概括
基因 30811
象征 hun
同义词 -
描述 激素上调的NEU相关激酶
参考 MIM:606532|HGNC:HGNC:13326|ENSEMBL:ENSG00000142149|HPRD:09410|Vega:Otthumg00000085019
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.1
Pascal P值 0.029
胎儿β 1.32
DMG 1(#研究)
主持人
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11173579 21 33247885 hun 4.59e-5 0.686 0.021 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Cldn5 0.60 0.52
SH3TC1 0.58 0.48
ICAM2 0.57 0.50
C10orf10 0.56 0.35
HRCT1 0.53 0.20
IL32 0.51 0.34
NFKB2 0.51 0.45
IGFBP1 0.50 0.25
EDN1 0.49 0.26
TMEM204 0.48 0.36
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF540 -0.41 -0.46
CDH10 -0.40 -0.47
RNF103 -0.40 -0.44
mylip -0.40 -0.50
Z68873.1 -0.39 -0.41
AC141586.1 -0.39 -0.40
ZFAND5 -0.38 -0.46
陶克3 -0.38 -0.37
aftph -0.37 -0.41
CCDC149 -0.37 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子有Sox4结合位点 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 44 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因