概括?
基因ID 3099
Symbol HK2
同义词 HKII|HXK2
描述 hexokinase 2
参考 MIM:601125|HGNC:HGNC:4923|Ensembl:ENSG00000159399|HPRD:03080|Vega:OTTHUMG00000129972
基因type protein-coding
地图位置 2p13
Pascal P值 0.539
Fetal beta 0.879
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP targets

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
CV:GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
cg14453704 2 75062130 HK2 3.52E-8 -0.01 1.03E-5 DMG:Jaffe_2016


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HLA-DPA1 0.84 0.84
HLA-DRA 0.82 0.80
CD74 0.80 0.85
HLA-DMB 0.73 0.71
HLA-DMA 0.70 0.69
HLA-DRB1 0.68 0.82
HLA-DRB5 0.66 0.81
HLA-DPB1 0.66 0.76
EVI2B 0.65 0.75
svip 0.65 0.71
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SH3BP2 -0.40 -0.63
KIAA1949 -0.39 -0.56
TUBB2B -0.38 -0.64
TRIM16L -0.38 -0.55
SH2B2 -0.37 -0.63
TRAF4 -0.37 -0.62
CCDC123 -0.37 -0.49
ZNF311 -0.37 -0.54
PPP1R14B -0.37 -0.65
ZNF300 -0.37 -0.51

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FRUCTOSE AND MANNOSE METABOLISM 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg银乳糖代谢 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG STARCH AND SUCROSE METABOLISM 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG AMINO SUGAR AND NUCLEOTIDE SUGAR METABOLISM 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE II DIABETES MELLITUS 47 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPATHWAY 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SLC MEDIATED TRANSMEMBRANE TRANSPORT 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GLUCOSE TRANSPORT 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF CARBOHYDRATES 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL UP 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A TARGETS DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALLUZZI PREVENT MITOCHONDIAL PERMEABILIZATION 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALA OR RALB TARGETS DN 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOYAMA SEMA3B TARGETS UP 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEN SMARCA2 TARGETS DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUROKAWA LIVER CANCER CHEMOTHERAPY DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABBUD LIF SIGNALING 1 DN 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB SIGNALING 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUNO HEMATOPOIESIS 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH DN的响应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEONARD HYPOXIA 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 2HR 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semenza HIF1目标 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD MYC ONCOGENIC SIGNATURE 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN DN 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS UP 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED B LYMPHOCYTE 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION UP 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD2 DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对Troglitazone DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO GONADOTROPHINS UP 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO FORSKOLIN UP 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER UP 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI HYPOXIA 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1 TARGETS VIA AKT1 UP 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标2组 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KASLER HDAC7 TARGETS 1 DN 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 UP 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦克缺氧VHL的目标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN TARGETS OF 611CTF ISOFORM OF ERBB2 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG GATA2 TARGETS DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV RESPONSE TO IR 6HR DN 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因