概括
基因 3231
象征 HOXD1
同义词 HOX4 | HOX4G | HOX-4.7
描述 HONEOBOX D1
参考 MIM:142987|HGNC:HGNC:5132|ENSEMBL:ENSG00000128645|HPRD:00870|Vega:Otthumg00000132512
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31.1
Pascal P值 0.033
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MDH1 0.92 0.93
GHITM 0.91 0.92
serpini1 0.91 0.90
ATP6V1E1 0.91 0.92
chn1 0.91 0.83
got1 0.90 0.93
gabarapl3 0.90 0.92
NAPB 0.89 0.90
Glrb 0.89 0.88
CCNDBP1 0.89 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMTN -0.51 -0.52
SH3BP2 -0.50 -0.53
FADS2 -0.50 -0.41
SEMA4B -0.49 -0.43
SH2D2A -0.49 -0.49
NME4 -0.48 -0.56
FAM59B -0.48 -0.45
cdc42ep4 -0.47 -0.44
透明2 -0.47 -0.46
Bcl7c -0.47 -0.51

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
奥多内尔转移 82 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇5 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦加维因结肠癌的甲基化沉默 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因