基因页：kcnip3

概括？
基因 30818
象征 kcnip3
同义词 CSEN | Dream | Kchip3
描述 钾电源通道相互作用蛋白3
参考 MIM：604662|HGNC：HGNC：15523|Ensembl：ENSG00000115041|HPRD：05232|Vega：Otthumg00000130392
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q21.1
Pascal P值 0.228
Sherlock P值 0.795
胎儿β -1.997
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0004
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.492

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG07166291 2 95971994 kcnip3 2.854e-4 0.539 0.039 DMG：Wockner_2014
CG21350153 2 95982371 kcnip3 2.864e-4 0.256 0.039 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4654352 CHR1 29789342 kcnip3 30818 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA2013 0.81 0.81
RNH1 0.79 0.80
C3orf39 0.79 0.80
scyl1 0.78 0.78
格里纳 0.77 0.77
LRRC14 0.77 0.75
dohh 0.77 0.78
ZNF444 0.76 0.81
C11orf68 0.76 0.76
ATG4D 0.76 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.46 -0.38
NSBP1 -0.43 -0.44
AL139819.3 -0.43 -0.43
EIF5B -0.41 -0.45
AC010300.1 -0.41 -0.48
AC090186.1 -0.41 -0.39
MT-ATP8 -0.41 -0.34
AC005921.3 -0.40 -0.44
FAM159B -0.40 -0.57
Sycp3 -0.39 -0.43

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 塔斯 10078534
去：0003714 转录CorePressor活性 塔斯 10078534
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005509 钙离子结合 塔斯 10900016
去：0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去：0005267 钾通道活动 IEA -
去：0005216 离子通道活动 IEA -
去：0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 10078534
去：0006350 转录 IEA -
去：0007165 信号转导 塔斯 10900016
去：0006811 离子运输 IEA -
去：0006813 钾离子运输 IEA -
去：0006915 凋亡 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005794 高尔基体 IEA -
去：0005634 核 IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0005783 内质网 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Biocarta Dream Pathway 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 70 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 142 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔祖先DN 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 1484 1491 1A，M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-125/351 1726年 1733年 1A，M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-218 1262 1269 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-409-3p 1253 1260 1A，M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu