基因页：HCK
概括?
| 基因ID | 3055 |
| Symbol | HCK |
| 同义词 | JTK9 | P59HCK | P61HCK |
| 描述 | HCKproto-oncogene, Src family tyrosine kinase |
| 参考 | MIM:142370|HGNC:HGNC:4840|ENSEMBL：ENSG00000101336|HPRD:00796|Vega:OTTHUMG00000032204 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 20Q11-Q12 |
| Pascal P值 | 0.01 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.1626 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12624267 | chr2 | 73986930 | HCK | 3055 | 0.15 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| NDUFA9 | 0.85 | 0.76 |
| C20ORF30 | 0.83 | 0.79 |
| APOA1BP | 0.82 | 0.73 |
| TSPAN31 | 0.82 | 0.65 |
| TRUB2 | 0.82 | 0.71 |
| SDHB | 0.82 | 0.72 |
| CYC1 | 0.81 | 0.67 |
| C1orf102 | 0.80 | 0.73 |
| ECHS1 | 0.80 | 0.75 |
| METTL1 | 0.80 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| EIF5B | -0.42 | -0.49 |
| ANP32C | -0.38 | -0.46 |
| AF347015.18 | -0.36 | -0.28 |
| AC010300.1 | -0.36 | -0.44 |
| AC005921.3 | -0.33 | -0.49 |
| MAP4K4 | -0.31 | -0.29 |
| ZNF326 | -0.30 | -0.25 |
| AC100783.1 | -0.30 | -0.26 |
| ZC3H13 | -0.29 | -0.21 |
| THOC2 | -0.29 | -0.28 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| GO:0005515 | protein binding | 新闻学会 | 7859737|12029088 | |
| GO:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004715 | non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity | IEA | - | |
| GO:0016740 | transferase activity | IEA | - | |
| Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | 塔斯 | 3496523 | |
| GO:0007498 | mesoderm development | 塔斯 | 3453117 | |
| GO：0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
| 细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL | JTK7 | bcr/abl | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl oncogene 1, receptor tyrosine kinase | - | HPRD，Biogrid | 9407116 |
| ABL2 | abll |arg |FLJ22224 |FLJ31718 |FLJ41441 | v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 2 (arg, Abelson-related gene) | - | HPRD | 12748290 |
| ADAM15 | MDC15 | 亚当金属肽酶结构域15 | - | HPRD，Biogrid | 11741929 |
| BCAR1 | CAS | CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD，Biogrid | 9020138 |
| BCR | ALL | BCR-ABL1 | BCR1 | CML | D22S11 | D22S662 | FLJ16453 | PHL | breakpoint cluster region | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10849448|12592324 |
| BTK | AGMX1 | AT | ATK | BPK | IMD1 | MGC126261 | MGC126262 | PSCTK1 | XLA | Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase | - | HPRD，Biogrid | 8058772 |
| C14orf4 | EAP1 | IRF2BPL | KIAA1865 | chromosome 14 open reading frame 4 | - | HPRD | 12029088 |
| CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | - | HPRD，Biogrid | 10092522 |
| CCR3 | CC-CKR-3 |CD193 |CKR3 |CMKBR3 |MGC102841 | chemokine (C-C motif) receptor 3 | - | HPRD，Biogrid | 10527858 |
| CSF3R | CD114 | GCSFR | 菌落刺激因子3受体（粒细胞） | - | HPRD，Biogrid | 9790917 |
| DOK1 | MGC117395 | MGC138860 | P62DOK | 对接蛋白1，62KDA（酪氨酸激酶1的下游） | Reconstituted Complex | BioGRID | 11071635 |
| Elmo1 | CED-12 |Ced12 |Elmo-1 |KIAA0281 |MGC126406 | engulfment and cell motility 1 | - | HPRD，Biogrid | 12029088 |
| EVL | RNB6 | Enah/Vasp-like | - | HPRD | 12029088 |
| FCGR1A | CD64 | CD64A | FCRI | FLJ18345 | IGFR1 | Fc fragment of IgG, high affinity Ia, receptor (CD64) | - | HPRD，Biogrid | 8064233 |
| FCGR2A | CD32 |CD32A |CDW32 |FCG2 |FCGR2 |FCGR2A1 |FCGR |IGFR2 |MGC23887 |MGC30032 | Fc fragment of IgG, low affinity IIa, receptor (CD32) | - | HPRD | 9268059 |
| galnac4s-6st | BRAG | DKFZp781H1369 | KIAA0598 | MGC34346 | RP11-47G11.1 | B cell RAG associated protein | - | HPRD，Biogrid | 10749872 |
| IL6ST | CD130 | CDw130 | GP130 | GP130-RAPS | IL6R-beta | interleukin 6 signal transducer (gp130, oncostatin M receptor) | - | HPRD，Biogrid | 11689697 |
| KHDRBS1 | FLJ34027 |SAM68 |p62 | KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 | HCK与SAM68相互作用。 | BIND | 11278465 |
| PECAM1 | CD31 |PECAM-1 | platelet/endothelial cell adhesion molecule | - | HPRD，Biogrid | 10858437 |
| plaur | CD87 |UPAR |urkr | 纤溶酶原激活剂，尿激酶受体 | - | HPRD，Biogrid | 11097855 |
| PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | - | HPRD | 10586033 |
| RAPGEF1 | C3G | DKFZp781P1719 | GRF2 | RAP鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 | - | HPRD，Biogrid | 14551197 |
| rasa1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 | - | HPRD，Biogrid | 7782336 |
| RASA3 | GAP1IP4BP | GAPIII | MGC46517 | MGC47588 | RAS P21蛋白激活剂3 | - | HPRD，Biogrid | 7782336 |
| RPL10 | DKFZP686J1851 |DXS648 |DXS648E |FLJ23544 |FLJ27072 |十一月|QM | ribosomal protein L10 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12138090 |
| SH3BP1 | - | SH3-domain binding protein 1 | - | HPRD | 12029088 |
| SKAP2 | MGC10411 |MGC33304 |prap |RA70 |SAPS |scap2 |skap-hom |SKAP55R | src kinase associated phosphoprotein 2 | - | HPRD，Biogrid | 9837776 |
| TRPV4 | OTRPC4 |TRP12 |VR-OAC |VRL-2 |VRL2 |Vroac | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族V，成员4 | - | HPRD，Biogrid | 12538589 |
| UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物（秀丽隐杆线虫） | - | HPRD，Biogrid | 12496276 |
| 曾是 | IMD2 |THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征（湿疹 - 肉毒细胞减少症） | Reconstituted Complex | BioGRID | 12029088 |
| WIPF1 | MGC111041 |prpl-2 |WASPIP |WIP | 曾是/WASL interacting protein family, member 1 | - | HPRD，Biogrid | 12029088 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FC GAMMA R MEDIATED PHAGOCYTOSIS | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Barrestin SRC途径 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID GLYPICAN 1PATHWAY | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PTP1B PATHWAY | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID p38 alpha beta途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TXA2 Pathway | 57 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PI3KCI PATHWAY | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AMB2中性粒细胞途径 | 41 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID EPHA FWDPATHWAY | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL6 7途径 | 47 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB PATHWAY | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR1 PATHWAY | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID EPHRINB REV PATHWAY | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PIDα突触核蛋白途径 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY ILS | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME REGULATION OF SIGNALING BY CBL | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IL 3 5 AND GM CSF SIGNALING | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME HIV INFECTION | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME THE ROLE OF NEF IN HIV1 REPLICATION AND DISEASE PATHOGENESIS | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKEY RB1 ACUTE LOF UP | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肺癌 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS UP | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GROSS ELK3 TARGETS UP | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MORI IMMATURE B LYMPHOCYTE UP | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤 | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HESS TARGETS OF HOXA9 AND MEIS1 DN | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD T LYMPHOCYTE AND NK PROGENITOR DN | 63 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCLACHLAN DENTAL CARIES DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HELLER SILENCED BY METHYLATION UP | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Finetti乳腺癌绿色 | 16 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bohn原发性免疫缺陷综合症DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ichiba移植与宿主疾病D7 UP | 107 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SWEET LUNG CANCER KRAS DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER NPC HCP WITH H3K27ME3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME2 AND H3K27ME3 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GUTIERREZ WALDENSTROEMS MACROGLOBULINEMIA 1 DN | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIKKELSEN NPC HCP WITH H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA ADIPOGENESIS EARLY DN | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村脂肪形成晚期DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MADAN DPPA4 TARGETS | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |