基因页：nxph1

概括？
基因 30010
象征 nxph1
同义词 NPH1 | NBLA00697
描述 神经蛋白1
参考 MIM：604639|HGNC：HGNC：20693|ENSEMBL：ENSG00000122584|HPRD：06867|Vega：Otthumg00000151941
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22
Pascal P值 0.044
Sherlock P值 0.913
胎儿β -1.033
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG14094983 7 8482099 nxph1 1.257E-4 -0.247 0.03 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005102 受体结合 IEA 神经递质（GO期限：4） -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 496 502 1a HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-139 497 503 M8 HSA-MIR-139脑 ucuacagugcacgugucu
mir-141/200a 925 931 1a HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-144 496 502 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-15/16/195/424/497 107 113 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-186 550 557 1A，M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
MiR-200BC/429 546 552 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 274 281 1A，M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-204/211 796 802 1a HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-339 49 55 M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-383 779 786 1A，M8 HSA-MIR-383脑 agaucagaaggugauuguggcu
mir-409-3p 608 614 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-452 672 678 1a HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-485-3p 890 897 1A，M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-493-5p 1155 1161 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-496 818 824 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-505 1084 1090 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc