概括
基因 30827
象征 CXXC1
同义词 2410002I16RIK | 5830420C16RIK | CFP1 | CGBP | HST2645 | PCCX1 | PHF18 | SPP1 | ZCGPC1 | HCGBP
描述 CXXC手指蛋白1
参考 MIM:609150|HGNC:HGNC:24343|ENSEMBL:ENSG00000154832|HPRD:10852|Vega:Otthumg00000132670
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q12
Pascal P值 0.095
Sherlock P值 0.047
胎儿β 0.962
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 CXXC1 30827 0.01 反式
RS3845734 CHR2 171125572 CXXC1 30827 0.17 反式
RS7787830 CHR7 98797019 CXXC1 30827 0.04 反式
RS16955618 CHR15 29937543 CXXC1 30827 6.117E-6 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XBP1对伴侣基因的反应组激活 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因