基因页:BIRC3
概括?
基因 | 330 |
Symbol | BIRC3 |
同义词 | aip1 | api2 | ciap2 | haip1 | hiap1 | malt2 | mihc | rnf49 | c-iap2 |
描述 | baculoviral IAP repeat containing 3 |
参考 | MIM:601721|HGNC:HGNC:591|Ensembl:ENSG00000023445|HPRD:03426|Vega:OTTHUMG00000167324 |
基因type | protein-coding |
地图位置 | 11q22 |
Pascal P值 | 0.551 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | 系统ematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | Chromosome | Position | 最近的基因 | P (dis) | beta(dis) | FDR (dis) | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20346726 | 11 | 101918403 | BIRC3 | 0.004 | 6.993 | DMG:Vaneijk_2014 | |
CG19531130 | 11 | 101786659 | BIRC3 | 0.005 | 5.369 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs11979332 | chr7 | 86581744 | BIRC3 | 330 | 0.19 | trans | ||
rs11219646 | Chr11 | 124279239 | BIRC3 | 330 | 0.13 | trans | ||
rs17342476 | chrX | 102243644 | BIRC3 | 330 | 0.07 | trans | ||
rs17342504 | chrX | 102272107 | BIRC3 | 330 | 0.07 | trans | ||
SNP_A-2138851 | 0 | BIRC3 | 330 | 0.07 | trans | |||
SNP_A-2059928 | 0 | BIRC3 | 330 | 0.07 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BIRC3_DE_GTEx.png)
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TUBB4 | 0.90 | 0.91 |
RANGAP1 | 0.88 | 0.88 |
PNPLA6 | 0.86 | 0.86 |
ATP6AP1 | 0.85 | 0.86 |
IGSF8 | 0.85 | 0.84 |
DCTN1 | 0.84 | 0.87 |
git1 | 0.84 | 0.84 |
SEZ6L2 | 0.83 | 0.86 |
man2b2 | 0.83 | 0.85 |
CACNB1 | 0.83 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.58 | -0.42 |
AP002478.3 | -0.55 | -0.51 |
C1orf54 | -0.52 | -0.44 |
AF347015.18 | -0.52 | -0.39 |
GNG11 | -0.51 | -0.43 |
NSBP1 | -0.50 | -0.48 |
MT-CO2 | -0.50 | -0.37 |
Sycp3 | -0.50 | -0.51 |
AL050337.1 | -0.50 | -0.45 |
AF347015.8 | -0.49 | -0.36 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
casp3 | CPP32 | CPP32B | SCA-1 | caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | CIAP2对CASP3表现出E3泛素连接酶的活性。 | BIND | 10862606 |
casp3 | CPP32 | CPP32B | SCA-1 | caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 9384571 |
CASP7 | CMH-1 |ICE-LAP3 |MCH3 | caspase 7,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 9384571 |
CASP7 | CMH-1 |ICE-LAP3 |MCH3 | caspase 7,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | cIAP2 exhibits E3 ubiquitin ligase activity towards Casp7. | BIND | 10862606 |
CASP9 | APAF-3 |apaf3 |caspase-9c |ICE-LAP6 |MCH6 | caspase 9,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 9545235 |
CHUK | IKBKA | IKK-alpha | IKK1 | IKKA | NFKBIKA | TCF16 | conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase | CIAP-2启动子与IKK-Alpha相互作用。 | BIND | 15494311 |
暗黑破坏神 | 暗黑破坏神|FLJ10537 |FLJ25049 |smac |SMAC3 | diablo homolog (Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 10929712 |
EP300 | KAT3B | p300 | E1a结合蛋白p300 | The cIAP-2 promoter interacts with p300. | BIND | 15494311 |
GSPT1 | 551G9.2 | ETF3A | FLJ38048 | FLJ39067 | GST1 | eRF3a | G1到S相变1 | - | HPRD | 12865429 |
HDAC3 | HD3 | RPD3 | RPD3-2 | 组蛋白脱乙酰基酶3 | CIAP-2启动子与HDAC3相互作用。 | BIND | 15494311 |
Hist3H3 | H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 | histone cluster 3, H3 | The cIAP-2 promoter interacts with phosphorylated and/or acetylated H3. | BIND | 15494311 |
htra2 | omi |Park13 |PRSS25 | HTRA丝氨酸肽酶2 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12865429 |
IKBKB | FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb | B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | CIAP-2启动子与IKK-beta相互作用。 | BIND | 15494311 |
NCOR2 | CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 | nuclear receptor co-repressor 2 | The cIAP-2 promoter interacts with SMRT. | BIND | 15494311 |
NFKB1 | DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 | p105 | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 | The cIAP-2 promoter interacts with p50. | BIND | 15494311 |
Rela | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) | The cIAP-2 promoter interacts with p65. | BIND | 15494311 |
RIPK2 | card3 |Cardiak |CCK |gig30 |里克|RIP2 | receptor-interacting serine-threonine kinase 2 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 9705938 |
TP73 | p73 | tumor protein p73 | p73-alpha binds p53 AIP1 promoter. | BIND | 15175157 |
TRAF1 | EBI6 | MGC:10353 | TNF受体相关因子1 | - | HPRD,Biogrid | 11907583 |
TRAF1 | EBI6 | MGC:10353 | TNF受体相关因子1 | c-IAP2 interacts with TRAF1. | BIND | 11907583 |
TRAF2 | MGC:45012 | TRAP | TRAP3 | TNF受体相关因子2 | - | HPRD | 8643514|11907583 |
TRAF2 | MGC:45012 | TRAP | TRAP3 | TNF受体相关因子2 | in vitro Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 8643514|9384571 |11907583 |
TRAF2 | MGC:45012 | TRAP | TRAP3 | TNF受体相关因子2 | c-IAP2 interacts with TRAF2. | BIND | 11907583 |
UBE2D1 | E2(17)KB1 |sft |UBC4/5 |ubch5 |ubch5a | 泛素结合酶E2d 1(UBC4/5同源物,酵母) | The cIAP-2 promoter interacts with Ubc5. | BIND | 15494311 |
是的 | 14-3-3e |FLJ45465 |KCIP-1 |MDCR |MDS | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, epsilon polypeptide | The cIAP-2 promoter interacts with 14-3-3-epsilon. | BIND | 15494311 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg凋亡 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG FOCAL ADHESION | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG NOD LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PATHWAYS IN CANCER | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta caspase途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA HIVNEF PATHWAY | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔死亡道路 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔线粒体途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA SODD PATHWAY | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST肿瘤坏死因子途径 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SA级联级联 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD40途径 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAS PATHWAY | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TNF通路 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CERAMIDE PATHWAY | 48 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P75 NTR PATHWAY | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB PATHWAY | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HIV NEF途径 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CASPASE PATHWAY | 52 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Nod1 2信号通路 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN LEUCINE RICH REPEAT CONTAINING RECEPTOR NLR SIGNALING PATHWAYS | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不良DN | 60 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HORIUCHI WTAP TARGETS UP | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗 | 78 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SENESE HDAC1 TARGETS UP | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML划分与正常静止DN | 95 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN | 75 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲基化调节的米西亚利亚 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET CULTURED OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP UP | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射2的响应2 | 127 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi NFKB1目标 | 19 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYLLYKANGAS AMPLIFICATION HOT SPOT 23 | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应早期 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SNIJDERS AMPLIFIED IN HEAD AND NECK TUMORS | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对电离RADIATIO蔡回应N | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞向上 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KLEIN PRIMARY EFFUSION LYMPHOMA DN | 58 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KANNAN TP53 TARGETS DN | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wong IFNA2抵抗 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANA TNF SIGNALING UP | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STOSSI RESPONSE TO ESTRADIOL | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乔治塔斯HSC标记 | 71 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA DN的响应 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DOUGLAS BMI1 TARGETS DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HELLER HDAC TARGETS UP | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSADA ASCL1靶向DN | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌萧述三腔的DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GALI TP53 TARGETS APOPTOTIC UP | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHO NR4A1目标 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VILIMAS NOTCH1 TARGETS UP | 52 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION B | 53 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V1后期分化基因上升 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schoen NFKB信号 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG BOUND BY MYC | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NOUSHMEHR GBM SILENCED BY METHYLATION | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIEG HYPOXIA VIA KDM3A | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PHONG TNF TARGETS UP | 63 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GENTLES LEUKEMIC STEM CELL UP | 29 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GHANDHI DIRECT IRRADIATION UP | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION UP | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |