概括
基因 29967
象征 LRP12
同义词 ST7
描述 LDL受体相关蛋白12
参考 HGNC:HGNC:31708|Ensembl:ENSG00000147650|HPRD:17447|Vega:Otthumg00000164892
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q22.2
Pascal P值 0.943
胎儿β 1.144

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.008

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005041 低密度脂蛋白受体活性 nas 12809483
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12809483
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 nas 12809483
去:0006897 内吞作用 nas 12809483
去:0040008 调节生长 nas 9927190
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
去:0005905 涂层坑 IEA -
去:0005887 质膜的积分 艾达 12809483

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF目标被AKT1 UP压制 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MS 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过nova2拼接 43 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发 166 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-137 37 43 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-142-5p 768 775 1A,M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-143 706 712 M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-153 750 756 M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-181 1301 1307 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-22 189 195 1a HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-377 1263 1269 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-378 1356 1362 M8 HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-493-5p 434 441 1A,M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu