概括?
GeneID 3312
Symbol HSPA8
Synonyms HEL-33|HEL-S-72p|HSC54|HSC70|HSC71|HSP71|HSP73|HSPA10|LAP-1|LAP1|NIP71
Description heat shock protein family A (Hsp70) member 8
Reference MIM:600816|HGNC:HGNC:5241|Ensembl:ENSG00000109971|HPRD:07205|Vega:OTTHUMG00000166030
基因类型 protein-coding
地图位置 11q24.1
Pascal p-value 0.009
Sherlock P值 0.831
TADA p-value 0.001
Fetal beta 1.299
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 RNA AND PROTEIN SYNTHESIS
CompositeSet

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DNM:Fromer_2014 Whole Exome Sequencing analysis This study reported a WES study of 623 schizophrenia trios, reporting DNMs using genomic DNA.
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
Expression 基因表达的荟萃分析 Pvalue: 2.107
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

Gene 染色体 位置 Ref Alt 成绩单 AA change Mutation type Sift CG46 特征 Study
HSPA8 chr11 122929399 A ATGCC NM_006597
NM_006597
NM_153201
p.488*>*
.
.
Indel
frameshift
intronic
精神分裂症 DNM:Fromer_2014
HSPA8 chr11 122929444 T C NM_006597
NM_153201
p.473q> r
.
错过
intronic
精神分裂症 DNM:Fromer_2014
HSPA8 chr11 122929804 G C NM_006597
NM_153201
p.429t> s
p.429t> s
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@eQTL annotation

SNP ID 染色体 位置 eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs6902183 CHR6 121963786 HSPA8 3312 0.06 反式

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0005515 protein binding IPI 10954706
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0042623 ATPase activity, coupled nas 8530083
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006457 protein folding nas 8530083
去:0006986 对展开蛋白的反应 nas 11093761
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0005622 intracellular nas 8713105
GO:0005737 cytoplasm IEA -
GO:0009986 cell surface IDA 12493773
GO:0042470 黑色素体 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors 别名B 官方全名b Experimental Source PubMed ID
ABI1 ABI-1 | E3B1 | NAP1BP | SSH3BP | SSH3BP1 abl-interactor 1 - HPRD 15048123
ALDOB - aldolase B, fructose-bisphosphate - HPRD 11241348
APOB FLDB 载脂蛋白B(包括AG(X)抗原) - HPRD 9694898
BAG1 Rap46 BCl2相关的雅典纪 - HPRD,Biogrid 9305631
Bag2 Bag-2 |KIAA0576 |MGC149462 |DJ417I1.2 BCl2相关的雌马2 - HPRD,Biogrid 9873016
Bag3 Bag-3 |bis |Cair-1 |MGC104307 BCl2相关的雌马3 - HPRD,Biogrid 9873016
Bag4 BAG-4 | SODD BCl2相关的雅典纪4 Reconstituted Complex BioGRID 11909948
BRCA1 Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 breast cancer 1, early onset 两个杂交 BioGRID 9738006
C4orf14 MGC3232 | hAtNOS1 | mAtNOS1 chromosome 4 open reading frame 14 两个杂交 BioGRID 16169070
CCT3 CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 chaperonin containing TCP1, subunit 3 (gamma) - HPRD 10635329
CFTR ABC35 | ABCC7 | CF | CFTR/MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (ATP-binding cassette sub-family C, member 7) Affinity Capture-Western BioGRID 10075921
CITED1 MSG1 CBP/P300相互作用的反式激活器,与GLU/ASP富含羧基末端结构域,1 - HPRD,Biogrid 10722728
clta LCA clathrin, light chain (Lca) - HPRD 1975516
CYCS CYC | HCS 细胞色素C,体细胞 - HPRD,Biogrid 8663341
DNAJA1 DJ-2 | DjA1 | HDJ2 | HSDJ | HSJ2 | HSPF4 | hDJ-2 DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员1 - HPRD,Biogrid 10075921
DNAJA3 FLJ45758 | TID1 | hTid-1 DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员3 - HPRD,Biogrid 11679576|14993262
DNAJB1 HSPF1 | Hdj1 | Hsp40 | Sis1 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 Reconstituted Complex BioGRID 10075921
DNAJB1 HSPF1 | Hdj1 | Hsp40 | Sis1 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 Hsp40 interacts with the carboxy-terminal region of Hsc70. 绑定 10330192
DNAJC2 MPHOSPH11 | MPP11 | ZRF1 | ZUO1 DNAJ(HSP40)同源物,亚家族C,成员2 MPP11与HSC70的未指定同工型相互作用。 绑定 15802566
DNAJC3 HP58 | P58 | P58IPK | PRKRI DNAJ(HSP40)同源物,亚家族C,成员3 Affinity Capture-Western BioGRID 11116152
ERH DROER | FLJ27340 enhancer of rudimentary homolog (Drosophila) 两个杂交 BioGRID 16169070
FANCC FA3 |FAC |FACC |FLJ14675 Fanconi贫血,互补组C 两个杂交 BioGRID 14499622
FBP1 FBP 果糖1,6-磷酸酶1 两个杂交 BioGRID 16169070
加克 FLJ16629 | FLJ40395 | MGC99654 cyclin G associated kinase - HPRD 10625686
GOT2 FLJ40994 | KAT4 | KATIV | mitAAT 谷氨酸 - 奥氧乙酰氨基激酶2,线粒体(天冬氨酸氨基转移酶2) - HPRD,Biogrid 7559589
HCFC1 CFF | HCF-1 | HCF1 | HFC1 | MGC70925 | VCAF 宿主细胞因子C1(VP16-辅助蛋白) 亲和力捕获ms BioGRID 12670868
HDAC3 HD3 |RPD3 |RPD3-2 histone deacetylase 3 - HPRD,Biogrid 12502735
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 - HPRD,Biogrid 7639722
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 - HPRD,Biogrid 9269769
HSPBP1 - HSP70相互作用蛋白 - HPRD 9830037
HSPBP1 - HSP70相互作用蛋白 两个杂交 BioGRID 16169070|16189514
HSPH1 DKFZp686M05240 | HSP105 | HSP105A | HSP105B | KIAA0201 | NY-CO-25 heat shock 105kDa/110kDa protein 1 - HPRD 9675148
IKBKB FLJ40509 | IKK-beta | IKK2 | IKKB | MGC131801 | NFKBIKB inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta - HPRD 14743216
IKBKE IKK-i | IKKE | IKKI | KIAA0151 | MGC125294 | MGC125295 | MGC125297 B细胞,激酶Epsilon中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 - HPRD 14743216
IKBKG AMCBX1 |FIP-3 |fip3 |fip3p |ikk-gamma |IP |IP1 |IP2 |IPD2 |Nemo inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma - HPRD 14743216
JAK2 JTK10 Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) - HPRD,Biogrid 11679576
MAP3K14 ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 - HPRD 14743216
MAP3K3 MAPKKK3 |mekk3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 - HPRD 14743216
MAP3K7 tak1 |TGF1A mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 - HPRD 14743216
MAP3K7IP1 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 - HPRD 14743216
MAP3K7IP2 FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 - HPRD 14743216
NFKB1 DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 | p105 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 - HPRD 14743216
NFKB2 LYT-10 | LYT10 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100) - HPRD 14743216
NFKBIA IKBA | MAD-3 | NFKBI B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 - HPRD 14743216
NFKBIB IKBB | TRIP9 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta - HPRD 14743216
NFKBIE IKBE nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon - HPRD 14743216
POLR3D BN51T |RPC4 |RPC53 |TSBN51 polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide D, 44kDa 亲和力捕获ms BioGRID 12391170
PPID CYP-40 | CYPD | MGC33096 peptidylprolyl isomerase D - HPRD,Biogrid 15497503
PPP1CA MGC15877 | MGC1674 | PP-1A | PPP1A protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform Affinity Capture-Western BioGRID 9269769
PPP1R12B MGC131980 |MGC87886 |mypt2 protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B Affinity Capture-Western BioGRID 9269769
PPP1R15A GADD34 protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15A Affinity Capture-Western BioGRID 12724406
RB1 OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 retinoblastoma 1 - HPRD 7673249
RBX1 BA554C12.1 | MGC13357 | MGC1481 | RNF75 | ROC1 环框1 亲和力捕获ms BioGRID 12481031
rel C-Rel v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog (avian) - HPRD 2155506
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) - HPRD 14743216
relb i-Rel |艾尔 V-REL网状内皮病病毒性癌基因同源物B - HPRD 14743216
RGS2 G0S8 G蛋白信号的调节剂2,24KDA 两个杂交 BioGRID 16169070
RIPK1 FLJ39204 |RIP |RIP1 receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 1 - HPRD 14743216
RIPK2 CARD3 | CARDIAK | CCK | GIG30 | RICK | RIP2 receptor-interacting serine-threonine kinase 2 - HPRD 14743216
RIPK3 RIP3 receptor-interacting serine-threonine kinase 3 - HPRD 14743216
SP1 - Sp1 transcription factor - HPRD 10976766
STMN1 LAP18 | Lag | OP18 | PP17 | PP19 | PR22 | SMN stathmin 1/oncoprotein 18 - HPRD,Biogrid 10197448
STUB1 CHIP | HSPABP2 | NY-CO-7 | SDCCAG7 | UBOX1 stip1同源性和含有蛋白质1的U盒 - HPRD,Biogrid 10330192
STUB1 CHIP | HSPABP2 | NY-CO-7 | SDCCAG7 | UBOX1 stip1同源性和含有蛋白质1的U盒 The TPR and charged domains of CHIP interact with the carboxy-terminal region of Hsc70. 绑定 10330192
tada3l ADA3 |FLJ20221 |FLJ21329 |hada3 反式criptional adaptor 3 (NGG1 homolog, yeast)-like 两个杂交 BioGRID 16169070
坦克 i-traf |traf2 TRAF family member-associated NFKB activator - HPRD 14743216
TBK1 FLJ11330 |nak |T2K 储罐结合激酶1 - HPRD 14743216
TCERG1 CA150 |MGC133200 |taf2s 反式cription elongation regulator 1 - HPRD,Biogrid 15456888
TCP1 CCT-alpha | CCT1 | CCTa | D6S230E | TCP-1-alpha t-complex 1 Reconstituted Complex BioGRID 10075921
TM4SF1 H-L6 | L6 | M3S1 | TAAL6 反式membrane 4 L six family member 1 两个杂交 BioGRID 16169070
TNFRSF1A CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A - HPRD,Biogrid 11909948
TNFRSF1A CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A - HPRD 11909948|14743216
TNFRSF1B CD120b | TBPII | TNF-R-II | TNF-R75 | TNFBR | TNFR1B | TNFR2 | TNFR80 | p75 | p75TNFR tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B - HPRD 14743216
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 Hsc70 interacts with p53. 绑定 8940078
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 Reconstituted Complex BioGRID 11297531
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 p53与HSC70的未指定同工型相互作用。这种相互作用是在人p53和牛HSC70之间的相互作用上建模的。 绑定 9235949
TRADD HS.89862 |MGC11078 TNFRSF1A-associated via death domain - HPRD 14743216
TRAF1 EBI6 | MGC:10353 TNF receptor-associated factor 1 - HPRD 14743216
traf2 MGC:45012 | TRAP | TRAP3 TNF receptor-associated factor 2 - HPRD 14743216
TRAF6 MGC:3310 | RNF85 TNF receptor-associated factor 6 - HPRD 14743216
UBC HMG20 泛素c 两个杂交 BioGRID 16169070
ywhaq 14-3-3 | 1C5 | HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide - HPRD 15324660


V.途径注释

路径名 Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
kegg剪接体 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ENDOCYTOSIS 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ANTIGEN PROCESSING AND PRESENTATION 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3NUCLEAR PATHWAY 82 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB PATHWAY 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMISSION ACROSS CHEMICAL SYNAPSES 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEURONAL SYSTEM 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RELEASE CYCLE 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME LYSOSOME VESICLE BIOGENESIS 23 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GOLGI ASSOCIATED VESICLE BIOGENESIS 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF RNA 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA合成释放再摄取和降解 17 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PRAMOONJAGO SOX4 TARGETS DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LAIHO COLORECTAL CANCER SERRATED UP 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化的磷脂洋红色的反应 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 2HR UP 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR UP 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION UP 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANG MYB FAMILY TARGETS 29 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APPIERTO RESPONSE TO FENRETINIDE UP 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI THYROID CANCER CLUSTER 3 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI TARGETS OF PAX8 PPARG FUSION 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 DN 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALA APOPTOSIS 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC 8HR 5 DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci侵入性癌导管与小叶 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEN INTERACT WITH LCA5 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSSEN MYC TARGETS 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE DN 121 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CLOCK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZUCCHI METASTASIS UP 43 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
zamora nos2靶向 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN DN 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D5 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的肌肉DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV HIGH DOSE DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING CEREBELLUM UP 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的肌肉 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VISALA RESPONSE TO HEAT SHOCK AND AGING DN 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TGFB1 TARGETS UP 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MALONEY RESPONSE TO 17AAG UP 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克里希南·弗林(Krishnan Furin)靶向 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS UP 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G2 M 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES RAPAMYCIN SENSITIVE VIA TSC1 AND TSC2 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JUBAN SPI1和FLI1 DN的目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-142-5p 172 179 1A,M8 hsa-miR-142-5p cauaaaguagaaagcacuac
mir-33 201 207 1A HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33b Gugcauugcuguugcauugca