基因页面:PACSIN1
总结吗?
| GeneID | 29993年 |
| 象征 | PACSIN1 |
| 同义词 | SDPI |
| 描述 | 蛋白激酶C和酪蛋白激酶在神经元1衬底 |
| 参考 | MIM: 606512|HGNC: HGNC: 8570|运用:ENSG00000124507|HPRD: 05936|织女:OTTHUMG00000014547 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.017 |
| 夏洛克假定值 | 0.934 |
| 胎儿β | -4.173 |
| DMG | 1(#研究) |
| 支持 | 蛋白质聚类 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_Synaptosome CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg17468253 | 6 | 34498714 | PACSIN1 | 8.47 e-6 | 0.364 | 0.013 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004672 | 蛋白激酶活性 | NAS | - - - - - - | |
| 去:0008092 | 细胞骨架蛋白绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016301 | 激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0045806 | 负调节的内吞作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | NAS | - - - - - - | |
| 去:0030137 | COPI-coated泡 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 赛尔维拉SDHB目标1 | 118年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 具备干细胞RAMALHO DN | 74年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN神经元标记 | 69年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 人士梅尔曼TUT1 DN的目标 | 47 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔EBNA1 ANTICORRELATED | 173年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-103/107 | 2397年 | 2404年 | 1、m8 | hsa - mir - 103大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA |
| hsa - mir - 107大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
| mir - 133 | 2206年 | 2212年 | m8 | hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU |
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| miR-18 | 2034年 | 2040年 | m8 | hsa-miR-18a | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUA |
| hsa-miR-18b | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGUUA | ||||
| mir - 375 | 136年 | 142年 | 1 | hsa - mir - 375 | UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA |
| miR-9 | 273年 | 280年 | 1、m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |