基因页:HOXD1
概括?
基因 | 3231 |
象征 | HOXD1 |
同义词 | HOX4 | HOX4G | HOX-4.7 |
描述 | HONEOBOX D1 |
参考 | MIM:142987|HGNC:HGNC:5132|ENSEMBL:ENSG00000128645|HPRD:00870|Vega:Otthumg00000132512 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q31.1 |
Pascal P值 | 0.033 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HOXD1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MDH1 | 0.92 | 0.93 |
GHITM | 0.91 | 0.92 |
serpini1 | 0.91 | 0.90 |
ATP6V1E1 | 0.91 | 0.92 |
chn1 | 0.91 | 0.83 |
got1 | 0.90 | 0.93 |
gabarapl3 | 0.90 | 0.92 |
NAPB | 0.89 | 0.90 |
Glrb | 0.89 | 0.88 |
CCNDBP1 | 0.89 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMTN | -0.51 | -0.52 |
SH3BP2 | -0.50 | -0.53 |
FADS2 | -0.50 | -0.41 |
SEMA4B | -0.49 | -0.43 |
SH2D2A | -0.49 | -0.49 |
NME4 | -0.48 | -0.56 |
FAM59B | -0.48 | -0.45 |
cdc42ep4 | -0.47 | -0.44 |
透明2 | -0.47 | -0.46 |
Bcl7c | -0.47 | -0.51 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇5 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦加维因结肠癌的甲基化沉默 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC目标DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |