基因页：HSP90AB1
概括？
| 基因 | 3326 |
| 象征 | HSP90AB1 |
| 同义词 | D6S182 | HSP84 | HSP90B | HSPC2 | HSPCB |
| 描述 | 热休克蛋白90KDA Alpha家庭B级成员1 |
| 参考 | MIM：140572|HGNC：HGNC：5258|Ensembl：ENSG0000000096384|HPRD：06763|Vega：Otthumg0000000014761 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p12 |
| Pascal P值 | 0.281 |
| Sherlock P值 | 0.682 |
| 胎儿β | -0.54 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA g2cdb.human_synaptosom g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04433 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.3319 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12571687 | 6 | 44215362 | HSP90AB1 | 1.09E-7 | -0.01 | 2.36E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| GO：0030235 | 一氧化物合酶调节剂活性 | ISS | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO：0051082 | 展开的蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0030911 | TPR结构域结合 | ISS | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006457 | 蛋白质折叠 | IEA | - | |
| 去：0006986 | 对展开蛋白的反应 | nas | 2768249 | |
| GO：0045429 | 一氧化氮生物合成过程的阳性调节 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | nas | - | |
| GO：0042470 | 黑色素体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG抗原处理和演示 | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg点头喜欢受体信号通路 | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG前列腺癌 | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID VEGFR1 2途径 | 69 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome sema3a pak依赖性轴突排斥 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NLRP3炎性体 | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组炎症 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tomida转移 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| myllykangas放大热点15 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌簇3 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX8 PPARG融合的LUI目标 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dirmeier LMP1响应早期 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta低剂量紫外线反应通过ERCC3 XPCS DN | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori小型Bii淋巴细胞UP | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Menssen MYC目标 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SANA对IFNG DN的回应 | 85 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤 | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中岛肥大细胞 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莫雷拉对TSA的反应 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G1 | 67 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江口大脑皮层DN | 54 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马洛尼对17aag的回应 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 | 102 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 非政府组织恶性神经胶质瘤1p loh | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞SCP2 QTL Trans | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-153 | 253 | 259 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
| mir-448 | 253 | 259 | 1a | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |