概括
基因 3150
象征 HMGN1
同义词 HMG14
描述 高迁移率组核小体结合结构域1
参考 MIM:163920|HGNC:HGNC:4984|Ensembl:ENSG00000205581|HPRD:01231|Vega:Otthumg0000000066178
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.2
Pascal P值 0.013
Sherlock P值 0.713
主持人 尾状基底神经节
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2836921 CHR21 40516069 HMGN1 3150 0.05 顺式
RS8132295 CHR21 40527773 HMGN1 3150 0.07 顺式
RS8132333 CHR21 40527899 HMGN1 3150 0.08 顺式
RS7279497 CHR21 40531305 HMGN1 3150 0 顺式
RS8132424 CHR21 40584411 HMGN1 3150 9.164e-4 顺式
RS2150413 CHR21 40614877 HMGN1 3150 0 顺式
RS2150414 CHR21 40614987 HMGN1 3150 0.01 顺式
RS2150415 CHR21 40615366 HMGN1 3150 0.06 顺式
RS2836956 CHR21 40623017 HMGN1 3150 0 顺式
RS1541102 CHR21 40628764 HMGN1 3150 0.09 顺式
RS2836974 CHR21 40663180 HMGN1 3150 0.06 顺式
RS2735306 CHR21 40713133 HMGN1 3150 0.1 顺式
RS2836992 CHR21 40735605 HMGN1 3150 0 顺式
RS7279497 CHR21 40531305 HMGN1 3150 0.15 反式
RS8132424 CHR21 40584411 HMGN1 3150 0.07 反式
RS2150413 CHR21 40614877 HMGN1 3150 0.17 反式
RS2836956 CHR21 40623017 HMGN1 3150 0.1 反式
RS2836992 CHR21 40735605 HMGN1 3150 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta P38MAPK途径 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dawson TCL1中的甲基化 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wong IFNA2电阻DN 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫雷拉对TSA的反应 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤4小时 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发 166 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kamminga衰老 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因