基因页:HMGN1
概括?
基因 | 3150 |
象征 | HMGN1 |
同义词 | HMG14 |
描述 | 高迁移率组核小体结合结构域1 |
参考 | MIM:163920|HGNC:HGNC:4984|Ensembl:ENSG00000205581|HPRD:01231|Vega:Otthumg0000000066178 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.2 |
Pascal P值 | 0.013 |
Sherlock P值 | 0.713 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2836921 | CHR21 | 40516069 | HMGN1 | 3150 | 0.05 | 顺式 | ||
RS8132295 | CHR21 | 40527773 | HMGN1 | 3150 | 0.07 | 顺式 | ||
RS8132333 | CHR21 | 40527899 | HMGN1 | 3150 | 0.08 | 顺式 | ||
RS7279497 | CHR21 | 40531305 | HMGN1 | 3150 | 0 | 顺式 | ||
RS8132424 | CHR21 | 40584411 | HMGN1 | 3150 | 9.164e-4 | 顺式 | ||
RS2150413 | CHR21 | 40614877 | HMGN1 | 3150 | 0 | 顺式 | ||
RS2150414 | CHR21 | 40614987 | HMGN1 | 3150 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2150415 | CHR21 | 40615366 | HMGN1 | 3150 | 0.06 | 顺式 | ||
RS2836956 | CHR21 | 40623017 | HMGN1 | 3150 | 0 | 顺式 | ||
RS1541102 | CHR21 | 40628764 | HMGN1 | 3150 | 0.09 | 顺式 | ||
RS2836974 | CHR21 | 40663180 | HMGN1 | 3150 | 0.06 | 顺式 | ||
RS2735306 | CHR21 | 40713133 | HMGN1 | 3150 | 0.1 | 顺式 | ||
RS2836992 | CHR21 | 40735605 | HMGN1 | 3150 | 0 | 顺式 | ||
RS7279497 | CHR21 | 40531305 | HMGN1 | 3150 | 0.15 | 反式 | ||
RS8132424 | CHR21 | 40584411 | HMGN1 | 3150 | 0.07 | 反式 | ||
RS2150413 | CHR21 | 40614877 | HMGN1 | 3150 | 0.17 | 反式 | ||
RS2836956 | CHR21 | 40623017 | HMGN1 | 3150 | 0.1 | 反式 | ||
RS2836992 | CHR21 | 40735605 | HMGN1 | 3150 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HMGN1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta P38MAPK途径 | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU血管生成DN | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dawson TCL1中的甲基化 | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wong IFNA2电阻DN | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫雷拉对TSA的反应 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU遗传毒性损伤4小时 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kamminga衰老 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤 | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |