基因页面:HLA-DQA2
总结吗?
| GeneID | 3118年 |
| 象征 | HLA-DQA2 |
| 同义词 | DX-ALPHA | HLA-DXA |
| 描述 | 主要组织相容性复合体II级,DQα2 |
| 参考 | MIM: 613503|HGNC: HGNC: 4943|HPRD: 09982| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 1.698 e-9 |
| 胎儿β | -0.512 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16869851 | chr4 | 20690056 | HLA-DQA2 | 3118年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs114861997 | 6 | 32459359 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.16 e-8 | 0.01 | -249760年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9268849 | 6 | 32429327 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.508 e - | 0.01 | -279792年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268853 | 6 | 32429643 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -279476年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268858 | 6 | 32429758 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -279361年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268860 | 6 | 32429825 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -279294年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268864 | 6 | 32430326 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -278793年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7747529 | 6 | 32431124 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -277995年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268884 | 6 | 32431640 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.864 e - | 0.01 | -277479年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268889 | 6 | 32431886 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.106 e - | 0.01 | -277233年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268905 | 6 | 32432077 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -277042年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268906 | 6 | 32432181 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -276938年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268923 | 6 | 32432835 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -276284年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs544369585 | 6 | 32432992 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -276127年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2395185 | 6 | 32433167 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -275952年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2395186 | 6 | 32433192 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -275927年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268947 | 6 | 32433741 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.299 e - | 0.01 | -275378年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268960 | 6 | 32434130 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.067 e - | 0.01 | -274989年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268961 | 6 | 32434135 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.411 e - | 0.01 | -274984年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268963 | 6 | 32434149 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.066 e - | 0.01 | -274970年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268965 | 6 | 32434240 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.302 e - | 0.01 | -274879年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268969 | 6 | 32434349 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -274770年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9268970 | 6 | 32434361 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -274758年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9391781 | 6 | 32434850 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -274269年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28654725 | 6 | 32435542 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.962 e - | 0.01 | -273577年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28895224 | 6 | 32435556 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.967 e - | 0.01 | -273563年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs77244909 | 6 | 32436240 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.997 e - | 0.01 | -272879年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs76914018 | 6 | 32436250 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.997 e - | 0.01 | -272869年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28895234 | 6 | 32437050 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.071 e - | 0.01 | -272069年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9368725 | 6 | 32438159 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.461 e - | 0.01 | -270960年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9380306 | 6 | 32438298 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.443 e - | 0.01 | -270821年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9368726 | 6 | 32438542 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.404 e - | 0.01 | -270577年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9391877 | 6 | 32438867 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.406 e - | 0.01 | -270252年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9405110 | 6 | 32439108 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.556 e-8 | 0.01 | -270011年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9286790 | 6 | 32439828 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -269291年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9348886 | 6 | 32441008 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -268111年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12215261 | 6 | 32441150 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.252 e - | 0.01 | -267969年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12215313 | 6 | 32441276 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.556 e-8 | 0.01 | -267843年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9405112 | 6 | 32445600 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.61 e - | 0.01 | -263519年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs17209950 | 6 | 32446588 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.696 e - | 0.01 | -262531年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4457186 | 6 | 32447653 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.76 e - | 0.01 | -261466年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs368788863 | 6 | 32451678 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.011 e - | 0.01 | -257441年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71565331 | 6 | 32451693 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.52 e - | 0.01 | -257426年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62405565 | 6 | 32452281 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.022 e - | 0.01 | -256838年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71565340 | 6 | 32452506 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.041 e - | 0.01 | -256613年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34036879 | 6 | 32453336 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.514 e - | 0.01 | -255783年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs150945160 | 6 | 32458463 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.137 e - | 0.01 | -250656年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs181332009 | 6 | 32459293 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.68 e - | 0.01 | -249826年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113541465 | 6 | 32459312 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.428 e - | 0.01 | -249807年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs66919165 | 6 | 32459641 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.706 e - | 0.01 | -249478年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs68060410 | 6 | 32459679 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.557 e - | 0.01 | -249440年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs148630431 | 6 | 32460019 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.295 e - | 0.01 | -249100年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs144441217 | 6 | 32460025 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.368 