Summary
GeneID 29968
Symbol PSAT1
同义词 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD
描述 磷serine氨基转移酶1
参考 MIM:610936|HGNC:HGNC:19129|Ensembl:ENSG00000135069|HPRD:17918|Vega:Otthumg00000020066
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q21.2
Pascal P值 0.893
Sherlock P值 0.179
胎儿β -0.444
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS13084750 CHR3 184094723 PSAT1 29968 0.15 反式
RS2068673 CHR12 60333402 PSAT1 29968 0.01 反式
rs16965323 CHR15 53229859 PSAT1 29968 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004648 磷serine转氨酶活性 nas 谷氨酸(GO期限:6) 10637769
GO:0016740 转移酶的活动 IEA -
去:0030170 吡啶还毒素结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0008652 氨基酸生物合成过程 IEA -
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0008615 吡ido醇生物合成过程 nas 10637769
去:0006564 L链生物合成过程 nas 10637769

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 31 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome氨基酸合成和互转换跨跨 17 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村癌症微环境DN 46 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IGARASHI ATF4 TARGETS DN 90 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础DN 455 304 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向 135 82 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向DN 536 332 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
sabates结直肠腺瘤 141 75 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MAHADEVAN RESPONSE TO MP470 UP 20 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Appierto对Fenretinide DN的反应 51 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 70 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MORI PRE BI LYMPHOCYTE UP 80 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sansom APC目标 126 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT DN 129 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HU遗传毒性损伤24小时 35 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee衰老的新皮层 89 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KANG阿霉素抗性DN 19 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2向上 428 266 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SATO SILENCED BY METHYLATION IN PANCREATIC CANCER 1 419 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成6 189 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
磷酸氨基酸剥夺 29 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sansom APC目标 212 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化DN沉默 105 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向DN 292 189 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION DN 281 179 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄Foxa2靶向 45 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pleura DN中的Smid乳腺癌复发 27 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础 648 398 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞 425 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
怀特福德小儿癌标记 116 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 All SZGR 2.0 genes in this pathway
podar对Apaphostin的反应 147 98 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib的反应 245 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Vav3前列腺致癌DN 17 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 36 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标增长 243 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ohguchi肝HNF4A靶向 44 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5A靶向 217 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5a Targets Group2 60 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway