基因Page:HMMR

概括?
基因ID 3161
Symbol HMMR
同义词 CD168|IHABP|RHAMM
描述 透明质酸介导的运动受体
参考 MIM:600936|HGNC:HGNC:5012|Ensembl:ENSG00000072571|HPRD:02963|Vega：Otthumg00000130381
基因type protein-coding
地图位置 5q34
Pascal P值 0.226
Fetal beta 1.179
DMG 1（＃研究）
eGene Meta

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:vanEijk_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 432 differentially methylated CpG sites corresponding to 391 unique transcripts between schizophrenia patients (n=260) and unaffected controls (n=250). 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00459
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01718

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg19545851 5 162887280 HMMR 0.002 1.762 DMG:vanEijk_2014


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HNRNPD 0.96 0.96
NCL 0.96 0.96
HNRNPH3 0.95 0.95
RBM8A 0.95 0.94
IK 0.94 0.95
HNRNPH1 0.94 0.95
SFRS4 0.94 0.94
luc7l2 0.94 0.94
SNW1 0.94 0.94
HNRNPR 0.93 0.94
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HLA-F -0.71 -0.78
AF347015.31 -0.71 -0.84
TSC22D4 -0.70 -0.80
IFI27 -0.69 -0.84
FXYD1 -0.69 -0.83
AF347015.27 -0.69 -0.82
MT-CO2 -0.69 -0.83
C5orf53 -0.69 -0.71
ALDOC -0.68 -0.72
AF347015.33 -0.68 -0.81

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004872 receptor activity IEA -
GO:0005540 透明质酸结合 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0009986 cell surface IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HYALURONAN UPTAKE AND DEGRADATION 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HYALURONAN METABOLISM 14 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF CARBOHYDRATES 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SOTIRIOU BREAST CANCER GRADE 1 VS 3 UP 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP 73 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ODONNELL TFRC TARGETS DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIBETTA KDM5B TARGETS DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT UP 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAYBURD RESPONSE TO L663536 DN 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONG E2F3 TARGETS 97 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOV MUTATED IN COLON CANCER 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSTY CERVICAL CANCER PROLIFERATION CLUSTER 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF SIGNALING NOT VIA AKT1 48HR DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF TARGETS INDUCED BY AKT1 48HR DN 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT NETWORK 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE UP 86 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI不成熟的BLYMPHOCYTE DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JECHLINGER EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE UP 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STONER ESOPHAGEAL CARCINOGENESIS DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SU TESTIS 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS UP 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG DOXORUBICIN RESISTANCE UP 54 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 24HR 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P6 91 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS EMT UP 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CYCLING GENES 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE EARLY T LYMPHOCYTE UP 107 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标DN 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED DENDRITIC CELL 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST IL6 DEPRIVATION DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP 87 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G2 M 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1增长目标 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reichert有丝分裂LIN9目标 28 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROESSLER LIVER CANCER METASTASIS UP 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV RESPONSE TO IR 6HR DN 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 24HR 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因