概括
基因 3053
象征 serpind1
同义词 d22s673 | hc2 | hcf2 | hcii | hls2 | ls2 | thph10
描述 Serpin肽酶抑制剂,进化枝D(肝素辅因子),成员1
参考 MIM:142360|HGNC:HGNC:4838|Ensembl:ENSG0000000099937|HPRD:00795|Vega:Otthumg00000150755
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 0.252
胎儿β 0.567
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17131472 CHR1 91962966 serpind1 3053 0.09 反式
RS6718379 CHR2 18632808 serpind1 3053 0.13 反式
RS17015803 CHR2 120191430 serpind1 3053 0.03 反式
RS2922180 CHR3 125280472 serpind1 3053 0.03 反式
RS2971271 CHR3 125450402 serpind1 3053 0.14 反式
RS2976809 CHR3 125451738 serpind1 3053 1.705E-4 反式
RS6449169 0 serpind1 3053 0.18 反式
RS313946 CHR4 113975904 serpind1 3053 0.07 反式
RS657141 CHR4 113981041 serpind1 3053 0.16 反式
RS17381134 CHR4 157179855 serpind1 3053 0.08 反式
RS2294262 CHR6 16108966 serpind1 3053 0.19 反式
RS4236095 CHR6 47368686 serpind1 3053 0.16 反式
RS6455226 CHR6 67930295 serpind1 3053 0.01 反式
RS2718035 CHR7 36132888 serpind1 3053 0.03 反式
RS3110902 CHR7 65375101 serpind1 3053 0.13 反式
RS7841407 CHR8 9243427 serpind1 3053 0.09 反式
RS680372 CHR8 36999626 serpind1 3053 0.18 反式
RS4514358 Chr10 43861923 serpind1 3053 0.02 反式
RS11016704 Chr10 128989145 serpind1 3053 0.07 反式
RS17134872 Chr11 76139845 serpind1 3053 0.16 反式
RS11236774 Chr11 76234952 serpind1 3053 0.16 反式
RS9529974 CHR13 72821935 serpind1 3053 0 反式
RS7164640 CHR15 80661303 serpind1 3053 0.12 反式
RS11873703 CHR18 61448702 serpind1 3053 0.03 反式
SNP_A-1913345 0 serpind1 3053 0.12 反式
RS293737 CHR20 31925477 serpind1 3053 0.1 反式
RS6095741 CHR20 48666589 serpind1 3053 0 反式
RS17255719 Chrx 12144766 serpind1 3053 0.09 反式
RS5991662 Chrx 43335796 serpind1 3053 0.06 反式
RS6529399 Chrx 128763582 serpind1 3053 0.04 反式
RS3761581 Chrx 128789720 serpind1 3053 0 反式
RS242163 Chrx 132311662 serpind1 3053 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Brip1 0.97 0.76
法奇 0.97 0.70
梅尔克 0.97 0.83
KIF23 0.97 0.75
SMC4 0.96 0.79
bub1b 0.96 0.79
ERCC6L 0.96 0.73
BRCA2 0.96 0.80
bub1 0.96 0.79
MCM10 0.96 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.45 -0.70
SLC9A3R2 -0.45 -0.54
LHPP -0.45 -0.66
HLA-F -0.45 -0.73
pth1r -0.44 -0.69
C5orf53 -0.44 -0.68
asphd1 -0.44 -0.62
TNFSF12 -0.44 -0.66
aldoc -0.43 -0.67
AIFM3 -0.43 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004867 丝氨酸型内肽酶抑制剂活性 IEA -
去:0008201 肝素约束 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007596 血液凝血 IEA -
去:0006935 趋化性 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 nas 14718574

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马良性皮肤肿瘤向上 18 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏肝 55 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔逊蛋白酶在肿瘤骨接口上 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 44 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因