e - | 0.01 | -249094年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs147402766 | 6 | 32460027 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.028 e - | 0.01 | -249092年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs75127169 | 6 | 32460082 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.007 e - | 0.01 | -249037年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs111499705 | 6 | 32460116 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.757 e - | 0.01 | -249003年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113255123 | 6 | 32460157 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.092 e - | 0.01 | -248962年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113079522 | 6 | 32460170 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.995 e - | 0.01 | -248949年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113666104 | 6 | 32460222 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.243 e - | 0.01 | -248897年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113420629 | 6 | 32470263 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.315 e - | 0.01 | -238856年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs145455664 | 6 | 32470283 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.25 e - | 0.01 | -238836年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113326372 | 6 | 32471095 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.351 e - | 0.01 | -238024年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs115108103 | 6 | 32471599 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.872 e - | 0.01 | -237520年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs142007173 | 6 | 32471635 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.201 e - | 0.01 | -237484年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs201579467 | 6 | 32471799 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.417 e - | 0.01 | -237320年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78827854 | 6 | 32472079 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.448 e - | 0.01 | -237040年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs146213402 | 6 | 32472231 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.12 e - | 0.01 | -236888年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs111992517 | 6 | 32478588 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.922 e - | 0.01 | -230531年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113296631 | 6 | 32478885 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.452 e - | 0.01 | -230234年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs112074290 | 6 | 32479655 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.158 e - | 0.01 | -229464年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113506020 | 6 | 32482261 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.078 e - | 0.01 | -226858年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs112207934 | 6 | 32482293 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.332 e - | 0.01 | -226826年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs115545331 | 6 | 32485051 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.057 e - | 0.01 | -224068年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs151320068 | 6 | 32490243 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.556 e - | 0.01 | -218876年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs182778252 | 6 | 32495761 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.027 e - | 0.01 | -213358年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs146130478 | 6 | 32499213 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.956 e - | 0.01 | -209906年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67509241 | 6 | 32505643 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.282 e - | 0.01 | -203476年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs77931438 | 6 | 32505762 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.934 e - | 0.01 | -203357年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs74945612 | 6 | 32505901 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.051 e - | 0.01 | -203218年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs77891198 | 6 | 32506670 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.626 e - | 0.01 | -202449年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78273580 | 6 | 32506779 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.868 e - | 0.01 | -202340年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78668102 | 6 | 32507091 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.406 e - | 0.01 | -202028年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs143811457 | 6 | 32507112 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.43 e - | 0.01 | -202007年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs115466102 | 6 | 32507168 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.42 e - | 0.01 | -201951年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs150548684 | 6 | 32507293 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.255 e - | 0.01 | -201826年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs149253766 | 6 | 32507305 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.992 e - | 0.01 | -201814年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs76207819 | 6 | 32507365 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.274 e - | 0.01 | -201754年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs111680800 | 6 | 32507452 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.329 e - | 0.01 | -201667年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs114580448 | 6 | 32507538 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.524 e - | 0.01 | -201581年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs79476956 | 6 | 32508173 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.862 e - | 0.01 | -200946年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs75387045 | 6 | 32508213 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.265 e - | 0.01 | -200906年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113686014 | 6 | 32509551 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.812 e - | 0.01 | -199568年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113623173 | 6 | 32510438 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.833 e - | 0.01 | -198681年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs138222522 | 6 | 32510733 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.969 e - | 0.01 | -198386年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| 。 | 6 | 32513624 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.112 e - | 0.01 | -195495年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs28366310 | 6 | 32561128 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.343 e - | 0.01 | -147991年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs28366334 | 6 | 32561895 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.335 e - | 0.01 | -147224年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28366335 | 6 | 32561911 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.335 e - | 0.01 | -147208年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs532953104 | 6 | 32561956 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.327 e - | 0.01 | -147163年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs9271762 | 6 | 32594028 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.26 e - | 0.01 | -115091年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9271769 | 6 | 32594217 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.312 e - | 0.01 | -114902年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9271776 | 6 | 32594341 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.348 e - | 0.01 | -114778年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3104393 | 6 | 32594403 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.338 e - | 0.01 | -114716年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs547619464 | 6 | 32594660 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.379 e - | 0.01 | -114459年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3104389 | 6 | 32595097 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.322 e - | 0.01 | -114022年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9271853 | 6 | 32595117 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.429 e - | 0.01 | -114002年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs557667558 | 6 | 32596838 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.24 e - | 0.01 | -112281年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272025 | 6 | 32598581 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.469 e - | 0.01 | -110538年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs9272335 | 6 | 32604259 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.081 e - | 0.01 | -104860年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272347 | 6 | 32604394 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.727 e - | 0.01 | -104725年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272358 | 6 | 32604538 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.956 e-8 | 0.01 | -104581年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272362 | 6 | 32604564 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.943 e-8 | 0.01 | -104555年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272365 | 6 | 32604621 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.584 e-8 | 0.01 | -104498年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272366 | 6 | 32604622 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.216 e-8 | 0.01 | -104497年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs145314664 | 6 | 32604870 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.585 e - | 0.01 | -104249年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272407 | 6 | 32604931 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.226 e - | 0.01 | -104188年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272412 | 6 | 32604982 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.415 e - | 0.01 | -104137年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272420 | 6 | 32605101 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.341 e - | 0.01 | -104018年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1129735 | 6 | 32605295 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.987 e-8 | 0.01 | -103824年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272435 | 6 | 32605336 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.393 e - | 0.01 | -103783年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272443 | 6 | 32605418 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.638 e - | 0.01 | -103701年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272444 | 6 | 32605419 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.638 e - | 0.01 | -103700年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272463 | 6 | 32605646 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.188 e - | 0.01 | -103473年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272472 | 6 | 32605724 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.179 e - | 0.01 | -103395年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272485 | 6 | 32605972 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.124 e - | 0.01 | -103147年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272486 | 6 | 32605982 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.124 e - | 0.01 | -103137年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| 。 | 6 | 32607197 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.892 e - | 0.01 | -101922年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs9272940 | 6 | 32611081 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.286 e - | 0.01 | -98038年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272951 | 6 | 32611125 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.714 e - | 0.01 | -97994年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272952 | 6 | 32611127 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.723 e - | 0.01 | -97992年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272955 | 6 | 32611145 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.523 e - | 0.01 | -97974年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272957 | 6 | 32611152 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.523 e - | 0.01 | -97967年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1064993 | 6 | 32611181 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.242 e - | 0.01 | -97938年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1065043 | 6 | 32611234 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.537 e - | 0.01 | -97885年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs1065047 | 6 | 32611260 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.581 e - | 0.01 | -97859年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs9272970 | 6 | 32611301 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.666 e - | 0.01 | -97818年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272973 | 6 | 32611312 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.672 e - | 0.01 | -97807年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272980 | 6 | 32611357 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.339 e - | 0.01 | -97762年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272983 | 6 | 32611392 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.418 e - | 0.01 | -97727年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272984 | 6 | 32611393 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.412 e - | 0.01 | -97726年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272987 | 6 | 32611403 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.421 e - | 0.01 | -97716年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272989 | 6 | 32611418 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.388 e - | 0.01 | -97701年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272990 | 6 | 32611427 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.399 e - | 0.01 | -97692年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272995 | 6 | 32611466 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.319 e - | 0.01 | -97653年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9272998 | 6 | 32611474 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.322 e - | 0.01 | -97645年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273002 | 6 | 32611513 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.311 e - | 0.01 | -97606年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273007 | 6 | 32611537 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.231 e - | 0.01 | -97582年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273008 | 6 | 32611572 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.127 e - | 0.01 | -97547年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273009 | 6 | 32611579 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.124 e - | 0.01 | -97540年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273014 | 6 | 32611650 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.127 e - | 0.01 | -97469年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273022 | 6 | 32611737 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.61 e - | 0.01 | -97382年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273031 | 6 | 32611849 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.338 e - | 0.01 | -97270年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273036 | 6 | 32611898 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.312 e - | 0.01 | -97221年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273040 | 6 | 32611958 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.273 e - | 0.01 | -97161年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273042 | 6 | 32611964 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.269 e - | 0.01 | -97155年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273044 | 6 | 32611971 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.268 e - | 0.01 | -97148年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273048 | 6 | 32612008 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.275 e - | 0.01 | -97111年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273062 | 6 | 32612161 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.459 e - | 0.01 | -96958年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273063 | 6 | 32612166 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.459 e - | 0.01 | -96953年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273070 | 6 | 32612241 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.64 e - | 0.01 | -96878年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273071 | 6 | 32612251 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.649 e - | 0.01 | -96868年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273073 | 6 | 32612279 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.697 e - | 0.01 | -96840年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273079 | 6 | 32612326 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.177 e - | 0.01 | -96793年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273093 | 6 | 32612514 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.585 e - | 0.01 | -96605年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273103 | 6 | 32612576 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.5 e - | 0.01 | -96543年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273104 | 6 | 32612595 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.499 e - | 0.01 | -96524年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273107 | 6 | 32612620 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.329 e - | 0.01 | -96499年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273108 | 6 | 32612626 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.327 e - | 0.01 | -96493年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273110 | 6 | 32612633 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.317 e - | 0.01 | -96486年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273111 | 6 | 32612643 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.992 e-8 | 0.01 | -96476年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs199556487 | 6 | 32612747 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.263 e - | 0.01 | -96372年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273138 | 6 | 32612843 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.211 e - | 0.01 | -96276年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273144 | 6 | 32612915 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.28 e - | 0.01 | -96204年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200822213 | 6 | 32612978 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 1.349 e - | 0.01 | -96141年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273149 | 6 | 32612987 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 2.363 e - | 0.01 | -96132年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273154 | 6 | 32613028 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.209 e - | 0.01 | -96091年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273155 | 6 | 32613042 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.172 e - | 0.01 | -96077年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273157 | 6 | 32613052 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.241 e - | 0.01 | -96067年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273159 | 6 | 32613093 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.336 e - | 0.01 | -96026年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273169 | 6 | 32613174 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 8.101 e - | 0.01 | -95945年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273174 | 6 | 32613237 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.387 e - | 0.01 | -95882年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273180 | 6 | 32613306 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.177 e - | 0.01 | -95813年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273182 | 6 | 32613314 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.217 e - | 0.01 | -95805年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9273187 | 6 | 32613376 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.079 e - | 0.01 | -95743年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67297805 | 6 | 32613702 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.347 e - | 0.01 | -95417年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs186269395 | 6 | 32613885 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 3.343 e - | 0.01 | -95234年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs115210925 | 6 | 32614094 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 6.343 e - | 0.01 | -95025年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs114430970 | 6 | 32614158 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 5.755 e - | 0.01 | -94961年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs114700859 | 6 | 32614255 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.797 e - | 0.01 | -94864年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs115906938 | 6 | 32614623 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.459 e - | 0.01 | -94496年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs41269985 | 6 | 32621364 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.504 e - | 0.01 | -87755年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs17613340 | 6 | 32621966 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 9.289 e - | 0.01 | -87153年 | gtex_brain_putamen_basal |
| 。 | 6 | 32631142 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 7.615 e - | 0.01 | -77977年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28746784 | 6 | 32632261 | HLA-DQA2 | ENSG00000237541.3 | 4.575 e - | 0.01 | -76858年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0032395 | MHC II级受体的活动 | NAS | 3036828 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0002504 | 抗原处理和表示的肽或多糖抗原通过MHC II级 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0019882 | 抗原处理和表示 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006955 | 免疫反应 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006955 | 免疫反应 | NAS | 3036828 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 经验值 | 11048639|11827988|15489916 |17652306 |
|
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | NAS | 3036828 | |
| 去:0042613 | MHC II级蛋白质复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG细胞粘附分子凸轮 | 134年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG抗原处理和表示 | 89年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG肠道免疫网络IGA生产 | 48 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG I型糖尿病 | 44 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG利什曼虫感染 | 72年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG哮喘 | 30. | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG系统性红斑狼疮 | 140年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG同种异体移植物排斥反应 | 38 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG移植物抗宿主病 | 42 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG病毒性心肌炎 | 73年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME MHC II级抗原 | 91年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME识别信号 | 54 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME下游细胞信号 | 37 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME CD3和TCRζ链的磷酸化 | 16 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME ZAP - 70免疫突触的易位 | 14 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代的第二信使分子 | 27 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PD1信号 | 18 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME CD28家族聚集有关 | 63年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME干扰素γ信号 | 63年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME干扰素信号 | 159年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME适应性免疫系统 | 539年 | 350年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞因子在免疫系统信号 | 270年 | 204年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒通过甲基化沉默了 | 282年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦凯布受HOXC6 | 469年 | 239年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌子类S1 | 237年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |