基因页面:HNRNPU
总结吗?
| GeneID | 3192年 |
| 象征 | HNRNPU |
| 同义词 | HNRNPU-AS1 | HNRPU | SAF-A SAFA | | U21.1 | hnRNP U |
| 描述 | 异构核核糖核蛋白U(支架附件因素) |
| 参考 | MIM: 602869|HGNC: HGNC: 5048|运用:ENSG00000153187|运用:ENSG00000188206|HPRD: 04185|织女:OTTHUMG00000040396 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 q44 |
| 夏洛克假定值 | 0.057 |
| 胎儿β | 1.485 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg24517768 | 1 | 245028012 | HNRNPU | 9.5 e-11 | -0.01 | 4.49 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10035168 | chr5 | 5974295 | HNRNPU | 3192年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MAB21L2 | 0.95 | 0.07 |
| IRX2 | 0.84 | -0.11 |
| IRX1 | 0.67 | -0.06 |
| WFIKKN2 | 0.58 | 0.08 |
| NRP1 | 0.54 | 0.04 |
| ROBO3 | 0.54 | 0.13 |
| PRDM6 | 0.49 | 0.06 |
| TMC5 | 0.42 | 0.08 |
| ROR2 | 0.38 | 0.18 |
| MXRA5 | 0.36 | 0.15 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| WDR53 | -0.11 | -0.21 |
| AP1S2 | -0.10 | -0.20 |
| RALYL | -0.10 | -0.21 |
| ZNF860 | -0.10 | -0.32 |
| RPL36AL | -0.09 | -0.21 |
| ZNF230 | -0.09 | -0.29 |
| IER5L | -0.09 | -0.10 |
| GIN1 | -0.09 | -0.20 |
| DNAJB6 | -0.09 | -0.29 |
| PDCL3 | -0.09 | -0.26 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003676 | 核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003677 | DNA结合 | 助教 | 1628625 | |
| 去:0003723 | 核糖核酸绑定 | 助教 | 1628625 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17220478 | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000398 | 通过剪接体核信使rna剪接 | 经验值 | 12226669 | |
| 去:0008380 | RNA拼接 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005681 | 剪接体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009986 | 细胞表面 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030529 | 核糖核蛋白复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030530 | 异构核核糖核蛋白复杂 | 助教 | 7509195 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ACTB | PS1TP5BP1 | 肌动蛋白,β | ACTB (beta-actin)与HNRPU (hnRNP U)。 | 绑定 | 15711563 |
| CDK7 | CAK1 | CDKN7 | MO15 | STK1 | p39MO15 | 细胞周期蛋白依赖性激酶7 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490622 |
| CR2 | C3DR | CD21 |表征SLEB9 | 补充组件(3 d / eb病毒)受体2 | p120RNP与CR2交互。 | 绑定 | 7753047 |
| l形的 | C19orf17 | DKFZp434I1916 | ELL1 |男人 | RNA聚合酶II伸长因素 | - - - - - - | HPRD | 10490622 |
| EP300 | KAT3B | p300 | E1A结合蛋白p300 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11909954 |
| GRIN1 | NMDA1 | NMDAR1 | NR1 | 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 | - - - - - - | HPRD | 10862698 |
| GTF2F1 | BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽74 kda | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490622 |
| GTF2H1 | BTF2 | TFB1 | TFIIH | 通用转录因子颅内高压症,多肽1,62 kda | - - - - - - | HPRD | 10490622 |
| NDN | HsT16328 | PWCR | necdin同族体(鼠标) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11813259 |
| NR3C1 | GCCR | GCR | GR | GRL | 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9353307 |
| POLR2A | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490622 |
| POU3F4 | BRAIN-4 | BRN4 | DFN3 | DFNX2 | OTF9 | POU类3同源框4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9105675 |
| PRMT1 | ANM1 | HCP1 | HRMT1L2 | IR1B4 | 蛋白质精氨酸甲基转移酶1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11850402 |
| SFN | YWHAS | stratifin | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 15778465 |
| SFRS12 | DKFZp564B176 | MGC133045 | SRrp508 | SRrp86 | 剪接因子,精氨酸/ serine-rich 12 | - - - - - - | HPRD | 14559993 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG剪接体 | 128年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME处理限制包含前信使rna基因内区 | 140年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME MRNA加工 | 161年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME信使rna剪接 | 111年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VECCHI胃癌早期 | 430年 | 232年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名1 | 380年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 百度转移了 | 214年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HAHTOLA蕈样皮肤 | 177年 | 113年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| OUELLET卵巢癌浸润性对LMP | 117年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3运输大亨 | 64年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落低剂量紫外线反应通过ERCC3 XPCS | 18 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯塔克HYPPOCAMPUS 22 q11删除 | 53 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标1 DN | 169年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DORSAM HOXA9目标了 | 35 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MANALO缺氧DN | 289年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 白细胞介素6 BROCKE凋亡发生逆转 | 144年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FAELT B CLL VH重组DN | 48 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SESTO应对紫外线C2 | 54 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染14小时血巨细胞病毒DN | 298年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒DN | 504年 | 323年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 犹太人的紫外响应集群D6 | 37 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周肿瘤坏死因子信号30分钟 | 54 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAMASWAMY转移了 | 66年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌穷人生存DN | 22 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张乳腺癌的祖细胞 | 425年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张及目标36小时DN | 185年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 酒井法子慢性肝炎和肝癌 | 83年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌子类S2 | 115年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STAMBOLSKY TP53突变的目标 | 49 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JUBAN SPI1和FLI1 DN的目标 | 92年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOLLEMAN长春新碱耐药B DN | 15 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOLLEMAN长春新碱抵抗所有的DN | 19 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-1/206 | 86年 | 93年 | 1、m8 | hsa-miR-1 | UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA |
| hsa - mir - 206深圳 | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| hsa - mir - 613 | AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC | ||||
| mir - 101 | 855年 | 861年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| mir - 122 | 475年 | 482年 | 1、m8 | hsa - mir - 122 a | UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU |
| miR-132/212 | 55 | 61年 | m8 | hsa - mir - 212深圳 | UAACAGUCUCCAGUCACGGCC |
| hsa - mir - 132大脑 | UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG | ||||
| mir - 135 | 1421年 | 1427年 | m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 142 - 5 - p | 1102年 | 1108年 | 1 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
| mir - 144 | 854年 | 861年 | 1、m8 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| mir - 150 | 1307年 | 1313年 | 1 | hsa - mir - 150 | UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG |
| mir - 186 | 62年 | 68年 | 1 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU | ||||
| miR-19 | 1525年 | 1532年 | 1、m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 200 bc / 429 | 234年 | 240年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| miR-21 | 901年 | 907年 | 1 | hsa-miR-21大脑 | UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA |
| hsa - mir - 590 | GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG | ||||
| mir - 214 | 979年 | 986年 | 1、m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| mir - 224 | 269年 | 275年 | m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
| miR-23 | 266年 | 272年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-25/32/92/363/367 | 1040年 | 1046年 | 1 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| miR-30-3p | 741年 | 747年 | 1 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| mir - 323 | 266年 | 272年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 330 | 309年 | 315年 | m8 | hsa - mir - 330大脑 | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
| mir - 409 - 3 - p | 85年 | 91年 | m8 | hsa - mir - 409 - 3 - p | CGAAUGUUGCUCGGUGAACCCCU |
| mir - 433 - 3 - p | 439年 | 445年 | 1 | hsa - mir - 433大脑 | AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU |
| mir - 495 | 1033年 | 1039年 | m8 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
| mir - 496 | 655年 | 661年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |
| mir - 539 | 28 | 34 | m8 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |
| hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU | ||||
| mir - 542 - 3 - p | 383年 | 389年 | 1 | hsa - mir - 542 - 3 - p | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |