基因页:HBM
概括?
基因 | 3042 |
象征 | HBM |
同义词 | HBAP2 | HBK |
描述 | 血红蛋白亚基MU |
参考 | MIM:609639|HGNC:HGNC:4826|Ensembl:ENSG00000206177|HPRD:13633|Vega:Otthumg00000059926 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.3 |
Pascal P值 | 0.242 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01687051 | 16 | 278852 | HBM | 0.001 | -11.289 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HBM_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tbxas1 | 0.82 | 0.81 |
apbb1ip | 0.81 | 0.80 |
adora3 | 0.80 | 0.77 |
C3AR1 | 0.80 | 0.73 |
C1QC | 0.79 | 0.77 |
ptprc | 0.78 | 0.75 |
EVI2B | 0.78 | 0.82 |
C3 | 0.77 | 0.72 |
CTSS | 0.77 | 0.78 |
SLC2A5 | 0.77 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1949 | -0.49 | -0.43 |
mycn | -0.48 | -0.35 |
ISLR2 | -0.48 | -0.33 |
SH2B2 | -0.48 | -0.56 |
tubb2b | -0.48 | -0.48 |
AL033532.1 | -0.47 | -0.40 |
vash2 | -0.47 | -0.39 |
SH3BP2 | -0.47 | -0.51 |
ZBTB12 | -0.46 | -0.38 |
ZNF551 | -0.46 | -0.38 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon | 120 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |