基因页：KCNIP2

概括？
基因 30819
象征 KCNIP2
同义词 Kchip2
描述 钾电源通道相互作用蛋白2
参考 MIM：604661|HGNC：HGNC：15522|Ensembl：ENSG00000120049|HPRD：06880|Vega：Otthumg0000000018937
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24
Pascal P值 8.009e-5

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MS4A6A 0.69 0.79
CD163 0.67 0.75
C3AR1 0.65 0.69
F13A1 0.64 0.73
fcer1g 0.63 0.72
C1QA 0.61 0.75
lyve1 0.61 0.77
FGL2 0.60 0.68
RNASE6 0.60 0.65
Alox5ap 0.60 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UPF3A -0.46 -0.54
SH2B2 -0.43 -0.53
SH3BP2 -0.42 -0.53
Azi1 -0.42 -0.46
SAFB2 -0.41 -0.46
PABPN1 -0.41 -0.47
Glis2 -0.40 -0.47
ZNF311 -0.40 -0.39
尼尔 -0.40 -0.45
ano8 -0.40 -0.43

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005509 钙离子结合 塔斯 11287421
去：0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去：0005250 A型（瞬态）钾通道活动 塔斯 11287421
去：0005267 钾通道活动 IEA -
去：0005216 离子通道活动 IEA -
去：0030955 钾离子结合 IEA -
GO：0046923 ER保留序列结合 nas 11287421
GO：0047485 蛋白质N末端结合 IPI 11287421
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0045163 电压门控钾通道的聚类 艾达 神经元，轴突（GO术语级别：12） 11287421
去：0007268 突触传输 nas 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） 11287421
去：0005513 检测钙离子 塔斯 10676964
去：0007165 信号转导 塔斯 10676964
去：0008016 心脏收缩的调节 塔斯 11287421
去：0006811 离子运输 IEA -
去：0006813 钾离子运输 塔斯 11287421
去：0006936 肌肉收缩 nas 11287421
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 细胞质 艾达 11287421
去：0005886 质膜 IEA -
去：0008076 电压门控钾通道复合物 nas 11287421

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克里希南·弗林（Krishnan Furin）靶向DN 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner ES ICP与H3K4Me3 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-29 337 343 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-326 1108 1115 1A，M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-330 1301 1307 M8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA