概括?
基因 330
Symbol BIRC3
同义词 aip1 | api2 | ciap2 | haip1 | hiap1 | malt2 | mihc | rnf49 | c-iap2
描述 baculoviral IAP repeat containing 3
参考 MIM:601721|HGNC:HGNC:591|Ensembl:ENSG00000023445|HPRD:03426|Vega:OTTHUMG00000167324
基因type protein-coding
地图位置 11q22
Pascal P值 0.551
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 Genome-wide DNA methylation analysis 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统ematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
CG20346726 11 101918403 BIRC3 0.004 6.993 DMG:Vaneijk_2014
CG19531130 11 101786659 BIRC3 0.005 5.369 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs11979332 chr7 86581744 BIRC3 330 0.19 trans
rs11219646 Chr11 124279239 BIRC3 330 0.13 trans
rs17342476 chrX 102243644 BIRC3 330 0.07 trans
rs17342504 chrX 102272107 BIRC3 330 0.07 trans
SNP_A-2138851 0 BIRC3 330 0.07 trans
SNP_A-2059928 0 BIRC3 330 0.07 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TUBB4 0.90 0.91
RANGAP1 0.88 0.88
PNPLA6 0.86 0.86
ATP6AP1 0.85 0.86
IGSF8 0.85 0.84
DCTN1 0.84 0.87
git1 0.84 0.84
SEZ6L2 0.83 0.86
man2b2 0.83 0.85
CACNB1 0.83 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.58 -0.42
AP002478.3 -0.55 -0.51
C1orf54 -0.52 -0.44
AF347015.18 -0.52 -0.39
GNG11 -0.51 -0.43
NSBP1 -0.50 -0.48
MT-CO2 -0.50 -0.37
Sycp3 -0.50 -0.51
AL050337.1 -0.50 -0.45
AF347015.8 -0.49 -0.36

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
casp3 CPP32 | CPP32B | SCA-1 caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 CIAP2对CASP3表现出E3泛素连接酶的活性。 BIND 10862606
casp3 CPP32 | CPP32B | SCA-1 caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 9384571
CASP7 CMH-1 |ICE-LAP3 |MCH3 caspase 7,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 9384571
CASP7 CMH-1 |ICE-LAP3 |MCH3 caspase 7,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 cIAP2 exhibits E3 ubiquitin ligase activity towards Casp7. BIND 10862606
CASP9 APAF-3 |apaf3 |caspase-9c |ICE-LAP6 |MCH6 caspase 9,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 9545235
CHUK IKBKA | IKK-alpha | IKK1 | IKKA | NFKBIKA | TCF16 conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase CIAP-2启动子与IKK-Alpha相互作用。 BIND 15494311
暗黑破坏神 暗黑破坏神|FLJ10537 |FLJ25049 |smac |SMAC3 diablo homolog (Drosophila) - HPRD,Biogrid 10929712
EP300 KAT3B | p300 E1a结合蛋白p300 The cIAP-2 promoter interacts with p300. BIND 15494311
GSPT1 551G9.2 | ETF3A | FLJ38048 | FLJ39067 | GST1 | eRF3a G1到S相变1 - HPRD 12865429
HDAC3 HD3 | RPD3 | RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 CIAP-2启动子与HDAC3相互作用。 BIND 15494311
Hist3H3 H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 histone cluster 3, H3 The cIAP-2 promoter interacts with phosphorylated and/or acetylated H3. BIND 15494311
htra2 omi |Park13 |PRSS25 HTRA丝氨酸肽酶2 Reconstituted Complex BioGRID 12865429
IKBKB FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 CIAP-2启动子与IKK-beta相互作用。 BIND 15494311
NCOR2 CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 nuclear receptor co-repressor 2 The cIAP-2 promoter interacts with SMRT. BIND 15494311
NFKB1 DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 | p105 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 The cIAP-2 promoter interacts with p50. BIND 15494311
Rela MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) The cIAP-2 promoter interacts with p65. BIND 15494311
RIPK2 card3 |Cardiak |CCK |gig30 |里克|RIP2 receptor-interacting serine-threonine kinase 2 Affinity Capture-Western BioGRID 9705938
TP73 p73 tumor protein p73 p73-alpha binds p53 AIP1 promoter. BIND 15175157
TRAF1 EBI6 | MGC:10353 TNF受体相关因子1 - HPRD,Biogrid 11907583
TRAF1 EBI6 | MGC:10353 TNF受体相关因子1 c-IAP2 interacts with TRAF1. BIND 11907583
TRAF2 MGC:45012 | TRAP | TRAP3 TNF受体相关因子2 - HPRD 8643514|11907583
TRAF2 MGC:45012 | TRAP | TRAP3 TNF受体相关因子2 in vitro
Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 8643514|9384571
|11907583
TRAF2 MGC:45012 | TRAP | TRAP3 TNF受体相关因子2 c-IAP2 interacts with TRAF2. BIND 11907583
UBE2D1 E2(17)KB1 |sft |UBC4/5 |ubch5 |ubch5a 泛素结合酶E2d 1(UBC4/5同源物,酵母) The cIAP-2 promoter interacts with Ubc5. BIND 15494311
是的 14-3-3e |FLJ45465 |KCIP-1 |MDCR |MDS tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, epsilon polypeptide The cIAP-2 promoter interacts with 14-3-3-epsilon. BIND 15494311


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NOD LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小细胞肺癌 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta caspase途径 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HIVNEF PATHWAY 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔死亡道路 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔线粒体途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SODD PATHWAY 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST肿瘤坏死因子途径 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA级联级联 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD40途径 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAS PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF通路 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CERAMIDE PATHWAY 48 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB PATHWAY 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIV NEF途径 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CASPASE PATHWAY 52 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nod1 2信号通路 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN LEUCINE RICH REPEAT CONTAINING RECEPTOR NLR SIGNALING PATHWAYS 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不良DN 60 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS UP 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML划分与正常静止DN 95 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN 75 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET CULTURED OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP UP 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi NFKB1目标 19 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE 49 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYLLYKANGAS AMPLIFICATION HOT SPOT 23 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应早期 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SNIJDERS AMPLIFIED IN HEAD AND NECK TUMORS 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对电离RADIATIO蔡回应N 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori未成熟B淋巴细胞向上 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KLEIN PRIMARY EFFUSION LYMPHOMA DN 58 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANNAN TP53 TARGETS DN 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wong IFNA2抵抗 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING UP 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STOSSI RESPONSE TO ESTRADIOL 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乔治塔斯HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA DN的响应 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS UP 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向DN 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALI TP53 TARGETS APOPTOTIC UP 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHO NR4A1目标 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VILIMAS NOTCH1 TARGETS UP 52 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION B 53 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V1后期分化基因上升 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schoen NFKB信号 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOUSHMEHR GBM SILENCED BY METHYLATION 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA VIA KDM3A 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF TARGETS UP 63 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTLES LEUKEMIC STEM CELL UP 29 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI DIRECT IRRADIATION UP 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因