概括
基因 326624
象征 Rab37
同义词 -
描述 Rab37,Ras Oncogene家族成员
参考 MIM:609956|HGNC:HGNC:30268|Ensembl:ENSG00000172794|HPRD:06702|Vega:Otthumg00000134282
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q25.1
Pascal P值 0.988
Sherlock P值 0.758
胎儿beta -1.285
DMG 1(#研究)
耶和华 小脑半球
小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMANNRC
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 与精神分裂症相关的157个SNP 1
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS10512597 17 72699833 无效的 1.562 Rab37 无效的

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09852601 17 72732955 Rab37 1.53E-5 -0.55 0.015 DMG:Wockner_2014
CG01944585 17 72732912 Rab37 3.196E-4 -0.66 0.04 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 Rab37 326624 1.153E-4 反式
RS3845734 CHR2 171125572 Rab37 326624 0.01 反式
RS7584986 CHR2 184111432 Rab37 326624 0 反式
RS11139334 CHR9 84209393 Rab37 326624 0.09 反式
RS16955618 CHR15 29937543 Rab37 326624 1.084e-10 反式
RS1041786 CHR21 22617710 Rab37 326624 0.01 反式
RS10854345 CHR21 32838534 Rab37 326624 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27Me3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因