基因页面:HDGF
总结吗?
| GeneID | 3068年 |
| 象征 | HDGF |
| 同义词 | HMG1L2 |
| 描述 | hepatoma-derived生长因子 |
| 参考 | MIM: 600339|HGNC: HGNC: 4856|运用:ENSG00000143321|HPRD: 02079|织女:OTTHUMG00000041295 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 q23.1 |
| 夏洛克假定值 | 0.89 |
| 胎儿β | 0.233 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00814 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg12421458 | 1 | 156722064 | HDGF | -0.027 | 0.29 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008201 | 肝素结合 | 助教 | 7929202 | |
| 去:0008083 | 生长因子活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | 7929202 | |
| 去:0008283 | 细胞增殖 | 助教 | 7929202 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005615 | 细胞外空间 | 助教 | 7929202 | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 助教 | 7929202 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME糖尿病的途径 | 133年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME XBP1S伴侣蛋白基因的激活 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME展开蛋白质反应 | 80年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 钟阿扎胞苷和TSA DN | 70年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BORCZUK恶性间皮瘤起来 | 305年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群1 DN | 378年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 巴里斯甲状腺癌DN | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 田中在食管癌癌甲基化 | 103年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李在肺癌放大 | 178年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由MYC SCHLOSSER血清反应增强 | 108年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER MYC目标和血清反应 | 47 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李胎儿肾脏肿瘤和2 | 30. | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王BEXAROTENE反应 | 34 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD印和X与目标 | 17 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛克伍德在肺癌放大 | 214年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOLDRATH稳态扩散 | 171年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 与IL5 BYSTROEM相关 | 51 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林APC的目标 | 77年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SANA应对IFNG DN | 85年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 科勒MYC目标了 | 25 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 快活的HDAC扩散集群DN | 76年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB失败心脏心房DN | 141年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血作用中间祖 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MITSIADES应对APLIDIN DN | 249年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHAUHAN METHOXYESTRADIOL反应 | 51 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANTVEER乳腺癌ESR1 DN | 240年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HINATA NFKB目标纤维母细胞 | 84年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍持续时间CORR DN | 146年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOLLEMAN强的松阻力B | 22 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 129 - 5 - p | 914年 | 920年 | 1 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| mir - 139 | 1265年 | 1271年 | m8 | hsa - mir - 139大脑 | UCUACAGUGCACGUGUCU |
| miR-15/16/195/424/497 | 37 | 43 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 214 | 35 | 41 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| miR-29 | 49 | 55 | 1 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 384 | 1313年 | 1320年 | 1、m8 | hsa - mir - 384 | AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA |
| mir - 452 | 77年 | 83年 | m8 | hsa - mir - 452 | UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC |