基因页:UBQLN1
Summary?
基因ID | 29979 |
象征 | UBQLN1 |
同义词 | da41 | dsk2 | plic-1 | ubqn | xdrp1 |
描述 | 泛素1 |
参考 | MIM:605046|HGNC:HGNC:12508|Ensembl:ENSG00000135018|HPRD:05440|Vega:Otthumg00000020104 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q22 | 9Q21.2-Q21.3 |
Pascal P值 | 0.028 |
Sherlock P值 | 0.259 |
TADA P值 | 0.011 |
胎儿β | 0.455 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UBQLN1 | Chr9 | 86292782 | t | 一个 | NM_013438 NM_053067 |
p.322n> i p.322n> i |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UBQLN1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CD47 | IAP |mer6 |OA3 | CD47分子 | - | HPRD | 10549293 |
CD99 | MIC2 |MIC2X |云 | CD99分子 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
CSTF2 | CSTF-64 | 切割刺激因子,3'Pre-RNA,亚基2,64KDA | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
CSTF2T | CSTF-64T |DKFZP434C1013 |KIAA0689 | 切割刺激因子,3'Pre-RNA,亚基2,64kDa,tau变体 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
EFEMP2 | fbln4 |MBP1 |UPH1 | 含EGF的纤维蛋白样细胞外基质蛋白2 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
FAM127B | CXX1B |DKFZP564B147 |mar8a |MGC8471 | 具有序列相似性的家庭127,成员b | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
frap1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 11853878 |
FZD7 | FZE3 | 卷曲的同源物7(果蝇) | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
加布德 | MGC45284 | γ-氨基丁酸(GABA)受体Delta | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
HGS | HRS |ZFYVE8 | 肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
HK2 | DKFZP686M1669 |HKII |HXK2 | 己糖酶2 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
HSPA13 | stch | 热休克蛋白70KDA家族,成员13 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
IGLC1 | IGLC | 免疫球蛋白Lambda常数1(MCG标记) | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
KLHDC5 | KIAA1340 |MGC131714 | 包含5的kelch域 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
NBL1 | D1S1733E |丹|dand1 |MGC8972 |NB |NO3 | 神经母细胞瘤,抑制肿瘤性1 | - | HPRD,Biogrid | 9303440|10390159 |
P4HB | DSI |ERBA2L |git |PDI |PDIA1 |PHDB |PO4DB |PO4HB |prohb | Procollagen-丙啉,2-氧基谷物4-二氧酶(脯氨酸4-羟化酶),β多肽 | - | HPRD,Biogrid | 12095988 |
PLA2G16 | AdPLA | H-REV107-1 |极品LS3 | HREV107 | HREV107-3 | MGC118754 | 磷脂酶A2,第XVI组 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
PSEN1 | ad3 |时尚|PS1 |S182 | Presenilin 1 | 重构的复合物 2台混合动力 |
Biogrid | 11076969 |
PSEN2 | AD3L |ad4 |PS2 |STM2 | Presenilin 2(阿尔茨海默氏病4) | - | HPRD,Biogrid | 11076969 |
RIC8A | MGC104517 |MGC131931 |MGC148073 |MGC148074 |ric8 |Synembryn | 对胆碱酯酶抑制剂8同源物A(秀丽隐杆线虫)的抗性 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
serpini2 | MEPI |pangpin |PI14 |TSA2004 | Serpin肽酶抑制剂,进化枝I(pandpin),成员2 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
SMCR7 | MGC23130 | 史密斯 - 马格尼综合症染色体区域,候选7 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
TFF1 | BCEI |D21S21 |HP1.A |HPS2 |PNR-2 |PS2 | 三叶因子1 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
TMCO6 | FLJ39769 |Pro1580 | 跨膜和盘绕螺旋域6 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
tRIM32 | BBS11 |ht2a |LGMD2H |塔蒂普 | 三方基序32 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
UBQLN1 | DA41 |DSK2 |FLJ90054 |plic-1 |XDRP1 | 泛素1 | 2台混合动力 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Appierto对Fenretinide的反应 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
盖斯对dsrna的响应 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |