基因页：HPS1
概括？
| 基因 | 3257 |
| 象征 | HPS1 |
| 同义词 | bloc3s1 | hps |
| 描述 | HPS1，溶酶体细胞器复合物的生物发生3亚基1 |
| 参考 | MIM：604982|HGNC：HGNC：5163|ENSEMBL：ENSG00000107521|HPRD：05403|Vega：Otthumg0000000018876 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 10q23.1-Q23.3 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| 胎儿β | -0.531 |
| 主持人 | 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HPS1 | Chr10 | 100185707 | G | 一个 | NM_000195 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM：Gulsuner_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10786420 | 10 | 100193054 | HPS1 | ENSG00000107521.14 | 7.34818E-7 | 0.02 | 13630 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1886728 | 10 | 100193679 | HPS1 | ENSG00000107521.14 | 6.66499E-7 | 0.02 | 13005 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7071947 | 10 | 100200797 | HPS1 | ENSG00000107521.14 | 2.75555e-6 | 0.02 | 5887 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heidenblad Amplicon 8Q24 DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肥胖症的纳德勒高血糖 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杰克逊DNMT1靶向DN | 25 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |