基因页：APBB2
Summary？
| 基因 | 323 |
| 象征 | APBB2 |
| 同义词 | Fe65l | Fe65l1 |
| Description | 淀粉样β前体蛋白结合家族B成员2 |
| Reference | MIM：602710|HGNC：HGNC：582|Ensembl：ENSG00000163697|HPRD:04088|Vega：Otthumg00000160416 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4P13 |
| Pascal P值 | 0.953 |
| 胎儿β | 0.768 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07291349 | 4 | 40964962 | APBB2 | 6.75E-7 | 0.539 | 0.007 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AL360181.5 | 0.49 | 0.40 |
| PCBP3 | 0.49 | 0.38 |
| esyt3 | 0.49 | 0.41 |
| ABCA7 | 0.48 | 0.42 |
| KCNH6 | 0.48 | 0.41 |
| SPTBN5 | 0.48 | 0.40 |
| Sox13 | 0.47 | 0.46 |
| MYH15 | 0.46 | 0.45 |
| EPS8L2 | 0.46 | 0.45 |
| SPATA20 | 0.46 | 0.40 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PPAPR5 | -0.25 | -0.21 |
| ZNF238 | -0.25 | -0.19 |
| Neurod6 | -0.25 | -0.26 |
| klhl1 | -0.25 | -0.17 |
| RPL5 | -0.24 | -0.25 |
| RPL35A | -0.24 | -0.34 |
| DACT1 | -0.24 | -0.17 |
| RPL38 | -0.24 | -0.35 |
| GPR22 | -0.24 | -0.22 |
| AC005768.1 | -0.24 | -0.20 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0001540 | beta-amyloid binding | ISS | - | |
| 去：0008134 | 转录因子结合 | ISS | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007242 | 细胞内信号传导级联 | nas | 8855266 | |
| 去：0007050 | cell cycle arrest | ISS | - | |
| 去：0030308 | 细胞生长的负调控 | ISS | - | |
| GO：0045749 | 有丝分裂细胞周期的S相的负调控 | ISS | - | |
| GO:0045449 | 转录的调节 | ISS | - | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0030426 | 生长锥 | ISS | Axon，Dendrite（GO期限：5） | - |
| GO:0045202 | 突触 | ISS | Synap神经元,神经递质,神经胶质(level: 2) | - |
| 去：0005634 | nucleus | ISS | - | |
| 去：0016020 | membrane | nas | 8855266 | |
| GO：0030027 | 薄片 | ISS | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 795 | 801 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 795 | 801 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124brain | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-141/200a | 131 | 138 | 1A，M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| miR-153 | 913 | 919 | 1a | HSA-MIR-153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 409 | 415 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| hsa-miR-20abrain | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa-miR-106a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa-miR-106bSZ | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20bSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-22 | 813 | 819 | 1a | hsa-miR-22brain | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-31 | 157 | 164 | 1A，M8 | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| mir-330 | 97 | 103 | M8 | hsa-miR-330brain | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
| mir-448 | 912 | 919 | 1A，M8 | hsa-miR-448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| miR-542-3p | 381 | 388 | 1A，M8 | HSA-MIR-542-3P | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |