概括
基因 3305
象征 HSPA1L
同义词 HSP70-1L | HSP70-HOM | HSP70T | HUM70T
描述 热休克蛋白家族A(HSP70)成员1
参考 MIM:140559|HGNC:HGNC:5234|Ensembl:ENSG00000204390|HPRD:00776|Vega:Otthumg0000000031208
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 0.323
胎儿β -0.267
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0143

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20232119 6 31778558 HSPA1L 2.588E-4 0.356 0.038 DMG:Wockner_2014
CG11485463 6 31783240 hspa1a; hspa1l 2.689E-4 -0.368 0.038 DMG:Wockner_2014
CG26097381 6 31779598 HSPA1L 2.881E-4 0.57 0.039 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000723 端粒维护 IEA -
去:0006281 DNA修复 IEA -
去:0006950 对压力的反应 IEA -
去:0006986 对展开蛋白的反应 塔斯 9685725

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg剪接体 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG抗原处理和演示 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Caffarel对THC 8HR 5 DN的响应 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEN与LCA5相互作用 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤DN 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标1 DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标2向上 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因