SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

GeneID	3148
Symbol	HMGB2
同义词	HMG2
描述	high mobility group box 2
参考	MIM:163906\|HGNC：HGNC：5000\|HPRD:01229\|
Gene type	protein-coding
地图位置	4q31
Pascal P值	0.203
Sherlock P值	0.49
Fetal beta	2.279
DMG	2（＃研究）
eGene	小脑半球迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

Gene set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG:Nishioka_2013	Genome-wide DNA methylation analysis	The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls.	3
DMG:vanEijk_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 432 differentially methylated CpG sites corresponding to 391 unique transcripts between schizophrenia patients (n=260) and unaffected controls (n=250).	3
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

探测	Chromosome	Position	最近的基因	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
CG13515674	4	174255654	HMGB2		-0.028	0.25	DMG:Nishioka_2013
cg25086702	4	174255559	HMGB2		-0.017	0.95	DMG:Nishioka_2013
cg01324261	4	174320378	HMGB2	0.008	4.503		DMG:vanEijk_2014

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	Gene Entrez ID	PVALUE	qvalue	TSS distance	eQTL type
RS4546623	chr8	98411165	HMGB2	3148		0.18		trans
rs4924458	chr15	40663100	HMGB2	3148		0.09		trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
APEX1	APE \| APE-1 \| APE1 \| APEN \| APEX \| APX \| HAP1 \| REF-1 \| REF1	APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1	-	HPRD	12524539
AR	AIS \|DHTR \|Humara \|KD \|NR3C4 \|SBMA \|smax1 \|TFM	androgen receptor	Reconstituted Complex	BioGRID	9671457
CSNK1A1	CK1 \| HLCDGP1 \| PRO2975	酪蛋白激酶1，α1	-	HPRD，Biogrid	12062430
GZMA	CTLA3 \| HFSP	granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 3)	-	HPRD，Biogrid	11909973
NR3C1	GCCR \| GCR \| GR \| GRL	nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1 (glucocorticoid receptor)	Reconstituted Complex	BioGRID	9671457
PGR	NR3C3 \|PR	孕酮受体	-	HPRD，Biogrid	9671457
POU2F1	OCT1 \|OTF1	POU 2级同型1	-	HPRD	7720710
POU2F2	OCT2 \| OTF2 \| Oct-2	POU 2级HONEOBOX 2	-	HPRD，Biogrid	7720710
POU3F1	OCT6 \| OTF6 \| SCIP	POU 3级同型托博克斯1	-	HPRD	7720710
POU5F1	MGC22487 \| OCT3 \| OCT4 \| OTF3 \| OTF4	POU 5级同型1	-	HPRD，Biogrid	11099378
rag1	MGC43321 \| RNF74	重组激活基因1	-	HPRD，Biogrid	10490593
SET	2pp2a \|i2pp2a \|igaad \|ipp2a2 \|phapii \|taf-i \|taf-ibeta	设置核癌	-	HPRD，Biogrid	11909973
TP53	FLJ92943 \|LFS1 \|trp53 \|p53	tumor protein p53	-	HPRD	11748232

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
BIOCARTA DNAFRAGMENT PATHWAY	10	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SET PATHWAY	11	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡INDUCED DNA FRAGMENTATION	13	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡	148	94	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APOPTOTIC EXECUTION PHASE	54	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP	783	507	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌	294	178	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG RESPONSE TO AZACITIDINE AND TSA DN	70	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应	152	90	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN	310	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS UP	290	177	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILBAN B CLL LPL DN	42	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标	1278	748	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN	459	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN	1375	806	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳	633	376	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN	378	231	该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3	329	196	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN	228	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN	172	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP	117	85	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP	536	340	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MISSIAGLIA REGULATED BY METHYLATION DN	122	67	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHANSSON GLIOMAGENESIS BY PDGFB UP	58	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN	79	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OLSSON E2F3 TARGETS DN	49	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONG E2F3 TARGETS	97	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Eguchi细胞周期RB1目标	23	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ ERYTHROID DIFFERENTIATION	77	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ ERYTHROID DIFFERENTIATION CCNE1	40	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射4的响应4	61	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga e2f1靶标由血清诱导	31	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSTY CERVICAL CANCER PROLIFERATION CLUSTER	140	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP	358	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT NETWORK	168	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK	423	265	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK	1442	892	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK	779	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK	117	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILLIAMS ESR1 TARGETS UP	26	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN	848	527	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN	1024	594	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERREIRA EWINGS SARCOMA UNSTABLE VS STABLE UP	167	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH OCT4 TARGETS	290	172	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES	648	385	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关	100	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 5	18	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI不成熟的B淋巴细胞DN	90	55	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞DN	75	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA修复GENES	230	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向	50	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN	309	206	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标	108	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAKI ADULT T CELL LEUKEMIA	176	122	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP	555	346	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATTACHARYA EMBRYONIC STEM CELL	89	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc的目标	42	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起	87	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B LYMPHOCYTE PROGENITOR	293	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP	131	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞	225	163	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN	234	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径	70	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向	28	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LY AGING PREMATURE DN	30	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZAMORA NOS2 TARGETS UP	69	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D4	55	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP	203	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG DOXORUBICIN RESISTANCE UP	54	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHODES UNDIFFERENTIATED CANCER	69	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 3	101	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN	312	203	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IE86 CMV蛋白的歌曲目标	60	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX TARGETS 1 UP	16	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEISS RESPONSE TO DSRNA UP	38	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIANG SILENCED BY METHYLATION DN	11	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 EXOGENOUS TARGETS DN	120	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
老化老式的DN	56	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC UP	202	115	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan Parp1靶向DN	17	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX TARGETS 2 UP	23	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应	52	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARTIPY NORMAL AT INSULIN RESISTANCE DN	21	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时	40	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向	566	371	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE DN	373	196	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1	528	324	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAIRKEE CANCER PRONE RESPONSE BPA E2	118	65	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌	973	570	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP	863	514	该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞	425	253	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标	425	261	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk男性繁殖Sertoli	28	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP	871	505	该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌	285	167	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP	294	199	该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性	374	247	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN	175	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应	346	192	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP	163	102	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6	456	285	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN	277	166	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST IL6 DEPRIVATION DN	98	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS信号传导DN	72	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISHIDA E2F TARGETS	53	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION UP	178	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN	251	151	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课	605	377	该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心	335	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU APOPTOSIS BY CDKN1A VIA TP53	55	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN	254	158	该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2	182	102	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PANGAS TUMOR SUPPRESSION BY SMAD1 AND SMAD5 DN	157	106	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN	553	343	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化	570	339	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP	364	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reichert有丝分裂LIN9目标	28	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向	279	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 6HR	85	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 24HR	128	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG DOWN BY 2ND EGF PULSE	293	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY	1839年	928	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：HMGB2