基因页面:HIVEP1
总结吗?
| GeneID | 3096年 |
| 象征 | HIVEP1 |
| 同义词 | CIRIP | CRYBP1 | GAAP | MBP-1 | PRDII-BF1 | Schnurri-1 | ZAS1 | ZNF40 | ZNF40A |
| 描述 | 人类免疫缺陷病毒1型增强子结合蛋白1 |
| 参考 | MIM: 194540|HGNC: HGNC: 4920|运用:ENSG00000095951|HPRD: 01925|织女:OTTHUMG00000014265 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p24-p22.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.012 |
| 胎儿β | 0.161 |
| DMG | 1(#研究) |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| 认为:Gulsuner_2013 | 全外显子组测序分析 | 155认为被外显子组测序的四三个为一组,或精神分裂症的个人和他们的父母。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0159 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HIVEP1 | chr6 | 12120804 | G | T | NM_002114 | p.259C F > | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Gulsuner_2013 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16797244 | 6 | 12013002 | HIVEP1 | 3.263的军医 | -0.376 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003677 | DNA结合 | 助教 | 2106471 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16713569 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 助教 | 2106471 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 森古普塔鼻咽癌起来 | 294年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RASHI对电离辐射2 | 127年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES核心九相关 | One hundred. | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张IKK抑制剂和肿瘤坏死因子 | 223年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在皮肤伤口THEILGAARD嗜中性粒细胞 | 77年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗CREB1目标了 | One hundred. | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 拉贝风TGFB1目标了 | 102年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LINDSTEDT树突状细胞成熟B | 53 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 冯氏TNF通过P38部分反应 | 160年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 190年 | 196年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 218 | 73年 | 79年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-25/32/92/363/367 | 111年 | 117年 | m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| mir - 381 | 176年 | 182年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 410 | 258年 | 264年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 433 - 3 - p | 116年 | 123年 | 1、m8 | hsa - mir - 433大脑 | AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU |
| mir - 494 | 507年 | 514年 | 1、m8 | hsa - mir - 494大脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
| mir - 496 | 400年 | 406年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |