基因页：HLA-DOB
概括？
| 基因 | 3112 |
| 象征 | HLA-DOB |
| 同义词 | 多布 |
| 描述 | 主要的组织相容性复合物，II类DO Beta |
| 参考 | MIM：600629|HGNC：HGNC：4937|ENSEMBL：ENSG00000241106|HPRD：08368|Vega：Otthumg0000000031213 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1.306E-5 |
| 胎儿β | -0.045 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2621419 | CHR6 | 32741005 | HLA-DOB | 3112 | 0.02 | 顺式 | ||
| RS719654 | CHR6 | 32752138 | HLA-DOB | 3112 | 0.18 | 顺式 | ||
| RS1044043 | CHR6 | 32793980 | HLA-DOB | 3112 | 0.04 | 顺式 | ||
| RS2856997 | 6 | 32781776 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 4.376E-8 | 0 | -528 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2856995 | 6 | 32783337 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 8.082e-9 | 0 | -2089 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2621326 | 6 | 32783896 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 8.082e-9 | 0 | -2648 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2071469 | 6 | 32784783 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 1.574E-9 | 0 | -3535 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2157077 | 6 | 32785904 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 1.603E-9 | 0 | -4656 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1894408 | 6 | 32786833 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 2.667E-8 | 0 | -5585 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1894407 | 6 | 32787036 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 2.669E-8 | 0 | -5788 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1894406 | 6 | 32787056 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 3.474E-9 | 0 | -5808 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4148876 | 6 | 32796793 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 9.589E-7 | 0 | -15545 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201194354 | 6 | 32796856 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 9.629E-7 | 0 | -15608 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4148875 | 6 | 32796857 | HLA-DOB | ENSG00000241106.2 | 9.622e-7 | 0 | -15609 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0032395 | MHC II类受体活性 | 塔斯 | 2998758 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0002504 | 通过MHC II类的肽或多糖抗原的抗原加工和呈递 | IEA | - | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005764 | 溶酶体 | 艾达 | 8890155 | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 经验 | 11048639|11827988|15489916 |17652306 |
|
| GO：0042613 | MHC II类蛋白质复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG抗原处理和演示 | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IGA生产的KEGG肠道免疫网络 | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG I型糖尿病 | 44 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg哮喘 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG同种异体拒绝 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG移植与宿主疾病 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冬季缺氧DN | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MYC和TFRC的Odonnell目标 | 83 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell转移DN | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yu Myc针对DN | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |