基因页：HOXB9
概括？
| 基因 | 3219 |
| 象征 | HOXB9 |
| 同义词 | HOX-2.5 | HOX2 | HOX2E |
| 描述 | Homeobox B9 |
| 参考 | MIM：142964|HGNC：HGNC：5120|ENSEMBL：ENSG00000170689|HPRD：00852|Vega：Otthumg00000159907 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q21.3 |
| Pascal P值 | 0.535 |
| 胎儿β | -0.242 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：1.979 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04917446 | 17 | 46699073 | HOXB9 | 1.291E-4 | -0.494 | 0.03 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | nas | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10617598 | |
| GO：0016563 | 转录激活剂活性 | IEA | - | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | nas | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | nas | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | nas | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 总ELK3靶向DN | 32 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer Sox9在前列腺开发中的目标 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HANN对BCL2抑制剂的抗性 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-129-5p | 1715年 | 1721年 | 1a | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
| mir-151 | 567 | 573 | 1a | HSA-MIR-151脑 | Acuagacugaagcucuugagg |
| mir-495 | 1685年 | 1691年 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |