基因页:HRC
概括?
基因 | 3270 |
象征 | HRC |
同义词 | - |
描述 | 富含组氨酸的钙结合蛋白 |
参考 | MIM:142705|HGNC:HGNC:5178|Ensembl:ENSG00000130528|HPRD:00818|Vega:Otthumg00000183203 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 0.029 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | HRC | 3270 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CNDP1 | 0.82 | 0.76 |
synj2 | 0.82 | 0.64 |
Prune2 | 0.81 | 0.79 |
LGI3 | 0.79 | 0.85 |
endod1 | 0.78 | 0.72 |
Gldn | 0.78 | 0.78 |
SYT2 | 0.78 | 0.53 |
SEC14L5 | 0.78 | 0.82 |
ERMP1 | 0.78 | 0.67 |
VAMP1 | 0.77 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TBC1D10A | -0.44 | -0.49 |
OLFM2 | -0.41 | -0.47 |
WDR86 | -0.41 | -0.49 |
Bcl7c | -0.40 | -0.66 |
nkiras2 | -0.39 | -0.52 |
SH3BP2 | -0.39 | -0.69 |
SH2B2 | -0.39 | -0.72 |
MMP25 | -0.39 | -0.58 |
KIAA1949 | -0.38 | -0.62 |
tubb2b | -0.38 | -0.67 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod的目标 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |