基因页:Hoxa11
概括?
基因 | 3207 |
象征 | Hoxa11 |
同义词 | HOX1 | HOX1I | RUSAT1 |
描述 | Homeobox A11 |
参考 | MIM:142958|HGNC:HGNC:5101|Ensembl:ENSG00000005073|HPRD:00846|Vega:Otthumg0000000023437 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p15.2 |
Pascal P值 | 0.023 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15623480 | 7 | 27224343 | Hoxa11as; Hoxa11 | 1.35E-5 | -0.515 | 0.014 | DMG:Wockner_2014 |
CG15760840 | 7 | 27225222 | Hoxa11 | 6.46e-8 | -0.015 | 1.6e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HOXA11_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
myllykangas放大热点29 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7p15 Amplicon | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮DN靶标 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时DN | 56 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染8小时DN | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk植入和子宫 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Frasor对Serm或Fulvestrant DN的响应 | 50 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李·威尔姆斯肿瘤 | 27 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇8的时间反应8 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |