概括
基因 3015
象征 H2afz
同义词 H2A.Z-1 | H2A.Z | H2A/Z | H2AZ
描述 H2A组蛋白家庭成员Z
参考 MIM:142763|HGNC:HGNC:4741|ENSEMBL:ENSG00000164032|HPRD:00823|Vega:Otthumg00000131048
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q24
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.109
胎儿β 0.431
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17432613 CHR1 18346091 H2afz 3015 0.19 反式
RS7132043 CHR12 80968399 H2afz 3015 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDRG2 0.91 0.93
htra1 0.90 0.93
克鲁 0.90 0.92
aldoc 0.88 0.90
CSRP1 0.88 0.90
CYP2J2 0.87 0.89
aldh4a1 0.87 0.89
TMBIM1 0.87 0.92
ADHFE1 0.87 0.88
ACSBG1 0.86 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DPF1 -0.67 -0.73
RTF1 -0.66 -0.73
Nova2 -0.65 -0.70
3月4日 -0.64 -0.72
Gprin1 -0.64 -0.69
KIAA1543 -0.64 -0.70
ppp3cc -0.64 -0.71
CRMP1 -0.64 -0.70
NOL4 -0.64 -0.68
ZNF821 -0.64 -0.69

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂重组 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组淀粉样蛋白 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒末端的反应组包装 48 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍癌复发肿瘤样本 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
受甲基化DN调节的Missiaglia 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Appierto对Fenretinide DN的反应 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath增殖 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移 43 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标 108 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA对IFNG DN的回应 85 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F绑定的REN 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
石匠食道癌发生 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamminga EZH2目标 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
takao对UVB辐射的响应 86 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
zamora nos2靶向 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rhodes未分化的癌症 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
老化老式的DN 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级转移DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马歇尔病毒感染反应dn 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因