基因页面:PRICKLE4

总结吗?
GeneID 29964年
象征 PRICKLE4
同义词 C6orf49 | OBTP | OEBT | TOMM6
描述 刺平面细胞极性蛋白4
参考 MIM: 611389|HGNC: HGNC: 16805|运用:ENSG00000124593|HPRD: 12884|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6 p21.31
帕斯卡假定值 0.088
夏洛克假定值 0.232
DMG 1(#研究)
eGene 尾状基底神经节

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.033
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.04433

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg04163119 6 41754006 PRICKLE4 5.47平台以及 -0.022 8.9 e - DMG: Jaffe_2016
cg02125191 6 41755473 PRICKLE4 1.04 e-8 -0.015 4.48 e-6 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1219 0.91 0.96
RAB3GAP2 0.91 0.94
NUFIP2 0.91 0.95
BMPR2 0.91 0.95
TBL1XR1 0.91 0.94
VCPIP1 0.90 0.95
APPL1 0.90 0.94
ATRN 0.90 0.93
SEL1L 0.90 0.94
PRKCI 0.90 0.92
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.64 -0.70
HIGD1B -0.60 -0.69
AF347015.31 -0.60 -0.68
MT-CO2 -0.60 -0.69
TLCD1 -0.60 -0.65
AF347015.21 -0.59 -0.68
C19orf36 -0.59 -0.64
S100A16 -0.59 -0.66
CST3 -0.59 -0.66
C1orf54 -0.58 -0.72

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
ACEVEDO肝癌了 973年 570年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 863年 514年 所有SZGR 2.0基因通路
年级结肠和直肠癌DN 56 36 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 150 639年 645年 1 hsa - mir - 150 UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG