概括
基因 29958
象征 DMGDH
同义词 dmgdhd | me2glydh
描述 二甲基甘氨酸脱氢酶
参考 MIM:605849|HGNC:HGNC:24475|ENSEMBL:ENSG00000132837|HPRD:05789|Vega:Otthumg00000108159
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q14.1
Pascal P值 0.047
主持人 尾状基底神经节
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 DMGDH 29958 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PLA2G4B 0.74 0.68
FGF17 0.73 0.63
AC174470.2 0.72 0.60
AC011511.1 0.72 0.63
TFAP2E 0.71 0.61
leng8 0.71 0.65
JMJD7-PLA2G4B 0.71 0.61
CCDC57 0.71 0.65
Neil1 0.70 0.63
GNB3 0.70 0.66
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ITM2A -0.37 -0.40
TM4SF18 -0.35 -0.35
ELTD1 -0.34 -0.29
GNG11 -0.31 -0.40
GIMAP4 -0.31 -0.35
myl12a -0.30 -0.29
GIMAP2 -0.30 -0.31
ABCG2 -0.30 -0.30
AF347015.31 -0.30 -0.24
NMI -0.30 -0.32

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因