SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

GeneID	3108
Symbol	HLA-DMA
同义词	D6S222E \| DMA \| HLADM \| RING6
描述	主要的组织相容性复合物，II类，DM alpha
参考	MIM：142855\|HGNC：HGNC：4934\|ENSEMBL：ENSG00000204257\|HPRD：00830\|Vega：Otthumg00000031173
基因类型	蛋白质编码
地图位置	6p21.3
Pascal P值	1.775e-11
胎儿β	-0.857
主持人	小脑半球小脑皮质 Frontal Cortex BA9 伏隔核基底神经节迈尔斯的顺式和跨性别元

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述
简历：Gwascat	全基因组关联研究	This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV:GWASdb	全基因组关联研究	精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	PSR：0.033

Section I. Genetics and epigenetics annotation

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS16825658	CHR1	39395882	HLA-DMA	3108		0.1		反式
RS16901339	CHR5	11169600	HLA-DMA	3108		0.18		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005515	蛋白质结合	IEA		-
去：0005515	蛋白质结合	塔斯		10631952
GO：0032395	MHC class II receptor activity	nas		8034636
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0002504	通过MHC II类的肽或多糖抗原的抗原加工和呈递	IEA		-
GO:0006461	protein complex assembly	IEA		-
GO：0016064	免疫球蛋白介导的免疫反应	IEA		-
GO：0019886	通过MHC II类的抗原加工和外源肽抗原的呈现	IEA		-
去：0008150	生物_Process	ND		-
去：0006955	免疫反应	IEA		-
GO：0051085	伴侣伴侣辅助因子蛋白折叠	IEA		-
去：0015031	蛋白质运输	IEA		-
GO：0050778	免疫反应的阳性调节	IEA		-
GO：0045059	阳性胸腺T细胞选择	IEA		-
GO:0045582	T细胞分化的阳性调节	IEA		-
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005575	cellular_component	ND		-
去：0005622	细胞内	IEA		-
去：0005765	lysosomal membrane	IEA		-
去：0005771	多个身体	IEA		-
GO:0016020	膜	IEA		-
GO:0016021	膜不可或缺	IEA		-
去：0005886	质膜	EXP		11048639\|11827988\|15489916 \|17652306
去：0010008	内体膜	IEA		-
GO：0042613	MHC II类蛋白质复合物	IEA		-
GO：0031902	内体膜晚期	IEA		-

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg细胞粘附分子凸轮	134	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG抗原处理和演示	89	65	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG INTESTINAL IMMUNE NETWORK FOR IGA PRODUCTION	48	36	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG I型糖尿病	44	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Leishmania感染	72	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg哮喘	30	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG AUTOIMMUNE THYROID DISEASE	53	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG系统性红斑狼疮	140	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG同种异体拒绝	38	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG移植与宿主疾病	42	31	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG病毒心肌炎	73	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome MHC II类抗原表现	91	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统	933	616	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome适应性免疫系统	539	350	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤	783	507	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性	351	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标DN	431	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
thum收缩性心力衰竭	423	283	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向DN	384	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAHAM CML QUIESCENT VS NORMAL QUIESCENT DN	47	32	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN	90	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2B	392	251	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI THYROID CANCER CLUSTER 5	13	5	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE DN	32	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
沙诺田顺铂耐药性DN	51	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAN ESCAPE FROM ANOIKIS	24	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞DN	58	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞向上	53	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori成熟B淋巴细胞向上	90	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rozanov MMP14靶向	266	171	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN	65	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
克莱因原发性积液淋巴瘤DN	58	42	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HBV感染的Wieland	101	66	All SZGR 2.0 genes in this pathway
萨那对ifng的回应	78	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yu Myc针对DN	55	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NPM1定位DN的Alcalay AML	184	132	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASSO CD40 SIGNALING UP	101	76	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先	532	309	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee老化新皮层DN	80	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kayo卡路里限制肌肉DN	87	59	All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN	245	144	All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏	487	303	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2向上	428	266	All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙科龋齿	253	147	All SZGR 2.0 genes in this pathway
col13a1抑制tuomisto肿瘤	18	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化沉默	282	183	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaurnier PSMD4目标	73	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
威尔伦斯基对达拉普迪的回应	29	20	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN	216	143	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN	66	42	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP	107	67	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE 35D UP	131	79	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟D	68	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP	1305	895	All SZGR 2.0 genes in this pathway
炎症反应和胆固醇	58	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯	491	316	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上	70	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位	368	247	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kobayashi EGFR信号24小时	101	65	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1	237	159	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gutierrez Waldenstroems大球蛋白血症2	13	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块	721	492	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3	718	401	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nielsen滑膜肉瘤DN	20	13	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上	397	206	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3	430	288	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应	549	316	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim Glis2靶向	84	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向	682	433	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标	321	200	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上	297	194	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上	1839年	928	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：HLA-DMA