基因页:LRP12
概括?
基因 | 29967 |
象征 | LRP12 |
同义词 | ST7 |
描述 | LDL受体相关蛋白12 |
参考 | HGNC:HGNC:31708|Ensembl:ENSG00000147650|HPRD:17447|Vega:Otthumg00000164892 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q22.2 |
Pascal P值 | 0.943 |
胎儿β | 1.144 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LRP12_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005041 | 低密度脂蛋白受体活性 | nas | 12809483 | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12809483 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | nas | 12809483 | |
去:0006897 | 内吞作用 | nas | 12809483 | |
去:0040008 | 调节生长 | nas | 9927190 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005905 | 涂层坑 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 艾达 | 12809483 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF目标被AKT1 UP压制 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移DN | 121 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MS | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过nova2拼接 | 43 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-137 | 37 | 43 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-142-5p | 768 | 775 | 1A,M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-143 | 706 | 712 | M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-153 | 750 | 756 | M8 | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
mir-181 | 1301 | 1307 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-22 | 189 | 195 | 1a | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-377 | 1263 | 1269 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-378 | 1356 | 1362 | M8 | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-493-5p | 434 | 441 | 1A,M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |