基因页：HSD11B1
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| 基因 | 3290 |
| 象征 | HSD11B1 |
| 同义词 | 11-DH|11-beta-HSD1|CORTRD2|HDL|HSD11|HSD11B|HSD11L|SDR26C1 |
| 描述 | 羟基固醇（11-β）脱氢酶1 |
| Reference | MIM：600713|HGNC：HGNC：5208|Ensembl：ENSG00000117594|HPRD：07042|Vega:OTTHUMG00000036481 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32-Q41 |
| 胎儿β | -1.333 |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4120839 | CHR1 | 181816818 | HSD11B1 | 3290 | 0.02 | 反式 | ||
| rs2275869 | CHR1 | 205274605 | HSD11B1 | 3290 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | HSD11B1 | 3290 | 0.02 | 反式 | ||
| SNP_A-1919794 | 0 | HSD11B1 | 3290 | 0.08 | 反式 | |||
| RS12622326 | CHR2 | 7894385 | HSD11B1 | 3290 | 0.19 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | HSD11B1 | 3290 | 5.021E-7 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | HSD11B1 | 3290 | 6.216E-6 | 反式 | ||
| rs17008051 | CHR3 | 70998485 | HSD11B1 | 3290 | 0 | 反式 | ||
| RS13439821 | CHR8 | 116213885 | HSD11B1 | 3290 | 0.07 | 反式 | ||
| RS16887186 | CHR8 | 116231703 | HSD11B1 | 3290 | 0.05 | 反式 | ||
| RS990438 | CHR15 | 24322236 | HSD11B1 | 3290 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | HSD11B1 | 3290 | 2.235E-9 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DNAJB1 | 0.95 | 0.57 |
| HSPA1A | 0.94 | 0.56 |
| HSPA1B | 0.91 | 0.62 |
| G0S2 | 0.82 | 0.29 |
| Bag3 | 0.82 | 0.26 |
| AL031847.1 | 0.71 | 0.12 |
| ACRC | 0.66 | 0.07 |
| DNAJB4 | 0.59 | 0.04 |
| HSPB1 | 0.57 | 0.25 |
| C1orf51 | 0.56 | 0.21 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FOXS1 | -0.24 | 0.10 |
| SLC5A6 | -0.23 | 0.16 |
| WDR81 | -0.23 | 0.10 |
| ARHGEF15 | -0.22 | 0.07 |
| CD34 | -0.22 | -0.03 |
| ACVRL1 | -0.22 | 0.08 |
| DNM2 | -0.22 | 0.17 |
| IFNAR2 | -0.21 | 0.18 |
| mylk2 | -0.21 | -0.00 |
| SLC38A5 | -0.21 | 0.11 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003845 | 11β-羟基甾体脱氢酶活性 | 经验 | 1885595 | |
| 去：0003845 | 11β-羟基甾体脱氢酶活性 | IEA | - | |
| 去：0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
| GO：0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006694 | steroid biosynthetic process | 经验 | 15583024 | |
| 去：0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0030324 | 肺发展 | IEA | - | |
| GO：0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005789 | 内质网膜 | 经验 | 1885595 | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| 去：0016020 | membrane | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-326 | 98 | 105 | 1A，M8 | hsa-miR-326 | CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG |