基因页：Hoxa1

概括？
基因 3198
象征 Hoxa1
同义词 BSA | HOX1 | HOX1F
描述 Homeobox A1
参考 MIM：142955|HGNC：HGNC：5099|Ensembl：ENSG00000105991|HPRD：00843|Vega：Otthumg00000023207
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p15.3
Pascal P值 0.878
胎儿β 0.052
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG15218775 7 27135679 Hoxa1 4.16e-8 -0.009 1.16e-5 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 IEA -
去：0003702 RNA聚合酶II转录因子活性 塔斯 7622051
GO：0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 塔斯 7622051
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌2小时DN 88 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇6 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7p15 Amplicon 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木对TSA和Decitabine 1B的反应 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheng由雌二醇印记 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应和PML RARA FUSION 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schraets MLL靶向 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王NFKB目标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 180 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 578 584 M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-142-5p 540 546 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-181 909 916 1A，M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-203.1 1196 1203 1A，M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-210 952 958 1a HSA-MIR-210 cugugcgugugugacagcggcuga
mir-218 60 66 M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-219 1036 1042 1a HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-23 890 896 M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-28 128 134 M8 HSA-MIR-28脑 Aaggagcucacagucuauugag
mir-30-5p 451 458 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 889 896 1A，M8 HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-369-3p 1283 1289 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 1283 1290 1A，M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-433-3p 1039 1046 1A，M8 HSA-MIR-433脑 aucaugauggggcuccucggugu
mir-493-5p 1033 1039 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-99/100 1088 1094 M8 HSA-MIR-99A脑 AACCCGUAGAUCCGAUCUUGUG
HSA-MIR-100脑 AACCCGUAGAUCCGAACUUGUG
HSA-MIR-99B脑 cacccguagaaccgaccuugcg