基因页：hnrnpc
概括？
| 基因 | 3183 |
| 象征 | hnrnpc |
| 同义词 | c1 | c2 | hnrnp | hnrpc | snrpc |
| 描述 | 异质性核核糖核蛋白C（C1/C2） |
| 参考 | MIM：164020|HGNC：HGNC：5035|Ensembl：ENSG0000000092199|HPRD：01243|Vega：Otthumg00000170757 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.244 |
| Sherlock P值 | 0.014 |
| 胎儿β | 0.485 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003723 | RNA结合 | nas | 9731529 | |
| GO：0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 16189514 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | 经验 | 12226669 | |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | 我知道了 | 9731529 | |
| 去：0008380 | RNA剪接 | 塔斯 | 3110598 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005681 | 剪接体 | 艾达 | 9731529 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AP1M1 | AP47 |clapm2 |cltnm |mu-1a | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1，MU 1亚基 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| CCDC85B | dipa | 包含85b | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| CNBP | CNBP1 |DM2 |FLJ11631 |Promm |RNF163 |ZCCHC22 |Znf9 | CCHC型锌指，核酸结合蛋白 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| FXR2 | FMR1L2 | 脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 9516488 |
| hnrnpc | C1 |C2 |hnrnp |HNRPC |MGC104306 |MGC105117 |MGC117353 |MGC131677 |SNRPC | 异质性核核糖核蛋白C（C1/C2） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10772858|16189514 |
| KPNA3 | IPOA4 |srp1gamma |srp4 |HSRP1 | 核桃蛋白α3（importin alpha 4） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| 克拉斯 | C-K-Ras |k-ras2a |k-ras2b |k-ras4a |k-ras4b |ki-ras |Kras1 |Kras2 |NS3 |rask2 | V-KI-RAS2 Kirsten大鼠肉瘤病毒性癌基因同源物 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| LMO3 | dat1 |MGC26081 |rbtn3 |rbtnl2 |Rhom3 |Rhom-3 | Lim域仅3（菱形素状2） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| 我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PDGFB | FLJ12858 |PDGF2 |sis |SSV |c-sis | 血小板衍生的生长因子β多肽（Simian肉瘤病毒（V-SIS）癌基因同源物） | - | HPRD | 10409733 |
| PHKB | DKFZP781E15103 |FLJ41698 | 磷酸化酶激酶，β | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PIN1 | 国防部|UBL5 | 肽基丙基顺式/反式异构酶，NIMA相互作用1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PUF60 | fir |FLJ31379 |robpi |siahbp1 | poly-U结合剪接因子60kDa | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| ralyl | HNRPCL3 | RALY RNA结合蛋白样 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| RBM41 | FLJ11016 |FLJ13670 |BB383K5.1 | RNA结合基序蛋白41 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| SFRS12 | DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 | 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富集12 | - | HPRD | 14559993 |
| ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I（UBC9同源物，酵母） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| ZNF581 | FLJ22550 |HSPC189 | 锌指蛋白581 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID端粒酶途径 | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA剪接 | 111 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Laiho结直肠癌锯齿状 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤上的theilgaard中性粒细胞 | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对Cantharidin DN的反应 | 69 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kyng环境应力响应不是WS中的4NQO | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng环境应力反应DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠与直肠癌 | 38 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshioka肝癌早期复发 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kumar自噬网络 | 71 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-208 | 553 | 559 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
| mir-224 | 254 | 260 | 1a | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
| mir-299-5p | 650 | 656 | 1a | HSA-MIR-299-5P | ugguuuaccgucccacauacau |
| mir-320 | 411 | 417 | M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-455 | 1 | 7 | 1a | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |
| mir-499 | 552 | 559 | 1A，M8 | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |