概括
基因 3207
象征 Hoxa11
同义词 HOX1 | HOX1I | RUSAT1
描述 Homeobox A11
参考 MIM:142958|HGNC:HGNC:5101|Ensembl:ENSG00000005073|HPRD:00846|Vega:Otthumg0000000023437
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p15.2
Pascal P值 0.023
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15623480 7 27224343 Hoxa11as; Hoxa11 1.35E-5 -0.515 0.014 DMG:Wockner_2014
CG15760840 7 27225222 Hoxa11 6.46e-8 -0.015 1.6e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
myllykangas放大热点29 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7p15 Amplicon 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yao Hoxa10通过孕酮DN靶标 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时DN 56 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时DN 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk植入和子宫 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对Serm或Fulvestrant DN的响应 50 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李·威尔姆斯肿瘤 27 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 102 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇8的时间反应8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因