Gene Page:HSPA1B

概括?
基因 3304
象征 HSPA1B
Synonyms HSP70-1B|HSP70-2|HSP70.2
Description 热休克蛋白家族A（HSP70）成员1B
Reference MIM:603012|HGNC:HGNC:5233|Ensembl:ENSG00000204388|HPRD:06784|Vega:OTTHUMG00000031202
Gene type protein-coding
Map location 6p21.3
Pascal p-value 1E-12
Fetal beta -0.082
DMG 1 (# studies)
eGene Nucleus accumbens basal ganglia
Myers' cis & trans
Support G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2CDB.HUMANNRC

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) Beta (dis) FDR (dis) Study
cg27021666 6 31794278 HSPA1B 5.627E-4 0.212 0.049 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs1879328 chr3 46568156 HSPA1B 3304 0.08 trans
rs10842557 0 HSPA1B 3304 0.19 trans
rs35452 chr12 115539199 HSPA1B 3304 0.06 trans
rs8013289 chr14 50727009 HSPA1B 3304 0.17 trans
rs12433794 chr14 50786003 HSPA1B 3304 0.16 trans
RS7161563 chr14 50799125 HSPA1B 3304 0.07 trans
RS16965683 chr15 38115683 HSPA1B 3304 0.03 trans
rs7183421 chr15 69456942 HSPA1B 3304 0.18 trans
rs4116076 chr15 69491466 HSPA1B 3304 0.1 trans
rs8120542 chr20 24395092 HSPA1B 3304 0.16 trans
rs8114637 chr20 24395207 HSPA1B 3304 0.16 trans
rs9974024 chr20 24397274 HSPA1B 3304 0.16 trans
rs6515493 chr20 24401635 HSPA1B 3304 0.16 trans
RS6049703 chr20 24432425 HSPA1B 3304 0.01 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 nucleotide binding IEA -
GO:0005524 ATP binding IEA -
GO:0051082 unfolded protein binding TAS 16130169
生物过程 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006402 mRNA分解代谢过程 TAS 10205060
GO:0006986 对展开蛋白的反应 TAS 10859165
GO:0006916 anti-apoptosis TAS 16130169
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 nucleus TAS 10205060
GO:0005737 细胞质 TAS 16130169
GO:0005739 mitochondrion TAS 16130169
GO:0005783 endoplasmic reticulum TAS 16130169

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG SPLICEOSOME 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ENDOCYTOSIS 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ANTIGEN PROCESSING AND PRESENTATION 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF RNA 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF MRNA STABILITY BY PROTEINS THAT BIND AU RICH ELEMENTS 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY AUF1 HNRNP D0 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤DN 104 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS E UP 97 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO PML TARGETS BOUND BY MYC DN 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK UP 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS DN 62 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多尔STAT3 DN的目标 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧的适应 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STANHILL HRAS TRANSFROMATION UP 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOYAMA SEMA3B TARGETS DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEN INTERACT WITH LCA5 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES WITH H3K27ME3 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA CENTRAL CLOCK 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ADDYA ERYTHROID DIFFERENTIATION BY HEMIN 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERY CEBP TARGETS 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB SIGNALING 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCLUNG DELTA FOSB TARGETS 2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHUANG OXIDATIVE STRESS RESPONSE UP 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫雷拉对TSA的反应 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCLUNG CREB1 TARGETS UP 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE UP 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION DN 105 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COATES MACROPHAGE M1 VS M2 DN 78 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARZEC IL2 SIGNALING UP 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGACARCINOGENESIS BY KRAS PTEN UP 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER UP 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MALONEY RESPONSE TO 17AAG UP 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2 TARGETS UP 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS UP 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌后期复发 62 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP A 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINSLEY MIR16 TARGETS 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS UP 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOUDOUKHA BOUND BY IGF2BP2 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因