基因页：NRG1

概括?
GeneID 3084
Symbol NRG1
同义词 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF
描述 neuregulin 1
参考 MIM:142445|HGNC:HGNC:7997|ENSEMBL：ENSG00000157168|HPRD:00802|Vega:OTTHUMG00000163918
Gene type protein-coding
地图位置 8p12
Pascal P值 0.368
Fetal beta 2.612
DMG 1（＃研究）
eGene 梭子基底神经节
支持 NEUROTROPHIN SIGNALING

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
CV：GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association 组合的优势比方法（Sun et al. 2008），协会研究 3 链接到Szgene
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.03086
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.00057
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 31

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg08695336 8 32406150 NRG1 1.26E-10 -0.029 4.83E-7 DMG:Jaffe_2016

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS13278493 8 32492349 NRG1 ENSG00000157168.14 1.54999E-8 0 995447 gtex_brain_putamen_basal
rs13282071 8 32492911 NRG1 ENSG00000157168.14 1.21856E-10 0 996009 gtex_brain_putamen_basal
rs62500238 8 32495429 NRG1 ENSG00000157168.14 6.66311E-9 0 998527 gtex_brain_putamen_basal
rs4543501 8 32496505 NRG1 ENSG00000157168.14 2.76463E-10 0 999603 gtex_brain_putamen_basal

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0003674 molecular_function ND -
去：0003712 transcription cofactor activity IDA 15073182
去：0008083 growth factor activity IEA -
去：0008083 growth factor activity NAS 8096067
GO:0030971 receptor tyrosine kinase binding NAS 1348215|1350381
去：0030297 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activator activity NAS 1348215|1350381
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 NAS neurite (GO term level: 5) -
去：0007399 神经系统的发展 塔斯 neurite (GO term level: 5) 17432114
去：0055007 cardiac muscle cell differentiation ISS -
去：0007154 cell communication 塔斯 17432114
GO:0007219 Notch信号通路 ISS -
GO:0009790 embryonic development IEA -
GO:0014032 neural crest cell development 塔斯 17432114
GO：0042060 伤口愈合 塔斯 16412517
GO:0016481 negative regulation of transcription IDA 15073182
GO:0051048 negative regulation of secretion IDA 10559227
GO:0043496 regulation of protein homodimerization activity 塔斯 16412517
GO:0043497 regulation of protein heterodimerization activity IDA 10559227
GO:0051155 positive regulation of striated muscle cell differentiation ISS -
GO:0030879 mammary gland development 塔斯 17432114
GO:0043624 cellular protein complex disassembly Igi 15155732
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region NAS 1348215|1350381|8096067
GO:0005634 核 IEA -
GO:0016020 膜 NAS -
GO:0016021 integral to membrane IEA -
GO:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AGR途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB4途径 38 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GLYPICAN 1PATHWAY 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB2 ERBB3 PATHWAY 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB NETWORK PATHWAY 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID DELTA NP63 PATHWAY 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 ERBB3信号的反应组下调 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GRB2 EVENTS IN ERBB2 SIGNALING 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K EVENTS IN ERBB4 SIGNALING 38 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SHC1 EVENTS IN ERBB4 SIGNALING 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K EVENTS IN ERBB2 SIGNALING 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome核信号传导 38 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS TURQUOISE UP 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tang衰老TP53靶向 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola蛋黄囊肿瘤 62 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAZAG TGFB1 SIGNALING UP 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAZAG TGFB1 SIGNALING VIA SMAD4 DN 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS MODERATELY DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER C 113 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PRC2 TARGETS 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAKAI TUMOR INFILTRATING MONOCYTES UP 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jeon Smad6靶向 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN PONS MARKERS 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN MEDULLA MARKERS 81 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1 TARGETS DN 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG FOXA2 TARGETS UP 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Le滑雪目标 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CLIMENT BREAST CANCER COPY NUMBER DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
吴阿尔茨海默氏病 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF DN 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOELZEL NF1 TARGETS UP 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因