基因页:Hivep2
概括?
基因 | 3097 |
象征 | Hivep2 |
同义词 | HIV-EP2 | MBP-2 | MIBP1 | SHN2 | ZAS2 | ZNF40B |
描述 | 人类免疫缺陷病毒I型增强剂结合蛋白2 |
参考 | MIM:143054|HGNC:HGNC:4921|ENSEMBL:ENSG00000010818|HPRD:00881|Vega:Otthumg0000000015713 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q23-Q24 |
Pascal P值 | 0.022 |
胎儿β | -0.005 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02888146 | 6 | 143267449 | Hivep2 | 2.54e-9 | -0.011 | 1.88e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG01202751 | 6 | 143248085 | Hivep2 | 2.68e-9 | -0.02 | 1.94E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12327665 | CHR19 | 39622639 | Hivep2 | 3097 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CD74 | 0.79 | 0.86 |
HLA-DPA1 | 0.79 | 0.85 |
HLA-DRB1 | 0.79 | 0.81 |
CBR1 | 0.78 | 0.85 |
FBXO2 | 0.77 | 0.82 |
FAM102A | 0.77 | 0.81 |
CD97 | 0.76 | 0.80 |
我的天啊 | 0.76 | 0.83 |
HLA-DRA | 0.76 | 0.84 |
CA2 | 0.76 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1949 | -0.61 | -0.65 |
tubb2b | -0.60 | -0.69 |
ZNF551 | -0.60 | -0.62 |
AC004017.1 | -0.60 | -0.62 |
nkiras2 | -0.59 | -0.58 |
ZBTB8A | -0.59 | -0.57 |
ZNF300 | -0.59 | -0.59 |
DPYSL3 | -0.58 | -0.54 |
vav2 | -0.58 | -0.61 |
SH3BP2 | -0.58 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 塔斯 | 2022670|2247438 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射2的响应2 | 127 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gottwein的KSHV Mir K12 11 | 63 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 DN相关 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D8 | 40 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 | 65 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38部分的phong TNF响应 | 160 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 891 | 898 | 1A,M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-10 | 1252 | 1258 | M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-124/506 | 240 | 246 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-125/351 | 1327 | 1333 | M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
mir-130/301 | 407 | 414 | 1A,M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
mir-142-5p | 804 | 810 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-155 | 762 | 769 | 1A,M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-186 | 247 | 253 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu | ||||
mir-218 | 1008 | 1014 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-23 | 847 | 853 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-27 | 1560年 | 1566年 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-320 | 444 | 450 | M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa | ||||
mir-324-3p | 1061 | 1067 | M8 | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |
mir-330 | 319 | 325 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-369-3p | 116 | 122 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 116 | 122 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug | ||||
mir-376c | 538 | 544 | M8 | HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg |
mir-381 | 1574年 | 1580 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-409-3p | 890 | 896 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |
mir-493-5p | 452 | 458 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu | ||||
mir-495 | 129 | 135 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
mir-496 | 902 | 909 | 1A,M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 626 | 632 | 1a | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu |