基因页:Rab37
概括?
基因 | 326624 |
象征 | Rab37 |
同义词 | - |
描述 | Rab37,Ras Oncogene家族成员 |
参考 | MIM:609956|HGNC:HGNC:30268|Ensembl:ENSG00000172794|HPRD:06702|Vega:Otthumg00000134282 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q25.1 |
Pascal P值 | 0.988 |
Sherlock P值 | 0.758 |
胎儿beta | -1.285 |
DMG | 1(#研究) |
耶和华 | 小脑半球 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMANNRC G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 与精神分裂症相关的157个SNP | 1 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10512597 | 17 | 72699833 | 无效的 | 1.562 | Rab37 | 无效的 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG09852601 | 17 | 72732955 | Rab37 | 1.53E-5 | -0.55 | 0.015 | DMG:Wockner_2014 |
CG01944585 | 17 | 72732912 | Rab37 | 3.196E-4 | -0.66 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | Rab37 | 326624 | 1.153E-4 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | Rab37 | 326624 | 0.01 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | Rab37 | 326624 | 0 | 反式 | ||
RS11139334 | CHR9 | 84209393 | Rab37 | 326624 | 0.09 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | Rab37 | 326624 | 1.084e-10 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | Rab37 | 326624 | 0.01 | 反式 | ||
RS10854345 | CHR21 | 32838534 | Rab37 | 326624 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RAB37_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSADA ASCL1靶向 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27Me3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |