基因页:CXXC1
概括?
基因 | 30827 |
象征 | CXXC1 |
同义词 | 2410002I16RIK | 5830420C16RIK | CFP1 | CGBP | HST2645 | PCCX1 | PHF18 | SPP1 | ZCGPC1 | HCGBP |
描述 | CXXC手指蛋白1 |
参考 | MIM:609150|HGNC:HGNC:24343|ENSEMBL:ENSG00000154832|HPRD:10852|Vega:Otthumg00000132670 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q12 |
Pascal P值 | 0.095 |
Sherlock P值 | 0.047 |
胎儿β | 0.962 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CXXC1 | 30827 | 0.01 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | CXXC1 | 30827 | 0.17 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | CXXC1 | 30827 | 0.04 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CXXC1 | 30827 | 6.117E-6 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XBP1对伴侣基因的反应组激活 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |