基因页:serpind1
概括?
基因 | 3053 |
象征 | serpind1 |
同义词 | d22s673 | hc2 | hcf2 | hcii | hls2 | ls2 | thph10 |
描述 | Serpin肽酶抑制剂,进化枝D(肝素辅因子),成员1 |
参考 | MIM:142360|HGNC:HGNC:4838|Ensembl:ENSG0000000099937|HPRD:00795|Vega:Otthumg00000150755 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q11.21 |
Pascal P值 | 0.252 |
胎儿β | 0.567 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17131472 | CHR1 | 91962966 | serpind1 | 3053 | 0.09 | 反式 | ||
RS6718379 | CHR2 | 18632808 | serpind1 | 3053 | 0.13 | 反式 | ||
RS17015803 | CHR2 | 120191430 | serpind1 | 3053 | 0.03 | 反式 | ||
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | serpind1 | 3053 | 0.03 | 反式 | ||
RS2971271 | CHR3 | 125450402 | serpind1 | 3053 | 0.14 | 反式 | ||
RS2976809 | CHR3 | 125451738 | serpind1 | 3053 | 1.705E-4 | 反式 | ||
RS6449169 | 0 | serpind1 | 3053 | 0.18 | 反式 | |||
RS313946 | CHR4 | 113975904 | serpind1 | 3053 | 0.07 | 反式 | ||
RS657141 | CHR4 | 113981041 | serpind1 | 3053 | 0.16 | 反式 | ||
RS17381134 | CHR4 | 157179855 | serpind1 | 3053 | 0.08 | 反式 | ||
RS2294262 | CHR6 | 16108966 | serpind1 | 3053 | 0.19 | 反式 | ||
RS4236095 | CHR6 | 47368686 | serpind1 | 3053 | 0.16 | 反式 | ||
RS6455226 | CHR6 | 67930295 | serpind1 | 3053 | 0.01 | 反式 | ||
RS2718035 | CHR7 | 36132888 | serpind1 | 3053 | 0.03 | 反式 | ||
RS3110902 | CHR7 | 65375101 | serpind1 | 3053 | 0.13 | 反式 | ||
RS7841407 | CHR8 | 9243427 | serpind1 | 3053 | 0.09 | 反式 | ||
RS680372 | CHR8 | 36999626 | serpind1 | 3053 | 0.18 | 反式 | ||
RS4514358 | Chr10 | 43861923 | serpind1 | 3053 | 0.02 | 反式 | ||
RS11016704 | Chr10 | 128989145 | serpind1 | 3053 | 0.07 | 反式 | ||
RS17134872 | Chr11 | 76139845 | serpind1 | 3053 | 0.16 | 反式 | ||
RS11236774 | Chr11 | 76234952 | serpind1 | 3053 | 0.16 | 反式 | ||
RS9529974 | CHR13 | 72821935 | serpind1 | 3053 | 0 | 反式 | ||
RS7164640 | CHR15 | 80661303 | serpind1 | 3053 | 0.12 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | serpind1 | 3053 | 0.03 | 反式 | ||
SNP_A-1913345 | 0 | serpind1 | 3053 | 0.12 | 反式 | |||
RS293737 | CHR20 | 31925477 | serpind1 | 3053 | 0.1 | 反式 | ||
RS6095741 | CHR20 | 48666589 | serpind1 | 3053 | 0 | 反式 | ||
RS17255719 | Chrx | 12144766 | serpind1 | 3053 | 0.09 | 反式 | ||
RS5991662 | Chrx | 43335796 | serpind1 | 3053 | 0.06 | 反式 | ||
RS6529399 | Chrx | 128763582 | serpind1 | 3053 | 0.04 | 反式 | ||
RS3761581 | Chrx | 128789720 | serpind1 | 3053 | 0 | 反式 | ||
RS242163 | Chrx | 132311662 | serpind1 | 3053 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SERPIND1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Brip1 | 0.97 | 0.76 |
法奇 | 0.97 | 0.70 |
梅尔克 | 0.97 | 0.83 |
KIF23 | 0.97 | 0.75 |
SMC4 | 0.96 | 0.79 |
bub1b | 0.96 | 0.79 |
ERCC6L | 0.96 | 0.73 |
BRCA2 | 0.96 | 0.80 |
bub1 | 0.96 | 0.79 |
MCM10 | 0.96 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.45 | -0.70 |
SLC9A3R2 | -0.45 | -0.54 |
LHPP | -0.45 | -0.66 |
HLA-F | -0.45 | -0.73 |
pth1r | -0.44 | -0.69 |
C5orf53 | -0.44 | -0.68 |
asphd1 | -0.44 | -0.62 |
TNFSF12 | -0.44 | -0.66 |
aldoc | -0.43 | -0.67 |
AIFM3 | -0.43 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004867 | 丝氨酸型内肽酶抑制剂活性 | IEA | - | |
去:0008201 | 肝素约束 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007596 | 血液凝血 | IEA | - | |
去:0006935 | 趋化性 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 14718574 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马良性皮肤肿瘤向上 | 18 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克道尔急性肺损伤 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威尔逊蛋白酶在肿瘤骨接口上 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |