 | -0.31 | -0.35 |
myl12a | -0.30 | -0.29 |
GIMAP2 | -0.30 | -0.31 |
ABCG2 | -0.30 | -0.30 |
AF347015.31 | -0.30 | -0.24 |
NMI | -0.30 | -0.32 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |