基因页:HLA-DOA
概括?
基因 | 3111 |
象征 | HLA-DOA |
同义词 | hla-dna | hla-dza | hladz |
描述 | 主要的组织相容性复合物,II类,DO Alpha |
参考 | MIM:142930|HGNC:HGNC:4936|Ensembl:ENSG00000204252|HPRD:00837|Vega:Otthumg0000000031211 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 5.795E-9 |
胎儿β | -0.848 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HLA-DOA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0032395 | MHC II类受体活性 | 塔斯 | 3000765 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0002504 | 通过MHC II类的肽或多糖抗原的抗原加工和呈递 | IEA | - | |
GO:0019886 | 通过MHC II类的抗原加工和外源肽抗原的呈现 | IEA | - | |
去:0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
GO:0045580 | 调节T细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 经验 | 11048639|11827988|15489916 |17652306 |
|
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 3000765 | |
GO:0042613 | MHC II类蛋白质复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG抗原处理和演示 | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG I型糖尿病 | 44 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg哮喘 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG同种异体拒绝 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG移植与宿主疾病 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaurnier PSMD4目标 | 73 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |