概括
基因 3133
象征 HLA-E
同义词 ea1.2 | ea2.1 | hla-6.2 | mhc | qa1
描述 主要的组织相容性复合物,I类,E
参考 MIM:143010|HGNC:HGNC:4962|Ensembl:ENSG00000204592|HPRD:00877|Vega:Otthumg00000031155
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 3.597E-14
Sherlock P值 0.814
胎儿β -1.783
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01462744 6 30457252 HLA-E 7.14e-9 -0.01 3.59E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16850942 CHR3 161898689 HLA-E 3133 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0032393 MHC I类受体活动 塔斯 3260916
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0002474 通过MHC I类抗原加工和肽抗原的呈现 IEA -
GO:0019882 抗原处理和演示 IEA -
去:0006955 免疫反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 经验 11513152
GO:0042612 MHC I类蛋白质复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG抗原处理和演示 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG I型糖尿病 44 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 53 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG同种异体拒绝 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG移植与宿主疾病 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG病毒心肌炎 73 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pastural Riz1靶向 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAN从Anoikis逃脱 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1的Garcia目标 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gnatenko血小板签名 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn alpha响应 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radaeva对IFNA1的响应 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨那对ifng的回应 78 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn伽马响应 71 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Rorie目标 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乔治塔斯HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim LRC3B目标 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞DN 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1的Purbey目标 87 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因