概括
基因 3111
象征 HLA-DOA
同义词 hla-dna | hla-dza | hladz
描述 主要的组织相容性复合物,II类,DO Alpha
参考 MIM:142930|HGNC:HGNC:4936|Ensembl:ENSG00000204252|HPRD:00837|Vega:Otthumg0000000031211
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 5.795E-9
胎儿β -0.848
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0032395 MHC II类受体活性 塔斯 3000765
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0002504 通过MHC II类的肽或多糖抗原的抗原加工和呈递 IEA -
GO:0019886 通过MHC II类的抗原加工和外源肽抗原的呈现 IEA -
去:0006955 免疫反应 IEA -
GO:0045580 调节T细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 经验 11048639|11827988|15489916
|17652306
去:0005886 质膜 塔斯 3000765
GO:0042613 MHC II类蛋白质复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG抗原处理和演示 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG I型糖尿病 44 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg哮喘 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 53 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG同种异体拒绝 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG移植与宿主疾病 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG病毒心肌炎 73 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MHC II类抗原表现 91 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai慢性肝炎与肝癌 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因