基因页：HPRT1
Summary？
| GeneID | 3251 |
| Symbol | HPRT1 |
| 同义词 | hgprt | hprt |
| 描述 | 低黄嘌呤磷酸贝糖基转移酶1 |
| 参考 | MIM：308000|HGNC：HGNC：5157|ENSEMBL：ENSG00000165704|HPRD:02388|Vega：Otthumg0000000022452 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | Xq26.1 |
| Sherlock P值 | 0.133 |
| 胎儿β | -2.205 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| Literature | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 | |
| 网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：0.0044 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02804166 | X | 133506996 | HPRT1 | 0.014 | -4.136 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG10584819 | X | 133593670 | HPRT1 | 0.004 | -4.563 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SNP_A-1983537 | 0 | HPRT1 | 3251 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000287 | 镁离子结合 | 艾达 | 10360366 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| 去：0004422 | 低黄嘌呤磷酸贝糖基转移酶活性 | EXP | 6300847 | |
| 去：0004422 | 低黄嘌呤磷酸贝糖基转移酶活性 | 艾达 | 6300847|9521733 | |
| GO：0016757 | 反式ferase activity, transferring glycosyl groups | IEA | - | |
| GO：0042803 | 蛋白质同构化活性 | IPI | 8044844 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045964 | 多巴胺代谢过程的阳性调节 | IMP | 多巴胺（GO期限：10） | 8643611 |
| 去：0009116 | nucleoside metabolic process | IEA | - | |
| 去：0006166 | 嘌呤核糖核苷挽救 | IMP | 9824441 | |
| 去：0006164 | 嘌呤核苷酸生物合成过程 | IMP | 9824441 | |
| 去：0007610 | 行为 | IMP | 16138897 | |
| GO：0051289 | 蛋白质同质化 | 艾达 | 9521733 | |
| 去：0046100 | hypoxanthine metabolic process | IMP | 9824441 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去:0005829 | 细胞质 | EXP | 6300847 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | 艾达 | 6300847 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-410 | 345 | 351 | 1a | HSA-MIR-410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| miR-494 | 484 | 490 | 1a | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |