基因页:HSPA8
概括?
GeneID | 3312 |
Symbol | HSPA8 |
Synonyms | HEL-33|HEL-S-72p|HSC54|HSC70|HSC71|HSP71|HSP73|HSPA10|LAP-1|LAP1|NIP71 |
Description | heat shock protein family A (Hsp70) member 8 |
Reference | MIM:600816|HGNC:HGNC:5241|Ensembl:ENSG00000109971|HPRD:07205|Vega:OTTHUMG00000166030 |
基因类型 | protein-coding |
地图位置 | 11q24.1 |
Pascal p-value | 0.009 |
Sherlock P值 | 0.831 |
TADA p-value | 0.001 |
Fetal beta | 1.299 |
eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | RNA AND PROTEIN SYNTHESIS CompositeSet |
数据源中的基因
基因集名称 | Method of gene set | Description | Info |
---|---|---|---|
CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | Whole Exome Sequencing analysis | This study reported a WES study of 623 schizophrenia trios, reporting DNMs using genomic DNA. | |
PMID:cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
Expression | 基因表达的荟萃分析 | Pvalue: 2.107 | |
Literature | High-throughput literature-search | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
Gene | 染色体 | 位置 | Ref | Alt | 成绩单 | AA change | Mutation type | Sift | CG46 | 特征 | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
HSPA8 | chr11 | 122929399 | A | ATGCC | NM_006597 NM_006597 NM_153201 |
p.488*>* . . |
Indel frameshift intronic |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 | ||
HSPA8 | chr11 | 122929444 | T | C | NM_006597 NM_153201 |
p.473q> r . |
错过 intronic |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 | ||
HSPA8 | chr11 | 122929804 | G | C | NM_006597 NM_153201 |
p.429t> s p.429t> s |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
eQTL annotation
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | Gene Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6902183 | CHR6 | 121963786 | HSPA8 | 3312 | 0.06 | 反式 |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HSPA8_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 10954706 | |
GO:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0042623 | ATPase activity, coupled | nas | 8530083 | |
Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0006457 | protein folding | nas | 8530083 | |
去:0006986 | 对展开蛋白的反应 | nas | 11093761 | |
Cellular component | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0005622 | intracellular | nas | 8713105 | |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
GO:0009986 | cell surface | IDA | 12493773 | |
GO:0042470 | 黑色素体 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | 别名B | 官方全名b | Experimental | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABI1 | ABI-1 | E3B1 | NAP1BP | SSH3BP | SSH3BP1 | abl-interactor 1 | - | HPRD | 15048123 |
ALDOB | - | aldolase B, fructose-bisphosphate | - | HPRD | 11241348 |
APOB | FLDB | 载脂蛋白B(包括AG(X)抗原) | - | HPRD | 9694898 |
BAG1 | Rap46 | BCl2相关的雅典纪 | - | HPRD,Biogrid | 9305631 |
Bag2 | Bag-2 |KIAA0576 |MGC149462 |DJ417I1.2 | BCl2相关的雌马2 | - | HPRD,Biogrid | 9873016 |
Bag3 | Bag-3 |bis |Cair-1 |MGC104307 | BCl2相关的雌马3 | - | HPRD,Biogrid | 9873016 |
Bag4 | BAG-4 | SODD | BCl2相关的雅典纪4 | Reconstituted Complex | BioGRID | 11909948 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | breast cancer 1, early onset | 两个杂交 | BioGRID | 9738006 |
C4orf14 | MGC3232 | hAtNOS1 | mAtNOS1 | chromosome 4 open reading frame 14 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
CCT3 | CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 | chaperonin containing TCP1, subunit 3 (gamma) | - | HPRD | 10635329 |
CFTR | ABC35 | ABCC7 | CF | CFTR/MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 | cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (ATP-binding cassette sub-family C, member 7) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10075921 |
CITED1 | MSG1 | CBP/P300相互作用的反式激活器,与GLU/ASP富含羧基末端结构域,1 | - | HPRD,Biogrid | 10722728 |
clta | LCA | clathrin, light chain (Lca) | - | HPRD | 1975516 |
CYCS | CYC | HCS | 细胞色素C,体细胞 | - | HPRD,Biogrid | 8663341 |
DNAJA1 | DJ-2 | DjA1 | HDJ2 | HSDJ | HSJ2 | HSPF4 | hDJ-2 | DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员1 | - | HPRD,Biogrid | 10075921 |
DNAJA3 | FLJ45758 | TID1 | hTid-1 | DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员3 | - | HPRD,Biogrid | 11679576|14993262 |
DNAJB1 | HSPF1 | Hdj1 | Hsp40 | Sis1 | DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 10075921 |
DNAJB1 | HSPF1 | Hdj1 | Hsp40 | Sis1 | DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 | Hsp40 interacts with the carboxy-terminal region of Hsc70. | 绑定 | 10330192 |
DNAJC2 | MPHOSPH11 | MPP11 | ZRF1 | ZUO1 | DNAJ(HSP40)同源物,亚家族C,成员2 | MPP11与HSC70的未指定同工型相互作用。 | 绑定 | 15802566 |
DNAJC3 | HP58 | P58 | P58IPK | PRKRI | DNAJ(HSP40)同源物,亚家族C,成员3 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11116152 |
ERH | DROER | FLJ27340 | enhancer of rudimentary homolog (Drosophila) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
FANCC | FA3 |FAC |FACC |FLJ14675 | Fanconi贫血,互补组C | 两个杂交 | BioGRID | 14499622 |
FBP1 | FBP | 果糖1,6-磷酸酶1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
加克 | FLJ16629 | FLJ40395 | MGC99654 | cyclin G associated kinase | - | HPRD | 10625686 |
GOT2 | FLJ40994 | KAT4 | KATIV | mitAAT | 谷氨酸 - 奥氧乙酰氨基激酶2,线粒体(天冬氨酸氨基转移酶2) | - | HPRD,Biogrid | 7559589 |
HCFC1 | CFF | HCF-1 | HCF1 | HFC1 | MGC70925 | VCAF | 宿主细胞因子C1(VP16-辅助蛋白) | 亲和力捕获ms | BioGRID | 12670868 |
HDAC3 | HD3 |RPD3 |RPD3-2 | histone deacetylase 3 | - | HPRD,Biogrid | 12502735 |
HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | - | HPRD,Biogrid | 7639722 |
HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 | - | HPRD,Biogrid | 9269769 |
HSPBP1 | - | HSP70相互作用蛋白 | - | HPRD | 9830037 |
HSPBP1 | - | HSP70相互作用蛋白 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070|16189514 |
HSPH1 | DKFZp686M05240 | HSP105 | HSP105A | HSP105B | KIAA0201 | NY-CO-25 | heat shock 105kDa/110kDa protein 1 | - | HPRD | 9675148 |
IKBKB | FLJ40509 | IKK-beta | IKK2 | IKKB | MGC131801 | NFKBIKB | inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta | - | HPRD | 14743216 |
IKBKE | IKK-i | IKKE | IKKI | KIAA0151 | MGC125294 | MGC125295 | MGC125297 | B细胞,激酶Epsilon中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | - | HPRD | 14743216 |
IKBKG | AMCBX1 |FIP-3 |fip3 |fip3p |ikk-gamma |IP |IP1 |IP2 |IPD2 |Nemo | inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma | - | HPRD | 14743216 |
JAK2 | JTK10 | Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) | - | HPRD,Biogrid | 11679576 |
MAP3K14 | ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 | - | HPRD | 14743216 |
MAP3K3 | MAPKKK3 |mekk3 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 | - | HPRD | 14743216 |
MAP3K7 | tak1 |TGF1A | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 | - | HPRD | 14743216 |
MAP3K7IP1 | 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 | - | HPRD | 14743216 |
MAP3K7IP2 | FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 | - | HPRD | 14743216 |
NFKB1 | DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 | p105 | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 | - | HPRD | 14743216 |
NFKB2 | LYT-10 | LYT10 | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100) | - | HPRD | 14743216 |
NFKBIA | IKBA | MAD-3 | NFKBI | B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | - | HPRD | 14743216 |
NFKBIB | IKBB | TRIP9 | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta | - | HPRD | 14743216 |
NFKBIE | IKBE | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon | - | HPRD | 14743216 |
POLR3D | BN51T |RPC4 |RPC53 |TSBN51 | polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide D, 44kDa | 亲和力捕获ms | BioGRID | 12391170 |
PPID | CYP-40 | CYPD | MGC33096 | peptidylprolyl isomerase D | - | HPRD,Biogrid | 15497503 |
PPP1CA | MGC15877 | MGC1674 | PP-1A | PPP1A | protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform | Affinity Capture-Western | BioGRID | 9269769 |
PPP1R12B | MGC131980 |MGC87886 |mypt2 | protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B | Affinity Capture-Western | BioGRID | 9269769 |
PPP1R15A | GADD34 | protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15A | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12724406 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 | retinoblastoma 1 | - | HPRD | 7673249 |
RBX1 | BA554C12.1 | MGC13357 | MGC1481 | RNF75 | ROC1 | 环框1 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 12481031 |
rel | C-Rel | v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog (avian) | - | HPRD | 2155506 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | - | HPRD | 14743216 |
relb | i-Rel |艾尔 | V-REL网状内皮病病毒性癌基因同源物B | - | HPRD | 14743216 |
RGS2 | G0S8 | G蛋白信号的调节剂2,24KDA | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
RIPK1 | FLJ39204 |RIP |RIP1 | receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 1 | - | HPRD | 14743216 |
RIPK2 | CARD3 | CARDIAK | CCK | GIG30 | RICK | RIP2 | receptor-interacting serine-threonine kinase 2 | - | HPRD | 14743216 |
RIPK3 | RIP3 | receptor-interacting serine-threonine kinase 3 | - | HPRD | 14743216 |
SP1 | - | Sp1 transcription factor | - | HPRD | 10976766 |
STMN1 | LAP18 | Lag | OP18 | PP17 | PP19 | PR22 | SMN | stathmin 1/oncoprotein 18 | - | HPRD,Biogrid | 10197448 |
STUB1 | CHIP | HSPABP2 | NY-CO-7 | SDCCAG7 | UBOX1 | stip1同源性和含有蛋白质1的U盒 | - | HPRD,Biogrid | 10330192 |
STUB1 | CHIP | HSPABP2 | NY-CO-7 | SDCCAG7 | UBOX1 | stip1同源性和含有蛋白质1的U盒 | The TPR and charged domains of CHIP interact with the carboxy-terminal region of Hsc70. | 绑定 | 10330192 |
tada3l | ADA3 |FLJ20221 |FLJ21329 |hada3 | 反式criptional adaptor 3 (NGG1 homolog, yeast)-like | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
坦克 | i-traf |traf2 | TRAF family member-associated NFKB activator | - | HPRD | 14743216 |
TBK1 | FLJ11330 |nak |T2K | 储罐结合激酶1 | - | HPRD | 14743216 |
TCERG1 | CA150 |MGC133200 |taf2s | 反式cription elongation regulator 1 | - | HPRD,Biogrid | 15456888 |
TCP1 | CCT-alpha | CCT1 | CCTa | D6S230E | TCP-1-alpha | t-complex 1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 10075921 |
TM4SF1 | H-L6 | L6 | M3S1 | TAAL6 | 反式membrane 4 L six family member 1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
TNFRSF1A | CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A | - | HPRD,Biogrid | 11909948 |
TNFRSF1A | CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A | - | HPRD | 11909948|14743216 |
TNFRSF1B | CD120b | TBPII | TNF-R-II | TNF-R75 | TNFBR | TNFR1B | TNFR2 | TNFR80 | p75 | p75TNFR | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B | - | HPRD | 14743216 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | Hsc70 interacts with p53. | 绑定 | 8940078 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | Reconstituted Complex | BioGRID | 11297531 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | p53与HSC70的未指定同工型相互作用。这种相互作用是在人p53和牛HSC70之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 9235949 |
TRADD | HS.89862 |MGC11078 | TNFRSF1A-associated via death domain | - | HPRD | 14743216 |
TRAF1 | EBI6 | MGC:10353 | TNF receptor-associated factor 1 | - | HPRD | 14743216 |
traf2 | MGC:45012 | TRAP | TRAP3 | TNF receptor-associated factor 2 | - | HPRD | 14743216 |
TRAF6 | MGC:3310 | RNF85 | TNF receptor-associated factor 6 | - | HPRD | 14743216 |
UBC | HMG20 | 泛素c | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
ywhaq | 14-3-3 | 1C5 | HS1 | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide | - | HPRD | 15324660 |
V.途径注释
路径名 | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
---|---|---|---|
kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ENDOCYTOSIS | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ANTIGEN PROCESSING AND PRESENTATION | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SMAD2 3NUCLEAR PATHWAY | 82 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB PATHWAY | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME TRANSMISSION ACROSS CHEMICAL SYNAPSES | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NEURONAL SYSTEM | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NEUROTRANSMITTER RELEASE CYCLE | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME LYSOSOME VESICLE BIOGENESIS | 23 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GOLGI ASSOCIATED VESICLE BIOGENESIS | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF MRNA | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF RNA | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GABA合成释放再摄取和降解 | 17 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIU SOX4 TARGETS DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PRAMOONJAGO SOX4 TARGETS DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LAIHO COLORECTAL CANCER SERRATED UP | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化的磷脂洋红色的反应 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 2HR UP | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR UP | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION UP | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LANG MYB FAMILY TARGETS | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APPIERTO RESPONSE TO FENRETINIDE UP | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI THYROID CANCER CLUSTER 3 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI TARGETS OF PAX8 PPARG FUSION | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 DN | 87 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ALCALA APOPTOSIS | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAFFAREL RESPONSE TO THC DN | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAFFAREL RESPONSE TO THC 8HR 5 DN | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci侵入性癌导管与小叶 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR DN | 57 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DEN INTERACT WITH LCA5 | 26 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BENPORATH ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MENSSEN MYC TARGETS | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA PERIFERAL CLOCK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZUCCHI METASTASIS UP | 43 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
zamora nos2靶向 | 69 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LU AGING BRAIN DN | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D5 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的肌肉DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GENTILE UV HIGH DOSE DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE AGING CEREBELLUM UP | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的肌肉 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VISALA RESPONSE TO HEAT SHOCK AND AGING DN | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ RB1 TARGETS DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRADE COLON CANCER UP | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LABBE TGFB1 TARGETS UP | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MALONEY RESPONSE TO 17AAG UP | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克里希南·弗林(Krishnan Furin)靶向 | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MUELLER PLURINET | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JISON SICKLE CELL DISEASE DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG MYC TARGETS UP | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WHITFIELD CELL CYCLE G2 M | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WHITFIELD CELL CYCLE M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BILANGES RAPAMYCIN SENSITIVE VIA TSC1 AND TSC2 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JUBAN SPI1和FLI1 DN的目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | Target position | miRNA ID | miRNA seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR start | UTR end | Match method | |||
miR-142-5p | 172 | 179 | 1A,M8 | hsa-miR-142-5p | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-33 | 201 | 207 | 1A | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
HSA-MIR-33b | Gugcauugcuguugcauugca |