基因页:Hist1H2Bb
概括?
基因 | 3018 |
象征 | Hist1H2Bb |
同义词 | H2B.1 | H2B/F | H2BFF |
描述 | 组蛋白簇1,H2BB |
参考 | MIM:602803|HGNC:HGNC:4751|ENSEMBL:ENSG00000276410|HPRD:07536|Vega:Otthumg0000000014421 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 1.054e-10 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HIST1H2BB_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ndufs2 | 0.90 | 0.84 |
加尔斯 | 0.90 | 0.85 |
AHSA1 | 0.88 | 0.84 |
USP5 | 0.88 | 0.79 |
汽车 | 0.87 | 0.82 |
immt | 0.87 | 0.81 |
PPP2R5D | 0.87 | 0.79 |
TCF25 | 0.86 | 0.79 |
grpel1 | 0.86 | 0.78 |
IDH3B | 0.86 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.80 | -0.67 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.66 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.76 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.76 | -0.64 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.64 |
mt-cyb | -0.73 | -0.63 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.67 |
AF347015.15 | -0.71 | -0.63 |
MT-ATP8 | -0.70 | -0.66 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | nas | 9439656 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006334 | 核小体组装 | nas | 9439656 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000786 | 核小体 | nas | 9439656 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005694 | 染色体 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I启动子开口 | 62 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂重组 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
端粒末端的反应组包装 | 48 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
durchdewald皮肤致癌 | 88 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存不良DN | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |