概括
基因 3097
象征 Hivep2
同义词 HIV-EP2 | MBP-2 | MIBP1 | SHN2 | ZAS2 | ZNF40B
描述 人类免疫缺陷病毒I型增强剂结合蛋白2
参考 MIM:143054|HGNC:HGNC:4921|ENSEMBL:ENSG00000010818|HPRD:00881|Vega:Otthumg0000000015713
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q23-Q24
Pascal P值 0.022
胎儿β -0.005
DMG 1(#研究)
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02888146 6 143267449 Hivep2 2.54e-9 -0.011 1.88e-6 DMG:JAFFE_2016
CG01202751 6 143248085 Hivep2 2.68e-9 -0.02 1.94E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12327665 CHR19 39622639 Hivep2 3097 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CD74 0.79 0.86
HLA-DPA1 0.79 0.85
HLA-DRB1 0.79 0.81
CBR1 0.78 0.85
FBXO2 0.77 0.82
FAM102A 0.77 0.81
CD97 0.76 0.80
我的天啊 0.76 0.83
HLA-DRA 0.76 0.84
CA2 0.76 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1949 -0.61 -0.65
tubb2b -0.60 -0.69
ZNF551 -0.60 -0.62
AC004017.1 -0.60 -0.62
nkiras2 -0.59 -0.58
ZBTB8A -0.59 -0.57
ZNF300 -0.59 -0.59
DPYSL3 -0.58 -0.54
vav2 -0.58 -0.61
SH3BP2 -0.58 -0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 塔斯 2022670|2247438
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 nas -
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gottwein的KSHV Mir K12 11 63 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 DN相关 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D8 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 891 898 1A,M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-10 1252 1258 M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-124/506 240 246 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-125/351 1327 1333 M8 HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-130/301 407 414 1A,M8 HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-142-5p 804 810 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-155 762 769 1A,M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-186 247 253 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-218 1008 1014 M8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 847 853 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-27 1560年 1566年 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-320 444 450 M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-324-3p 1061 1067 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-330 319 325 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-369-3p 116 122 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 116 122 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-376c 538 544 M8 HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-381 1574年 1580 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-409-3p 890 896 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-493-5p 452 458 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 129 135 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 902 909 1A,M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 626 632 1a HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu