基因页：生命值

Summary？
基因 3240
象征 生命值
Synonyms BP|HP2ALPHA2|HPA1S
Description Haptoglobin
Reference MIM：140100|HGNC：HGNC：5141|ENSEMBL：ENSG00000257017|HPRD：00772|Vega：Otthumg00000173009
基因类型 蛋白质编码
地图上的位置 16Q22.2
Pascal P值 0.3
Sherlock p-value 0.893
胎儿β -0.927
DMG 1(# studies)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
Frontal Cortex BA9
伏隔核基底神经节
Myers' cis & trans
元

Gene in Data Sources
基因集名称 基因的方法设置 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 A combined odds ratio method (Sun等。2008), association studies 2 链接到Szgene
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizotypy,schizophrenias,schizotypal 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
Network Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：31

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
cg09584711 16 72096944 生命值 1.153E-4 -6.894 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4788579 CHR16 71951844 生命值 3240 0 顺式
RS12708919 CHR16 71986994 生命值 3240 0.01 顺式
RS9925462 CHR16 72000194 生命值 3240 8.622E-9 顺式
rs1667060 CHR2 2945454 生命值 3240 0.13 反式
RS5009574 CHR2 4963368 生命值 3240 0.19 反式
rs17026940 CHR2 86342788 生命值 3240 0.16 反式
RS7340510 CHR2 134267368 生命值 3240 0.01 反式
rs6730679 CHR2 134282345 生命值 3240 0.01 反式
RS11929728 CHR4 6145405 生命值 3240 0.16 反式
RS1511040 CHR4 13913575 生命值 3240 0.03 反式
rs16848149 CHR4 73443003 生命值 3240 0.01 反式
RS1426729 CHR4 100671473 生命值 3240 0.19 反式
RS680474 CHR5 15515788 生命值 3240 0.08 反式
RS9381511 CHR6 12931447 生命值 3240 0.02 反式
rs12663450 CHR6 38135729 生命值 3240 0.05 反式
RS1381599 CHR7 46340766 生命值 3240 0.03 反式
RS6970701 CHR7 93087543 生命值 3240 0.17 反式
rs12111850 CHR7 93126467 生命值 3240 0.17 反式
rs6949752 CHR7 93138081 生命值 3240 0.17 反式
RS17165529 CHR7 93144582 生命值 3240 0.17 反式
RS1336572 Chr9 254326 生命值 3240 0.03 反式
RS13289308 Chr9 8971665 生命值 3240 0.11 反式
RS17038857 CHR12 107300920 生命值 3240 4.763E-4 反式
RS1457420 CHR14 66958675 生命值 3240 0.17 反式
RS17137819 CHR16 5372534 生命值 3240 0.13 反式
RS16958302 CHR16 57647432 生命值 3240 0.01 反式
RS4788579 CHR16 71951844 生命值 3240 0.18 反式
RS9925462 CHR16 72000194 生命值 3240 2.078E-6 反式
RS17001072 CHR19 11099774 生命值 3240 0.14 反式
RS6100270 CHR20 57487204 生命值 3240 0.04 反式
RS7185215 16 72034864 生命值 ENSG00000257017.4 4.687E-6 0 -55196 gtex_brain_ba24
RS11648003 16 72052348 生命值 ENSG00000257017.4 9.821E-8 0 -37712 gtex_brain_ba24
rs12924886 16 72075593 生命值 ENSG00000257017.4 4.873E-8 0 -14467 gtex_brain_ba24
RS35283911 16 72078989 生命值 ENSG00000257017.4 4.654e-8 0 -11071 gtex_brain_ba24
RS7197453 16 72079127 生命值 ENSG00000257017.4 2.412E-6 0 -10933 gtex_brain_ba24
RS7197869 16 72079352 生命值 ENSG00000257017.4 2.412E-6 0 -10708 gtex_brain_ba24
rs5472 16 72088467 生命值 ENSG00000257017.4 4.472E-7 0 -1593 gtex_brain_ba24
RS8062041 16 72088964 生命值 ENSG00000257017.4 2.366E-6 0 -1096 gtex_brain_ba24
RS3794695 16 72097827 生命值 ENSG00000257017.4 1.081E-7 0 7767 gtex_brain_ba24
RS34042070 16 72101525 生命值 ENSG00000257017.4 1.179E-7 0 11465 gtex_brain_ba24
RS2000999 16 72108093 生命值 ENSG00000257017.4 1.049E-7 0 18033 gtex_brain_ba24
RS2854956 16 72115238 生命值 ENSG00000257017.4 1.135E-6 0 25178 gtex_brain_ba24
RS9941087 16 72118324 生命值 ENSG00000257017.4 2.562E-6 0 28264 gtex_brain_ba24
RS397768926 16 72121552 生命值 ENSG00000257017.4 2.631E-6 0 31492 gtex_brain_ba24
RS12445586 16 72126276 生命值 ENSG00000257017.4 4.297E-6 0 36216 gtex_brain_ba24
RS1050362 16 72130815 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 40755 gtex_brain_ba24
RS34749771 16 72131740 生命值 ENSG00000257017.4 1.614E-6 0 41680 gtex_brain_ba24
RS6499559 16 72132064 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 42004 gtex_brain_ba24
RS2072142 16 72132713 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 42653 gtex_brain_ba24
RS2074627 16 72136769 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 46709 gtex_brain_ba24
RS12708928 16 72137227 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 47167 gtex_brain_ba24
rs2240243 16 72137561 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 47501 gtex_brain_ba24
rs12325142 16 72138112 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 48052 gtex_brain_ba24
RS2074626 16 72139184 生命值 ENSG00000257017.4 1.541E-6 0 49124 gtex_brain_ba24
RS2287997 16 72140553 生命值 ENSG00000257017.4 3.815e-8 0 50493 gtex_brain_ba24
RS9926156 16 72142895 生命值 ENSG00000257017.4 4.705E-6 0 52835 gtex_brain_ba24
rs2241412 16 72144284 生命值 ENSG00000257017.4 4.678E-6 0 54224 gtex_brain_ba24
RS12448315 16 72147242 生命值 ENSG00000257017.4 1.161E-6 0 57182 gtex_brain_ba24
RS6499560 16 72147666 生命值 ENSG00000257017.4 1.155E-6 0 57606 gtex_brain_ba24
RS8047377 16 72148339 生命值 ENSG00000257017.4 4.511E-6 0 58279 gtex_brain_ba24
RS12445401 16 72148419 生命值 ENSG00000257017.4 2.939E-8 0 58359 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004252 serine-type endopeptidase activity IEA 谷氨酸（GO期限：7） -
GO:0003824 催化活性 IEA -
去：0030492 血红蛋白结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006508 蛋白水解 IEA -
去：0006952 国防反应 TAS 7036344
去：0006879 细胞铁离子稳态 nas -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005576 细胞外区域 nas 14718574

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lopez间托马瘤生存时间DN 7 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bogni治疗与髓样白血病有关 30 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LOPEZ MESOTHELIOMA SURVIVAL WORST VS BEST DN 7 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bidus转移DN 161 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
hahtola sezary综合征 98 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Markey RB1急性lof 215 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK DN 39 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄端癌症 25 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
悍马皮肤癌进度DN 100 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LI LUNG CANCER 41 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Houstis Ros 36 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HSIAO LIVER SPECIFIC GENES 244 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纳德勒肥胖DN 48 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GERY CEBP TARGETS 126 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruan对TNF的反应 12 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老 262 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruan对TNF Troglitazone的反应 17 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zamora NOS2靶向DN 96 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成6 189 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞 156 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng IL22发出信号 56 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ichiba移植与宿主疾病35D DN 49 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA DN 267 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝脏发展DN 222 141 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kamikubo Myeloid Cebpa网络 28 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
STEGER ADIPOGENESIS UP 21 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vernochet脂肪形成 19 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Huang Gata2靶向 149 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway