概括
基因 3270
象征 HRC
同义词 -
描述 富含组氨酸的钙结合蛋白
参考 MIM:142705|HGNC:HGNC:5178|Ensembl:ENSG00000130528|HPRD:00818|Vega:Otthumg00000183203
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.029
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 HRC 3270 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CNDP1 0.82 0.76
synj2 0.82 0.64
Prune2 0.81 0.79
LGI3 0.79 0.85
endod1 0.78 0.72
Gldn 0.78 0.78
SYT2 0.78 0.53
SEC14L5 0.78 0.82
ERMP1 0.78 0.67
VAMP1 0.77 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TBC1D10A -0.44 -0.49
OLFM2 -0.41 -0.47
WDR86 -0.41 -0.49
Bcl7c -0.40 -0.66
nkiras2 -0.39 -0.52
SH3BP2 -0.39 -0.69
SH2B2 -0.39 -0.72
MMP25 -0.39 -0.58
KIAA1949 -0.38 -0.62
tubb2b -0.38 -0.67

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod的目标 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因